| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第14-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-24页 |
| 1.1 醋栗番茄遗传多样性 | 第15-19页 |
| 1.1.1 醋栗番茄的群体结构 | 第15页 |
| 1.1.2 醋栗番茄抗生物胁迫性 | 第15-17页 |
| 1.1.3 醋栗番茄抗非生物胁迫性 | 第17-18页 |
| 1.1.4 醋栗番茄的优良园艺性状 | 第18页 |
| 1.1.5 问题与展望 | 第18-19页 |
| 1.2 SNP分子标记 | 第19-20页 |
| 1.2.1 SNP标记 | 第19-20页 |
| 1.2.2 KASPar基因分型 | 第20页 |
| 1.3 全基因组关联分析 | 第20-23页 |
| 1.3.1 全基因组关联分析的原理和优势 | 第20-21页 |
| 1.3.2 连锁不平衡分析 | 第21页 |
| 1.3.3 全基因组关联分析在植物学中的应用 | 第21-22页 |
| 1.3.4 全基因组关联分析在番茄作物中的应用 | 第22页 |
| 1.3.5 基于低倍重测序进行GWAS | 第22-23页 |
| 1.4 本研究的目的和技术路线 | 第23-24页 |
| 1.4.1 研究目的 | 第23页 |
| 1.4.2 技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 S. pimpinellifolium遗传多样性分析 | 第24-35页 |
| 2.1 材料与方法 | 第24-26页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第24页 |
| 2.1.2 栽培方法 | 第24页 |
| 2.1.3 DNA提取和基因分型 | 第24-25页 |
| 2.1.4 性状测定方法 | 第25-26页 |
| 2.1.5 数据统计与分析 | 第26页 |
| 2.2 结果与分析 | 第26-33页 |
| 2.2.1 醋栗资源材料的来源及地理分布 | 第26-27页 |
| 2.2.2 表型多样性分析 | 第27-28页 |
| 2.2.3 聚类分析 | 第28-29页 |
| 2.2.4 相关性分析 | 第29页 |
| 2.2.5 主成分分析 | 第29-33页 |
| 2.3 讨论 | 第33-35页 |
| 2.3.1 醋栗番茄的遗传多样性 | 第33-34页 |
| 2.3.2 表型和基因型聚类分析 | 第34页 |
| 2.3.3 性状相关性及主成分分析 | 第34页 |
| 2.3.4 存在的问题及应用前景 | 第34-35页 |
| 第三章 S. pimpinellifolium群体结构分析 | 第35-42页 |
| 3.1 材料与方法 | 第35-37页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第35页 |
| 3.1.2 测序样品的制备 | 第35-36页 |
| 3.1.3 全基因组重测序 | 第36页 |
| 3.1.4 SNPs的提取 | 第36页 |
| 3.1.5 SNPs注释和分类 | 第36页 |
| 3.1.6 醋栗番茄群体进化树的构建 | 第36页 |
| 3.1.7 醋栗番茄群体主成分分析 | 第36页 |
| 3.1.8 群体结构分析 | 第36-37页 |
| 3.2 结果与分析 | 第37-40页 |
| 3.2.1 全基因组SNPs的鉴定 | 第37-38页 |
| 3.2.2 醋栗番茄群体进化树分析 | 第38-39页 |
| 3.2.3 醋栗番茄群体主成分分析 | 第39页 |
| 3.2.4 醋栗番茄群体结构分析 | 第39-40页 |
| 3.3 讨论 | 第40-42页 |
| 3.3.1 SNP标记的挖掘 | 第40页 |
| 3.3.2 醋栗番茄群体结构分析 | 第40-42页 |
| 第四章 S. pimpinellifolium重要农艺性状的全基因组关联分析 | 第42-49页 |
| 4.1 材料与方法 | 第42-43页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第42页 |
| 4.1.2 重要农艺性状的鉴定 | 第42-43页 |
| 4.1.3 全基因组重测序 | 第43页 |
| 4.1.4 表型数据分析 | 第43页 |
| 4.1.5 全基因组关联分析 | 第43页 |
| 4.2 结果与分析 | 第43-48页 |
| 4.2.1 表型鉴定 | 第43-47页 |
| 4.2.2 全基因组关联分析 | 第47-48页 |
| 4.3 讨论 | 第48-49页 |
| 4.3.1 表型性状分析 | 第48页 |
| 4.3.2 全基因组关联分析 | 第48-49页 |
| 第五章 全文结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 作者简介 | 第62页 |
