摘要 | 第6-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
第一章 文献综述 | 第11-23页 |
1.1 羊绒生长的研究现状 | 第11-12页 |
1.2 lncRNAs的简介 | 第12-20页 |
1.2.1 lncRNAs的发现及分类 | 第12-14页 |
1.2.2 lncRNA的功能研究 | 第14页 |
1.2.3 lncRNAs的作用机制 | 第14-18页 |
1.2.3.1 表观遗传学调控 | 第16-18页 |
1.2.4 lncRNAs的研究进展 | 第18-20页 |
1.3 高通量测序技术 | 第20-21页 |
1.3.1 高通量测序的类别 | 第20页 |
1.3.2 转录组测序的作用及应用 | 第20-21页 |
1.4 研究的目的与意义 | 第21-23页 |
第二章 羊绒生长期和休止期皮肤组织转录组测序及分析 | 第23-35页 |
2.1 材料与方法 | 第23-26页 |
2.1.1 样品采集 | 第23页 |
2.1.2 主要试剂 | 第23页 |
2.1.3 RNA提取的准备 | 第23页 |
2.1.4 绒山羊皮肤总RNA的提取 | 第23页 |
2.1.5 转录组测序(RNA‐seq) | 第23-24页 |
2.1.6 测序过程 | 第24-25页 |
2.1.7 文库质检与上机测序 | 第25页 |
2.1.8 信息分析流程 | 第25页 |
2.1.9 基因差异分析 | 第25-26页 |
2.1.10 差异基因的GO分析 | 第26页 |
2.1.11 KEGG Pathway分析 | 第26页 |
2.1.12 SSR分析 | 第26页 |
2.1.13 蛋白互作分析 | 第26页 |
2.2 结果与分析 | 第26-33页 |
2.2.1 转录组测序以及转录本的reads分析 | 第26-27页 |
2.2.2 样本间差异表达基因筛选和聚类分析 | 第27-29页 |
2.2.3 差异基因的gene ontology富集分析 | 第29-30页 |
2.2.4 差异基因KEGG富集分析 | 第30页 |
2.2.5 SSR分析 | 第30-31页 |
2.2.6 蛋白互作分析 | 第31页 |
2.2.7 lncRNAs分析 | 第31-33页 |
2.3 讨论 | 第33-34页 |
2.4 小结 | 第34-35页 |
第三章 lncRNAs筛选及验证 | 第35-41页 |
3.1 材料与方法 | 第35-37页 |
3.1.1 样品采集 | 第35页 |
3.1.2 主要试剂 | 第35页 |
3.1.3 引物设计 | 第35-36页 |
3.1.4 提取RNA的准备 | 第36页 |
3.1.5 提取RNA | 第36页 |
3.1.6 对提取的RNA进行质量检测和浓度检测 | 第36页 |
3.1.7 反转录及实时定量PCR(RT‐PCR) | 第36-37页 |
3.1.8 数据统计分析 | 第37页 |
3.2 结果及分析 | 第37-39页 |
3.2.1 对RNA质量及浓度测定 | 第37-38页 |
3.2.2 RT‐PCR扩增体系检测结果 | 第38页 |
3.2.3 lncRNAs在不同时期皮肤组织中的表达情况 | 第38-39页 |
3.3 讨论 | 第39-40页 |
3.4 小结 | 第40-41页 |
第四章 lncRNAs过表达载体的构建与鉴定 | 第41-52页 |
4.1 材料与方法 | 第41-48页 |
4.1.1 主要试剂与仪器 | 第41页 |
4.1.2 lncRNAs过表达载体的构建 | 第41-42页 |
4.1.3 构建过表达载体 | 第42-48页 |
4.2 结果与分析 | 第48-50页 |
4.3 讨论 | 第50-51页 |
4.4 小结 | 第51-52页 |
第五章 结论与展望 | 第52-53页 |
5.1 主要结论 | 第52页 |
5.1.1 陕北白绒山羊RNA‐seq测序结果及分析 | 第52页 |
5.1.2 RNA‐seq的qRT‐PCR验证 | 第52页 |
5.1.3 过表达载体的构建 | 第52页 |
5.2 主要创新点 | 第52页 |
5.3 需要进一步研究的问题 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-62页 |
附录 | 第62-69页 |
附录1 主要实验仪器 | 第62-63页 |
附录2 常用试剂的配制方法 | 第63-64页 |
附录3 质粒小提方法 | 第64-65页 |
附录4 动物组织DNA的提取方法 | 第65-66页 |
附录5 动物组织总RNA的提取方法 | 第66-67页 |
附录6 DNA纯化过程 | 第67-68页 |
附录7 电泳检测 | 第68-69页 |
致谢 | 第69-70页 |
作者简介 | 第70页 |