| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第13-24页 |
| 1.1 ε-聚赖氨酸的概述 | 第13-14页 |
| 1.1.1 ε-聚赖氨酸的发现 | 第13页 |
| 1.1.2 ε-聚赖氨酸的理化性质与生物学性质 | 第13页 |
| 1.1.3 ε-聚赖氨酸的抑菌机制 | 第13-14页 |
| 1.1.4 ε-聚赖氨酸的应用 | 第14页 |
| 1.2 ε-聚赖氨酸的生物合成机制 | 第14-16页 |
| 1.3 ε-聚赖氨酸的发酵生产 | 第16-18页 |
| 1.3.1 发酵工艺调控 | 第16-17页 |
| 1.3.2 营养条件优化 | 第17-18页 |
| 1.4 微生物利用混合碳源 | 第18-19页 |
| 1.4.1 微生物顺序利用混合碳源 | 第18-19页 |
| 1.4.2 微生物同步利用混合碳源 | 第19页 |
| 1.5 生物体的氧化胁迫效应 | 第19-21页 |
| 1.5.1 动物细胞对氧化胁迫响应机制 | 第19-20页 |
| 1.5.2 植物细胞对氧化胁迫响应机制 | 第20页 |
| 1.5.3 真菌细胞对氧化胁迫响应机制 | 第20页 |
| 1.5.4 细菌细胞对氧化胁迫响应机制 | 第20页 |
| 1.5.5 微生物发酵中的氧化胁迫效应 | 第20-21页 |
| 1.6 本论文的研究内容 | 第21-24页 |
| 1.6.1 混合碳源强化S. albulus积累 ε-聚赖氨酸中值得研究的科学问题 | 第21-22页 |
| 1.6.2 本论文的主要研究内容 | 第22-24页 |
| 第二章 双碳源强化S. albulus合成 ε-聚赖氨酸的生理状态解析 | 第24-38页 |
| 2.1 引言 | 第24页 |
| 2.2 材料与方法 | 第24-30页 |
| 2.2.1 材料来源 | 第24页 |
| 2.2.2 菌株 | 第24页 |
| 2.2.3 培养基 | 第24-25页 |
| 2.2.4 培养条件 | 第25页 |
| 2.2.5 细胞破碎液制备 | 第25-26页 |
| 2.2.6 分析方法 | 第26-27页 |
| 2.2.7 胞内能量辅因子浓度测定 | 第27页 |
| 2.2.8 酶活力测定 | 第27-29页 |
| 2.2.9 发酵参数计算 | 第29页 |
| 2.2.10 分批发酵尾气分析 | 第29-30页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第30-36页 |
| 2.3.1 三种碳源分批发酵生产 ε-聚赖氨酸动力学参数分析 | 第30-31页 |
| 2.3.2 三种碳源发酵过程中 ε-聚赖氨酸合成途径的关键酶活性分析 | 第31-35页 |
| 2.3.3 双碳源发酵中细胞呼吸活力分析 | 第35-36页 |
| 2.3.4 双碳源发酵中胞内能量辅因子分析 | 第36页 |
| 2.4 本章小结 | 第36-38页 |
| 第三章 基于恒化培养解析双碳源强化 ε-聚赖氨酸合成的原因 | 第38-58页 |
| 3.1 前言 | 第38页 |
| 3.2 材料与方法 | 第38-44页 |
| 3.2.1 菌株 | 第38页 |
| 3.2.2 培养基 | 第38-39页 |
| 3.2.3 培养条件 | 第39页 |
| 3.2.4 细胞破碎液制备 | 第39页 |
| 3.2.5 分析方法 | 第39-40页 |
| 3.2.6 酶活力测定 | 第40-41页 |
| 3.2.7 胞内能量辅因子测定 | 第41页 |
| 3.2.8 胞内游离氨基酸测定 | 第41页 |
| 3.2.9 细胞死活染色 | 第41页 |
| 3.2.10 恒化培养计算方法 | 第41-42页 |
| 3.2.11 胞外总蛋白水解氨基酸测定 | 第42页 |
| 3.2.12 ε-聚赖氨酸合成相关代谢网络图的构建 | 第42-44页 |
| 3.2.13 代谢通量的计算 | 第44页 |
| 3.2.14 统计学分析 | 第44页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第44-57页 |
| 3.3.1 不同稀释率下双碳源发酵生产 ε-聚赖氨酸恒化培养的建立 | 第44-45页 |
| 3.3.2 不同稀释率对 ε-聚赖氨酸发酵的影响 | 第45-46页 |
| 3.3.3 不同稀释率对细胞初级代谢中关键酶活力的影响 | 第46-47页 |
| 3.3.4 不同稀释率对胞内游离氨基酸水平的影响 | 第47-48页 |
| 3.3.5 不同稀释率对细胞内能量水平的影响 | 第48-49页 |
| 3.3.6 不同稀释率下细胞应对氧化胁迫的能力差异 | 第49-50页 |
| 3.3.7 不同稀释率下死活菌丝体在菌球中的分布 | 第50-51页 |
| 3.3.8 同一比生长速率下不同碳源发酵生产 ε-聚赖氨酸恒化培养的建立 | 第51-53页 |
