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鸭ADSL与PurH基因序列特征及表达与肌肉肌苷酸(IMP)含量的相关性分析

摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
第一篇 文献综述第14-46页
 第一章 肌苷酸及其相关酶的研究概况第14-32页
  1 肌苷酸结构与特性第14-15页
   ·肌苷酸分子结构第14页
   ·肌苷酸特性第14-15页
  2 肌苷酸的代谢第15页
   ·肌苷酸的合成第15页
   ·肌苷酸代谢过程中的酶第15页
  3 肌苷酸代谢相关的酶以及酶的基因研究第15-24页
   ·谷氨酸胺磷酸核糖焦磷酸转酰胺酶(GAPTase)第15-16页
   ·甘氨酰胺核苷酸合成酶-氨基咪唑核苷酸合成酶-甘氨酰胺核苷酸转甲酰基酶(GARS-AIRS-GART)第16-18页
   ·甲酰甘氨脒核苷酸合成酶(purL或purLQS)第18页
   ·氨基咪唑核苷酸羧化酶(purE Ⅱ或purK和purEⅠ)第18-19页
   ·氨基咪唑琥珀基氨甲酰核苷酸(SAICAR)合成酶(purC)第19页
   ·腺苷酸琥珀酸裂解酶(purB或ADSL)第19-20页
   ·氨基咪唑氨甲酰核苷酸转甲酰基酶(PurHJ)第20-24页
   ·腺嘌呤核苷酸脱氨酶(AMPD)第24页
  4 肌苷酸检测技术第24-25页
  5 IMP含量的调控第25页
  6 肌苷酸研究展望第25-27页
  参考文献第27-32页
 第二章 基因的克隆及生物信息学分析第32-46页
  1 克隆基因的几种常用方法第32-37页
   ·利用已知探针克隆基因第32页
   ·克隆未知序列的基因第32-33页
     ·随机引物法克隆未知序列基因第32页
     ·差异显示PCR(DD-PCR)第32-33页
     ·差减杂交PCR(RDA-PCR)第33页
   ·用特异抗体克隆基因第33页
   ·特异基因的功能克隆第33-34页
   ·染色体步技术第34-35页
   ·EST电子克隆及RACE技术的应用第35-37页
     ·EST电子克隆第35-36页
     ·RACE技术的原理第36-37页
       ·3’RACE的获得第36-37页
       ·5’RACE的获得第37页
  2 核酸序列分析第37-38页
   ·ORF(Open Reading Frame)分析第37-38页
   ·染色体定位第38页
   ·基因结构分析第38页
   ·基因上游调控区分析第38页
  3 蛋白质结构分析和功能预测第38-41页
   ·蛋白质氨基酸组成、分子量和等电点分析第39页
   ·疏水性分析第39页
   ·信号肽预测第39-40页
   ·跨膜区预测第40页
   ·亚细胞定位预测第40页
   ·蛋白质功能结构域分析第40-41页
   ·蛋白质多序列比对和分子系统发生分析第41页
  4 小结第41-42页
  5 本试验研究目的和意义第42-43页
  参考文献第43-46页
第二篇 实验研究第46-94页
 第三章 鸭ADSL与PurH基因编码区的克隆测序第46-58页
  1 材料与方法第46-54页
   ·材料第46-48页
     ·实验动物与样品采集第46-47页
     ·网络资源及软件第47页
     ·主要试剂及试剂盒第47页
     ·主要仪器第47页
     ·主要溶液及其配制第47-48页
       ·RNA提取试剂配制第47-48页
       ·琼脂糖电泳试剂配制第48页
   ·方法第48-54页
     ·引物设计第48-49页
     ·RT-PCR扩增目的区第49-51页
       ·肌肉组织总RNA抽提第49页
       ·RNA浓度和纯度检测第49-50页
       ·RNA完整性检测第50页
       ·第一链cDNA合成第50-51页
       ·PCR扩增ORF区第51页
       ·琼脂糖电泳检测第51页
       ·琼脂糖电泳检测第51页
     ·cDNA克隆测序第51-54页
       ·目的片断回收和纯化第51-52页
       ·快速TOP10感受态制备第52页
       ·连接反应第52页
       ·转化第52-53页
       ·菌落筛选第53页
       ·菌落PCR鉴定第53页
       ·质粒抽提第53-54页
       ·测序第54页
  2 结果与分析第54-55页
   ·鸭ADSL基因CDS区的核酸序列分析第54页
   ·鸭PurH基因CDS区的核酸序列分析第54-55页
  3 讨论第55-56页
  4 小结第56-58页
 第四章 蛋白质序列的生物信息学分析第58-72页
  1 材料与方法第58-60页
   ·材料第58页
   ·方法第58-60页
     ·蛋白质氨基酸组成、分子量和等电点分析第58页
     ·蛋白质疏水性分析第58-59页
     ·蛋白质信号肽预测第59页
     ·跨膜区预测第59页
     ·亚细胞定位预测第59页
     ·蛋白质功能位点和结构域预测第59-60页
     ·蛋白质氨基酸序列间的多重比对和分子系统发生分析第60页
  2 结果与分析第60-67页
   ·ADSL和PurH蛋白质组成、基本理化性质、疏水性和信号肽分析第60-63页
   ·鸭ADSL和PurH蛋白质功能位点、二级结构以及三级结构预测第63-66页
   ·同源性比较与系统发育树分析第66-67页
  3 讨论第67-69页
  4 小结第69-70页
  参考文献第70-72页
 第五章 鸭ADSL和PurH基因mRNA在胸肌和腿肌中的表达分析第72-82页
  1. 材料与方法第72-74页
   ·材料第72-73页
     ·试验动物第72页
     ·主要试剂第72页
     ·主要仪器第72页
     ·主要溶液及其配制第72-73页
   ·试验方法第73-74页
     ·引物设计第73页
     ·总RNA抽提第73页
     ·RNA浓度和纯度检测第73页
     ·第一链cDNA合成第73页
     ·cDNA质量检测第73-74页
     ·Real-time PCR第74页
       ·20 μl反应体系第74页
       ·反应程序第74页
       ·数据处理第74页
  2 结果与分析第74-77页
   ·ADSL基因mRNA表达量分析第74-75页
   ·PurH基因mRNA表达量分析第75-77页
  3 讨论第77-79页
   ·内参基因的选择第77页
   ·各种RT-PCR方法的比较第77-78页
   ·ADSL和PurH基因mRNA的相对表达分析第78-79页
  4 小结第79-80页
  参考文献第80-82页
 第六章 鸭肌肉肌苷酸含量的测定与分析第82-88页
  1. 材料与方法第82-83页
   ·材料与试剂第82页
   ·主要溶液配制第82页
     ·PH=7.0的50mmol/l硼酸缓冲溶液配制第82页
     ·流动相配制第82页
     ·IMP标准溶液配制第82页
   ·仪器与设备第82页
   ·样品制备第82-83页
   ·色谱分离条件第83页
  2. 结果第83-84页
  3. 讨论第84-85页
  4 小结第85-87页
  参考文献第87-88页
 第七章 鸭ADSL和PurH基因mRNA表达量与肌苷酸含量的相关性分析第88-94页
  1. 材料第88页
  2. 结果第88-89页
   ·ADSL基因mRNA表达量与肌肉IMP含量的相关性分析第88-89页
   ·PurH基因mRNA表达量与肌肉IMP含量的相关性分析第89页
  3. 讨论第89-91页
  4 小结第91-92页
  参考文献第92-94页
全文结论第94-96页
附录第96-98页
致谢第98-100页
攻读硕士期间发表的学术论文第100页

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