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羊绒周期性生长特异性IncRNAs的筛选

摘要第6-7页
ABSTRACT第7-8页
第一章 文献综述第11-23页
    1.1 羊绒生长的研究现状第11-12页
    1.2 lncRNAs的简介第12-20页
        1.2.1 lncRNAs的发现及分类第12-14页
        1.2.2 lncRNA的功能研究第14页
        1.2.3 lncRNAs的作用机制第14-18页
            1.2.3.1 表观遗传学调控第16-18页
        1.2.4 lncRNAs的研究进展第18-20页
    1.3 高通量测序技术第20-21页
        1.3.1 高通量测序的类别第20页
        1.3.2 转录组测序的作用及应用第20-21页
    1.4 研究的目的与意义第21-23页
第二章 羊绒生长期和休止期皮肤组织转录组测序及分析第23-35页
    2.1 材料与方法第23-26页
        2.1.1 样品采集第23页
        2.1.2 主要试剂第23页
        2.1.3 RNA提取的准备第23页
        2.1.4 绒山羊皮肤总RNA的提取第23页
        2.1.5 转录组测序(RNA‐seq)第23-24页
        2.1.6 测序过程第24-25页
        2.1.7 文库质检与上机测序第25页
        2.1.8 信息分析流程第25页
        2.1.9 基因差异分析第25-26页
        2.1.10 差异基因的GO分析第26页
        2.1.11 KEGG Pathway分析第26页
        2.1.12 SSR分析第26页
        2.1.13 蛋白互作分析第26页
    2.2 结果与分析第26-33页
        2.2.1 转录组测序以及转录本的reads分析第26-27页
        2.2.2 样本间差异表达基因筛选和聚类分析第27-29页
        2.2.3 差异基因的gene ontology富集分析第29-30页
        2.2.4 差异基因KEGG富集分析第30页
        2.2.5 SSR分析第30-31页
        2.2.6 蛋白互作分析第31页
        2.2.7 lncRNAs分析第31-33页
    2.3 讨论第33-34页
    2.4 小结第34-35页
第三章 lncRNAs筛选及验证第35-41页
    3.1 材料与方法第35-37页
        3.1.1 样品采集第35页
        3.1.2 主要试剂第35页
        3.1.3 引物设计第35-36页
        3.1.4 提取RNA的准备第36页
        3.1.5 提取RNA第36页
        3.1.6 对提取的RNA进行质量检测和浓度检测第36页
        3.1.7 反转录及实时定量PCR(RT‐PCR)第36-37页
        3.1.8 数据统计分析第37页
    3.2 结果及分析第37-39页
        3.2.1 对RNA质量及浓度测定第37-38页
        3.2.2 RT‐PCR扩增体系检测结果第38页
        3.2.3 lncRNAs在不同时期皮肤组织中的表达情况第38-39页
    3.3 讨论第39-40页
    3.4 小结第40-41页
第四章 lncRNAs过表达载体的构建与鉴定第41-52页
    4.1 材料与方法第41-48页
        4.1.1 主要试剂与仪器第41页
        4.1.2 lncRNAs过表达载体的构建第41-42页
        4.1.3 构建过表达载体第42-48页
    4.2 结果与分析第48-50页
    4.3 讨论第50-51页
    4.4 小结第51-52页
第五章 结论与展望第52-53页
    5.1 主要结论第52页
        5.1.1 陕北白绒山羊RNA‐seq测序结果及分析第52页
        5.1.2 RNA‐seq的qRT‐PCR验证第52页
        5.1.3 过表达载体的构建第52页
    5.2 主要创新点第52页
    5.3 需要进一步研究的问题第52-53页
参考文献第53-62页
附录第62-69页
    附录1 主要实验仪器第62-63页
    附录2 常用试剂的配制方法第63-64页
    附录3 质粒小提方法第64-65页
    附录4 动物组织DNA的提取方法第65-66页
    附录5 动物组织总RNA的提取方法第66-67页
    附录6 DNA纯化过程第67-68页
    附录7 电泳检测第68-69页
致谢第69-70页
作者简介第70页

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