| 3.3.9 同一比生长速率下不同碳源对 ε-聚赖氨酸发酵的影响 | 第53-54页 |
| 3.3.10 同一比生长速率下不同碳源对 ε-聚赖氨酸合成相关途径代谢流的影响 | 第54-57页 |
| 3.4 本章小结 | 第57-58页 |
| 第四章 双碳源强化S. albulus合成 ε-聚赖氨酸的转录组学研究 | 第58-71页 |
| 4.1 前言 | 第58页 |
| 4.2 材料与方法 | 第58-61页 |
| 4.2.1 菌株 | 第58页 |
| 4.2.2 培养基 | 第58页 |
| 4.2.3 培养条件 | 第58页 |
| 4.2.4 转录组及半定量反转录PCR样品制备 | 第58-59页 |
| 4.2.5 转录组测序实验步骤 | 第59页 |
| 4.2.6 转录组信息分析步骤 | 第59-60页 |
| 4.2.7 实时定量PCR测定 | 第60-61页 |
| 4.3 结果与分析 | 第61-70页 |
| 4.3.1 转录组测序及分析中的质量控制 | 第61-63页 |
| 4.3.2 转录组中双碳源相对单一碳源的差异表达基因分析 | 第63-68页 |
| 4.3.3 转录组结论的实时定量PCR验证 | 第68-70页 |
| 4.4 本章小结 | 第70-71页 |
| 第五章S. albulus同步利用葡萄糖和甘油合成 ε-聚赖氨酸的生理基础探索 | 第71-81页 |
| 5.1 引言 | 第71页 |
| 5.2 材料与方法 | 第71-72页 |
| 5.2.1 菌株 | 第71页 |
| 5.2.2 培养基 | 第71页 |
| 5.2.3 培养条件 | 第71-72页 |
| 5.2.4 分析方法 | 第72页 |
| 5.2.5 转录组及实时定量PCR样品制备 | 第72页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第72-80页 |
| 5.3.1 双碳源分批发酵 ε-聚赖氨酸中细胞同时代谢葡萄糖和甘油的可行性评估 | 第72-73页 |
| 5.3.2 双碳源分批发酵 ε-聚赖氨酸中碳源代谢相关基因转录分析 | 第73-76页 |
| 5.3.3 三种碳源发酵中碳源代谢基因转录水平验证 | 第76-77页 |
| 5.3.4 辅助碳源的添加对三种碳源发酵 ε-聚赖氨酸的影响 | 第77-80页 |
| 5.4 本章小结 | 第80-81页 |
| 第六章 双碳源补料分批发酵生产 ε-聚赖氨酸的限制因素解析 | 第81-96页 |
| 6.1 前言 | 第81页 |
| 6.2 材料与方法 | 第81-84页 |
| 6.2.1 菌株 | 第81页 |
| 6.2.2 培养基 | 第81页 |
| 6.2.3 培养条件 | 第81-82页 |
| 6.2.4 细胞破碎液制备 | 第82页 |
| 6.2.5 分析方法 | 第82页 |
| 6.2.6 胞内ATP浓度测定 | 第82页 |
| 6.2.7 酶活力测定 | 第82页 |
| 6.2.8 胞内L-赖氨酸测定 | 第82页 |
| 6.2.9 活性氧自由基积累水平测定 | 第82-83页 |
| 6.2.10 细胞活力测定 | 第83页 |
| 6.2.11 胞内NADPH测定 | 第83页 |
| 6.2.12 细胞电子传递链活力测定 | 第83-84页 |
| 6.2.13 发酵参数计算 | 第84页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第84-95页 |
| 6.3.1 双碳源补料发酵中发酵参数分析 | 第84-85页 |
| 6.3.2 双碳源补料发酵中细胞生理分析 | 第85-88页 |
| 6.3.3 双碳源补料发酵中细胞氧化胁迫水平分析 | 第88-89页 |
| 6.3.4 氧化胁迫对细胞呼吸链活力的影响 | 第89-91页 |
| 6.3.5 双碳源补料发酵中细胞抗氧化能力分析 | 第91-92页 |
| 6.3.6 双碳源补料发酵中与氧化胁迫相关的基因转录差异 | 第92-93页 |
| 6.3.7 双碳源补料分批发酵中后期发酵性能衰退原因分析 | 第93-95页 |
| 6.4 本章小结 | 第95-96页 |
| 主要结论与展望 | 第96-98页 |
| 主要结论 | 第96-97页 |
| 展望 | 第97-98页 |
| 论文主要创新点 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 参考文献 | 第100-108页 |
| 附录 一: 作者在攻读博士学位期间发表的论文 | 第108-109页 |
| 附录二: 附表 | 第109-112页 |
| 附录三: 代谢反应化学计量式 | 第112-113页 |
| 附录四: 化合物缩写 | 第113-114页 |
| 附录五: 半定量RT-PCR中相关基因序列 | 第114-121页 |
