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水稻籽粒灌浆速率基因GFR1的图位克隆及优异等位变异在自然群体中的发掘

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
缩略语第11-12页
第一章 文献综述第12-34页
    1 杂交粳稻育种概况第12-14页
        1.1 杂交粳稻的发展第12-13页
        1.2 杂交粳稻育种的现状及对策第13-14页
    2 水稻籽粒灌浆特性研究概况第14-16页
        2.1 水稻强弱势粒灌浆特性研究第14-15页
        2.2 水稻不同品种间籽粒灌浆特性研究第15-16页
    3 水稻籽粒灌浆机理研究概况第16-19页
        3.1 “源”的供应第16页
        3.2 “库”的限制第16-18页
        3.3 “流”的通畅第18-19页
    4 水稻籽粒灌浆分子机制研究概况第19-28页
        4.1 酶活性和同化物转运相关基因第19-21页
        4.2 细胞壁转化酶基因第21-23页
        4.3 植物激素相关基因第23页
        4.4 胚乳发育相关基因第23-24页
        4.5 siRNA和miRNAs对籽粒灌浆的调控第24-26页
        4.6 磷酸化蛋白质组学第26页
        4.7 水稻籽粒灌浆相关性状研究第26-28页
    5 植物数量性状遗传定位概况第28-31页
        5.1 基于遗传分离群体的连锁定位第29-30页
        5.2 条件QTL定位第30页
        5.3 基于自然群体的关联定位第30-31页
        5.4 连锁定位与关联定位的对比第31页
    6 本研究的目的与意义第31-34页
第二章 水稻籽粒灌浆速率基因GFR1的图位克隆第34-62页
    1 材料与方法第34-44页
        1.1 供试材料第34-35页
        1.2 田间种植与性状调查第35-36页
        1.3 生理生化指标的测定第36-37页
        1.4 灌浆早期胚乳样品的透射电镜观察第37页
        1.5 灌浆后期种子断面的扫描电镜观察第37页
        1.6 植物总DNA的提取及标记基因型鉴定第37-40页
        1.7 标记开发及精细定位第40页
        1.8 候选基因预测与同源性分析第40页
        1.9 RNA提取与qRT-PCR分析第40-42页
        1.10 转基因互补载体和过表达载体的构建第42页
        1.11 植物转化第42-43页
        1.12 转基因阳性植株的鉴定第43页
        1.13 GFR1启动子组织活性分析第43页
        1.14 穞稻等位基因GFR1的育种利用评价第43-44页
    2 结果与分析第44-60页
        2.1 水稻籽粒灌浆速率QTL分析及NIL-gfr1的分离第44-45页
        2.2 亲本籽粒灌浆速率相关表型的鉴定第45-49页
        2.3 GFR1的精细定位第49-51页
        2.4 GFR1候选基因的预测第51-54页
        2.5 GFR1的表达模式分析第54-56页
        2.6 转基因验证第56-58页
        2.7 GFR1基因位点穞稻等位基因可以提高杂交稻的产量第58-60页
    3 讨论第60-62页
        3.1 穞稻等位基因GFR1-l可以显著提高籽粒灌浆速率第60页
        3.2 “源”和“库”对GFR1基因调控籽粒灌浆速率的影响第60-61页
        3.3 GFR1是一个新的参与调控籽粒灌浆速率的关键基因第61-62页
第三章 水稻籽粒灌浆速率优异等位变异在自然群体中的发掘第62-92页
    1 材料与方法第63-72页
        1.1 供试材料第63页
        1.2 田间种植与性状调查第63-70页
        1.3 SSR标记基因型鉴定第70页
        1.4 数据分析第70-72页
    2 结果与分析第72-88页
        2.1 水稻灌浆期温度的变化第72页
        2.2 水稻95个品种籽粒灌浆速率的表现第72-73页
        2.3 263个SSR标记位点的遗传多样性第73-78页
        2.4 地方品种群体和推广品种群体SSR位点间的连锁不平衡及其衰减第78页
        2.5 品种总群体结构分析第78-81页
        2.6 与水稻籽粒灌浆速率相关联的SSR位点第81-82页
        2.7 5个时期水稻籽粒灌浆速率的优异等位变异第82-84页
        2.8 提高籽粒灌浆速率的优异亲本组合预测第84-85页
        2.9 GFR1特异标记B在95个水稻品种中的基因型鉴定第85-88页
    3 本章讨论第88-92页
        3.1 抽穗期和糙米重变异对水稻籽粒灌浆速率的影响第88页
        3.2 研究籽粒灌浆速率使用时间过程方法的重要性第88-89页
        3.3 水稻种质群体遗传多样性的比较第89页
        3.4 群体结构分析和LD连锁分析在关联定位中的意义第89页
        3.5 时间过程的关联定位在籽粒灌浆速率研究中的优势第89-90页
        3.6 改善籽粒灌浆速率的优异亲本组合预测第90-92页
第四章 全文总结第92-94页
    1 全文结论第92-93页
        1.1 图位克隆了控制水稻籽粒灌浆速率基因GFR1第92页
        1.2 发掘了5个灌浆期水稻籽粒灌浆速率的优异等位变异第92-93页
    2 本研究的创新之处第93-94页
参考文献第94-106页
附表第106-118页
附图第118-120页
发表与撰写的学术论文第120-122页
致谢第122页

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