| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 引言 | 第13-24页 |
| 1.1 离子束生物技术的研究与发展 | 第13-18页 |
| 1.1.1 辐照诱变简述 | 第14页 |
| 1.1.2 离子束诱变的机理研究与发展 | 第14-16页 |
| 1.1.3 重离子束在生物学领域的研究与发展 | 第16-18页 |
| 1.2 转录组测序技术的研究 | 第18-23页 |
| 1.2.1 测序技术的发展 | 第18-21页 |
| 1.2.2 转录组测序（RNA-seq）的研究与应用 | 第21-23页 |
| 1.3 本文的研究目的与意义 | 第23-24页 |
| 2 低能N~+离子束辐照实验 | 第24-30页 |
| 2.1 实验材料 | 第24-25页 |
| 2.2 试验方法 | 第25-26页 |
| 2.2.1 新稻18的辐照处理 | 第25页 |
| 2.2.2 拟南芥材料的辐照处理 | 第25-26页 |
| 2.2.3 新稻18的培养与表型统计 | 第26页 |
| 2.2.4 拟南芥的培养与表型统计 | 第26页 |
| 2.3 结果与分析 | 第26-30页 |
| 2.3.1 新稻18材料的实验结果 | 第26-27页 |
| 2.3.2 拟南芥（Col）材料的实验结果与讨论 | 第27-30页 |
| 3 ~(12)C~(6+)重离子辐照实验 | 第30-52页 |
| 3.1 实验材料与方法 | 第30-33页 |
| 3.1.1 拟南芥材料的辐照处理 | 第30页 |
| 3.1.2 辐照后材料的培育和表型统计 | 第30页 |
| 3.1.3 材料的RNA提取 | 第30-31页 |
| 3.1.4 RNA的反转录 | 第31页 |
| 3.1.5 材料的RNA-seq及数据分析 | 第31-33页 |
| 3.1.6 差异表达基因的Q-PCR验证 | 第33页 |
| 3.1.7 实验数据的分析 | 第33页 |
| 3.2 辐照后材料的培育和表型统计 | 第33-36页 |
| 3.3 RNA-seq测序以及结果与分析 | 第36-52页 |
| 3.3.1 测序样品的编号与准备 | 第36-37页 |
| 3.3.2 原始数据的过滤 | 第37-38页 |
| 3.3.3 测序数据与参考基因组的比对 | 第38-39页 |
| 3.3.4 新转录本的预测与基因表达量分析 | 第39-43页 |
| 3.3.5 差异表达基因的检测 | 第43-44页 |
| 3.3.6 差异表达基因的q-PCR验证 | 第44-46页 |
| 3.3.7 Z100S与Z100H的差异表达分析 | 第46-52页 |
| 4 总结 | 第52-56页 |
| 4.1 低能离子束与重离子束注入植物材料的结果讨论 | 第52页 |
| 4.2 RNA-seq测序的结果讨论 | 第52-55页 |
| 4.3 100Gy辐照材料的新表型产生原因的推测 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-65页 |
| 致谢 | 第65页 |