| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩略词表 | 第10-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-27页 |
| 1.1. 产电微生物 | 第12-17页 |
| 1.1.1. 微生物 | 第12页 |
| 1.1.2. 产电微生物和微生物燃料电池 | 第12-15页 |
| 1.1.3. 希瓦氏菌和地杆菌 | 第15-17页 |
| 1.2. 产电微生物的电子转移机制 | 第17-19页 |
| 1.2.1. 胞外电子转移 | 第17-18页 |
| 1.2.2. 导电菌毛与纳米导线 | 第18-19页 |
| 1.3. 四型菌毛蛋白 | 第19-25页 |
| 1.3.1. 四型菌毛系统与二型分泌系统 | 第19-20页 |
| 1.3.2. 四型菌毛的组装模型及其功能 | 第20-22页 |
| 1.3.3. 四型菌毛蛋白及其序列结构特征 | 第22-23页 |
| 1.3.4. 地杆菌属中的四型菌毛蛋白 | 第23-25页 |
| 1.4. 课题的研究内容与方案 | 第25-26页 |
| 1.4.1. 课题研究内容 | 第25-26页 |
| 1.4.2. 课题研究方案 | 第26页 |
| 1.5. 论文章节安排 | 第26-27页 |
| 第二章 菌毛蛋白的预测和识别 | 第27-43页 |
| 2.1. 四型菌毛蛋白的分类 | 第27-30页 |
| 2.1.1. 四型菌毛蛋白的分类 | 第27-28页 |
| 2.1.2. 四型菌毛蛋白的共性 | 第28-30页 |
| 2.2. 四型菌毛蛋白的预测 | 第30-39页 |
| 2.2.1. 微生物基因组的选取 | 第30-31页 |
| 2.2.2. 四型菌毛蛋白的预测方法 | 第31-33页 |
| 2.2.3. 菌毛蛋白预测结果分析 | 第33-36页 |
| 2.2.4. 菌毛蛋白聚类分析 | 第36-38页 |
| 2.2.5. T4a主菌毛蛋白的识别 | 第38-39页 |
| 2.3. 地杆菌中GSU1497同源基因挖掘 | 第39-42页 |
| 2.3.1. GSU1497的功能预测和研究进展 | 第39-40页 |
| 2.3.2. GSU1497的同源基因预测 | 第40-42页 |
| 2.4. 本章小结 | 第42-43页 |
| 第三章 地杆菌菌毛蛋白的序列与结构分析 | 第43-59页 |
| 3.1. 菌毛蛋白的线性排布分析 | 第43-44页 |
| 3.2. 菌毛蛋白多序列比对与序列特征提取 | 第44-48页 |
| 3.2.1. 常用的多序列比对工具比较 | 第44页 |
| 3.2.2. 导电菌毛蛋白多序列比对 | 第44-47页 |
| 3.2.3. GSU1497及其同源蛋白多序列比对结果 | 第47-48页 |
| 3.3. GSU1497蛋白质结构的预测分析 | 第48-58页 |
| 3.3.1. GSU1497二级结构预测分析 | 第48-50页 |
| 3.3.2. GSU1497蛋白三级结构预测分析 | 第50-54页 |
| 3.3.3. GSU1497中序列模体的识别和短菌毛的预测 | 第54-58页 |
| 3.4. 本章小结 | 第58-59页 |
| 第四章 导电菌毛蛋白进化分析 | 第59-68页 |
| 4.1. 分子系统发育分析 | 第59-60页 |
| 4.2. 地杆菌物种树的构建和分析 | 第60-64页 |
| 4.3. 四型菌毛蛋白基因树构建和分析 | 第64-67页 |
| 4.4. 本章小结 | 第67-68页 |
| 第五章 总结和展望 | 第68-71页 |
| 5.1. 论文工作总结 | 第68-69页 |
| 5.2. 展望 | 第69-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-77页 |
| 附录 | 第77-78页 |
| 作者简介 | 第78页 |