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马氏珠母贝外套膜不同区域的DNA甲基化差异及功能研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
1 文献综述第12-19页
    1.1 表观遗传学第12页
    1.2 DNA甲基化概述第12-14页
    1.3 DNA甲基化的研究手段第14-15页
    1.4 外套膜研究基础第15-16页
    1.5 国内外研究进展第16-17页
    1.6 本研究的目的和意义第17-19页
2 马氏珠母贝外套膜不同区域基因组DNA甲基化MSAP分析第19-31页
    2.1 材料与方法第19-22页
        2.1.1 实验动物及材料第19页
        2.1.2 主要耗材与试剂第19-20页
        2.1.3 主要试剂和溶液的配制第20页
        2.1.4 主要仪器第20-21页
        2.1.5 引物信息第21-22页
    2.2 实验方法第22-25页
        2.2.1 总DNA的提取第22页
        2.2.2 MSAP分析第22-23页
        2.2.3 甲基化修饰片段的回收、克隆及测序第23-24页
        2.2.4 序列筛选、比对和分析第24页
        2.2.5 总RNA的提取第24-25页
        2.2.6 cDNA第一链的合成第25页
        2.2.7 荧光定量PCR第25页
    2.3 实验结果第25-28页
        2.3.1 MSAP扩增结果及DNA甲基化修饰水平分析第25-27页
        2.3.2 DNA甲基化修饰片段序列分析第27-28页
        2.3.3 筛选片段的定量分析第28页
    2.4 分析与讨论第28-31页
3 DNA甲基化免疫共沉淀测序及分析第31-41页
    3.1 实验材料第31页
        3.1.1 实验动物及材料第31页
        3.1.2 主要耗材与试剂第31页
        3.1.3 主要试剂和溶液的配制第31页
        3.1.4 主要仪器第31页
    3.2 实验方法第31-33页
        3.2.1 DNA甲基化免疫共沉淀技术(MeDIP-Seq)第31-33页
        3.2.2 荧光定量PCR第33页
    3.3 实验结果第33-39页
        3.3.1 数据处理与产出情况统计第33-38页
        3.3.2 筛选基因第38-39页
        3.3.3 荧光定量PCR结果第39页
    3.4 讨论与分析第39-41页
4 髓样分化因子88的功能研究第41-63页
    4.1 实验材料第41-42页
        4.1.1 实验动物与材料第41页
        4.1.2 主要耗材与试剂第41页
        4.1.3 主要试剂和溶液的配制第41页
        4.1.4 主要仪器第41页
        4.1.5 引物信息第41-42页
    4.2 实验方法第42-51页
        4.2.1 总RNA的提取第42页
        4.2.2 中间片段的克隆第42页
        4.2.3 RACE片段扩增第42-44页
        4.2.4 基因的生物信息学分析第44-45页
        4.2.5 荧光定量PCR第45页
        4.2.6 脂多糖刺激实验第45页
        4.2.7 原位杂交第45-46页
        4.2.8 体外microRNA过表达实验第46-47页
        4.2.9 载体构建第47-51页
    4.3 实验结果第51-61页
        4.3.1 基因的基本特征第51-53页
        4.3.2 生物信息学分析第53-56页
        4.3.3 组织表达差异分析第56-57页
        4.3.4 脂多糖刺激结果分析第57页
        4.3.5 Pm-MyD88基因在血细胞中的定位第57-58页
        4.3.6 信号通路的验证第58-59页
        4.3.7 Pm-MyD88调控miRNA的筛选第59页
        4.3.8 靶向关系验证第59-61页
    4.4 讨论与分析第61-63页
5 甲基化转移酶DNMT的克隆及表达分析第63-81页
    5.1 实验材料第63-64页
        5.1.1 实验动物与材料第63页
        5.1.2 主要耗材与试剂第63页
        5.1.3 主要试剂和溶液的配制第63页
        5.1.4 主要仪器第63页
        5.1.5 引物信息第63-64页
    5.2 实验方法第64-65页
        5.2.1 总RNA的提取第64页
        5.2.2cDNA第一链的合成第64页
        5.2.3 基因片段的克隆第64页
        5.2.4 RACE片段扩增第64页
        5.2.5 基因的生物信息学分析第64页
        5.2.6 荧光定量PCR第64-65页
        5.2.7 地西他滨处理第65页
    5.3 实验结果第65-78页
        5.3.1 基因的基本特征第65-74页
            5.3.1.1 Pm-Dnmt1序列特征分析第65-68页
            5.3.1.2 Pm-Dnmt1b序列特征分析第68-70页
            5.3.1.3 Pm-Dnmt3a序列特征分析第70-72页
            5.3.1.4 Pm-Dnmt3b序列特征分析第72-74页
        5.3.2 组织表达差异分析第74-76页
            5.3.2.1 Pm-Dnmt1基因的组织差异表达分析第74页
            5.3.2.2 Pm-Dnmt1b基因的组织差异表达分析第74-75页
            5.3.2.3 Pm-Dnmt3a基因的组织差异表达分析第75页
            5.3.2.4 Pm-Dnmt3b基因的组织差异表达分析第75-76页
        5.3.3 地西他滨处理结果第76-78页
    5.4 讨论与分析第78-81页
6 结论第81-82页
参考文献第82-91页
致谢第91-92页
作者简介第92-93页
导师简介第93页

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