| 附件 | 第3-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-21页 |
| 1.1 全基因组关联分析 | 第14-18页 |
| 1.1.1 全基因组关联分析的提出和概念 | 第14页 |
| 1.1.2 全基因组关联分析的优势 | 第14-15页 |
| 1.1.3 全基因组关联分析的基础 | 第15-16页 |
| 1.1.4 影响全基因组关联分析准确性的因素 | 第16-17页 |
| 1.1.5 全基因组关联分析应用进展 | 第17-18页 |
| 1.2 耳性状基因定位研究进展 | 第18-19页 |
| 1.2.1 人类耳性状基因定位研究进展 | 第18页 |
| 1.2.2 犬耳性状基因定位研究进展 | 第18-19页 |
| 1.2.3 猪耳性状基因定位研究进展 | 第19页 |
| 1.3 本研究的目的及意义 | 第19-21页 |
| 第二章 猪耳型性状全基因组关联分析 | 第21-37页 |
| 2.1 试验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第21-22页 |
| 2.1.2 仪器设备、主要试剂及溶液的配制 | 第22-23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-28页 |
| 2.2.1 技术路线 | 第23页 |
| 2.2.2 耳样采集及表型测定 | 第23-24页 |
| 2.2.3 基因组DNA的提取与检测 | 第24-25页 |
| 2.2.4 SNP基因型的判定 | 第25页 |
| 2.2.5 芯片数据质量控制 | 第25-26页 |
| 2.2.6 统计分析 | 第26-27页 |
| 2.2.7 标记辅助分离分析 | 第27页 |
| 2.2.8 IBD分析 | 第27-28页 |
| 2.2.9 单倍型分析 | 第28页 |
| 2.2.10 基因注释及候选基因筛选 | 第28页 |
| 2.3 试验结果 | 第28-34页 |
| 2.3.1 质量控制 | 第28-29页 |
| 2.3.2 全基因组关联分析 | 第29-31页 |
| 2.3.3 群体分层 | 第31页 |
| 2.3.4 标记辅助分离分析 | 第31-32页 |
| 2.3.5 IBD分析 | 第32-33页 |
| 2.3.6 单倍型分析 | 第33-34页 |
| 2.4 讨论 | 第34-37页 |
| 2.4.1 全基因组关联分析 | 第34-35页 |
| 2.4.2 精细定位 | 第35页 |
| 2.4.3 小结 | 第35-37页 |
| 第三章 猪耳型性状重要候选基因MSRB3的克隆分析 | 第37-55页 |
| 3.1 试验材料 | 第37页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第37页 |
| 3.1.2 主要仪器、试剂和溶液配制 | 第37页 |
| 3.2 试验方法 | 第37-44页 |
| 3.2.1 样品采集 | 第37-38页 |
| 3.2.2 基因组DNA和总RNA的提取 | 第38页 |
| 3.2.3 反转录合成cDNA | 第38页 |
| 3.2.4 MSRB3 cDNA全序列克隆 | 第38-42页 |
| 3.2.5 生物信息学分析 | 第42页 |
| 3.2.6 外显子顺序鉴定 | 第42-43页 |
| 3.2.7 组织表达谱分析 | 第43-44页 |
| 3.2.8 多态性探索及分析 | 第44页 |
| 3.3 试验结果 | 第44-52页 |
| 3.3.1 MSRB3 CDNA全序列克隆 | 第44-45页 |
| 3.3.2 外显子排列顺序鉴定 | 第45-46页 |
| 3.3.3 生物信息学分析 | 第46-49页 |
| 3.3.4 组织表达谱分析 | 第49-50页 |
| 3.3.5 多态性探索及分析 | 第50-52页 |
| 3.4 讨论 | 第52-53页 |
| 3.4.1 耳型性状重要候选基因MSRB3 | 第52页 |
| 3.4.2 MSRB3 CDNA全序列克隆 | 第52-53页 |
| 3.4.3 生物信息学分析 | 第53页 |
| 3.4.4 多态性探索及分析 | 第53页 |
| 3.5 小结 | 第53-55页 |
| 第四章 全文结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 附录 | 第62-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 作者简历 | 第69页 |