| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第12-22页 |
| 1.1 抗旱机制 | 第12-13页 |
| 1.2 水稻抗旱鉴定指标 | 第13-15页 |
| 1.2.1 避旱性相关指标 | 第13-14页 |
| 1.2.2 耐旱性相关指标 | 第14-15页 |
| 1.3 QTL定位标记 | 第15-19页 |
| 1.3.1 QTL定位原理及方法 | 第16-17页 |
| 1.3.2 QTL定位群体 | 第17-18页 |
| 1.3.3 影响QTL定位因素 | 第18页 |
| 1.3.4 抗旱相关的QTL定位研究进展 | 第18-19页 |
| 1.4 基因组重测序快速定位QTLs | 第19-21页 |
| 1.4.1 差异基因发掘方法 | 第19-20页 |
| 1.4.2 QTL-seq | 第20-21页 |
| 1.5 本研究目的和意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-26页 |
| 2.1 试验材料 | 第22页 |
| 2.2 田间试验 | 第22-23页 |
| 2.2.1 试验设计 | 第22-23页 |
| 2.3 性状调查及方法 | 第23-24页 |
| 2.3.1 苗高/根长（PH/RL） | 第23页 |
| 2.3.2 生理生化指标 | 第23-24页 |
| 2.3.2.1 AOC、CAT、SP、H2O2 的测定 | 第23-24页 |
| 2.3.2.2 T-SOD、POD活力的测定 | 第24页 |
| 2.3.2.3 MDA、Pro含量的测定 | 第24页 |
| 2.4 QTL定位 | 第24页 |
| 2.5 RIL群体极端株系的筛选 | 第24-25页 |
| 2.5.1 DNA的提取 | 第24-25页 |
| 2.5.2 RNA提取 | 第25页 |
| 2.5.3 基因表达分析 | 第25页 |
| 2.6 数据处理方法及软件 | 第25-26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-54页 |
| 3.1 ZS97B和IRA109 耐旱性比较 | 第26-29页 |
| 3.1.1 表型性状差异 | 第26-27页 |
| 3.1.2 生理生化性状差异 | 第27-29页 |
| 3.2 苗期耐旱QTLs定位 | 第29-54页 |
| 3.2.0 表型性状分析 | 第29-30页 |
| 3.2.1 生理生化统计分析 | 第30-33页 |
| 3.2.2 生理生化相关性分析 | 第33-35页 |
| 3.2.3 正常和胁迫处理条件下表型性状QTL定位 | 第35-40页 |
| 3.2.3.1 苗高和根长QTL定位 | 第35-39页 |
| 3.2.3.2 生理生化性状QTL定位 | 第39-40页 |
| 3.2.6 表型及生理指标在正常和胁迫处理下相对比值的QTL定位 | 第40-41页 |
| 3.2.7 RILs群体极端株系的筛选 | 第41-44页 |
| 3.2.7.1 极端株系表型统计分析 | 第41-42页 |
| 3.2.7.2 极端株系生理生化性状统计分析 | 第42-44页 |
| 3.2.8 混合池的QTL-seq | 第44-54页 |
| 3.2.8.1 混合池测序分析流程 | 第44-45页 |
| 3.2.8.2 读段修剪过滤结果 | 第45-46页 |
| 3.2.8.3 DNA水平的差异分析 | 第46页 |
| 3.2.8.4 候选区的确定 | 第46-48页 |
| 3.2.8.5 差异基因表达量分析 | 第48-52页 |
| 3.2.8.6 QTL连锁定位结果与QTL-seq定位结果比较分析 | 第52-54页 |
| 4 讨论 | 第54-62页 |
| 4.1 ZS9B与IRAT109 耐旱性差异的可能性分析 | 第54-55页 |
| 4.2 耐旱相关候选基因的确定 | 第55-56页 |
| 4.3 苗期耐旱性指标QTL定位结果的评价 | 第56-58页 |
| 4.4 极端株系耐旱性的可能性分析 | 第58-59页 |
| 4.5 利用基于SNP方法定位QTL的优势 | 第59-61页 |
| 4.6 下一步工作展望 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-70页 |
| 附录 | 第70-73页 |
| 附表I：国际水稻所营养液配方 | 第70-71页 |
| 附录I 部分实验的详细操作程序 | 第71-73页 |
| 附录I-1 | 第71页 |
| 附录I-2 | 第71-72页 |
| 附录I-3 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
