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人巨噬细胞极化相关长链非编码RNA表达谱筛选及研究

摘要第3-6页
abstract第6-9页
第1章 引言第13-16页
第2章 材料与方法第16-29页
    2.1 主要试剂第16-17页
    2.2 主要仪器第17页
    2.3 健康人外周血第17页
    2.4 外周血单个核细胞(PBMC)的提取第17-18页
    2.5 免疫磁珠分选与纯化CD14~+单核细胞第18-19页
    2.6 人单核细胞来源巨噬细胞的培养及鉴定第19页
    2.7 巨噬细胞极化模型建立第19-20页
    2.8 巨噬细胞极化模型的鉴定第20-23页
        2.8.1 流式细胞术检测巨噬细胞表面分子CD86和CD206的表达第20页
        2.8.2 ELISA检测巨噬细胞培养上清液中IL-6、IL-10、IL-12、TNF-α、CCL17和CCL18的分泌第20-21页
        2.8.3 RT-PCR检测巨噬细胞极化基因CXCL10、CXCL11、Nos2、CCL17、CCL18、CCL22的表达第21-23页
    2.9 lncRNA和mRNA芯片检测第23-25页
        2.9.1 样品标记第23-24页
        2.9.2 cRNA样品片段化和芯片杂交第24-25页
        2.9.3 芯片清洗及扫描第25页
    2.10 筛选差异表达的lncRNA和mRNA第25页
    2.11 对差异表达的mRNA数据进行Pathway及GO分析第25-26页
    2.12 RT-PCR验证部分差异表达的lncRNA第26-27页
        2.12.1 lncRNA引物设计及合成第26页
        2.12.2 巨噬细胞极化模型的构建第26页
        2.12.3 细胞总RNA的提取第26页
        2.12.4 RT-PCR检测差异lncRNA表达第26-27页
    2.13 巨噬细胞重极化模型的构建第27页
    2.14 细胞转染第27页
    2.15 RT-PCR检测不同极化类型巨噬细胞中lncRNA NEAT1的表达第27页
    2.16 ELISA检测巨噬细胞培养上清液中IL-10 和IL-12 的分泌第27页
    2.17 统计学分析第27-29页
第3章 结果第29-49页
    3.1 原代巨噬细胞的培养和鉴定第29页
    3.2 M1型和M2型巨噬细胞的鉴定第29-33页
        3.2.1 极化的巨噬细胞光学显微镜下形态变化第29-30页
        3.2.2 ELISA检测巨噬细胞IL-6、IL-10、IL-12、TNF-α、CCL17和CCL18的分泌第30-31页
        3.2.3 RT-PCR检测巨噬细胞极化标志基因的表达第31-32页
        3.2.4 流式细胞术检测IFN-γ 及LPS、IL-4 刺激后的巨噬细胞CD86和CD206的表达第32-33页
    3.3 RNA质量控制第33页
    3.4 芯片实验结果第33-43页
        3.4.1 芯片杂交扫描图像第33-34页
        3.4.2 箱形图(Box-Plot)分析第34页
        3.4.3 散点图(Scatter-Plot)分析第34-35页
        3.4.4 分层群聚图(Hierarchical Clustering)分析第35页
        3.4.5 lncRNA和mRNA数据差异表达分析第35-39页
        3.4.6 差异表达mRNA的生物信息学分析第39-43页
    3.5 RT-PCR验证芯片结果第43-44页
    3.6 巨噬细胞极化表型相互转换时lncRNA NEAT1的表达变化第44-46页
    3.7 干扰lncRNA NEAT1表达有效抑制M1型巨噬细胞极化,促进M2型巨噬细胞极化第46-49页
第4章 讨论第49-52页
第5章 结论第52-53页
致谢第53-54页
参考文献第54-58页
攻读学位期间的研究成果第58-59页
综述第59-68页
    参考文献第64-68页

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