艾丁湖沉积物放线菌多样性研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-21页 |
| ·盐环境中放线菌的研究意义 | 第10-11页 |
| ·放线菌的多样性研究 | 第11-15页 |
| ·纯培养方法 | 第12页 |
| ·免培养方法 | 第12-15页 |
| ·PCR-RFLP 方法 | 第13页 |
| ·PCR-SSCP 方法 | 第13-14页 |
| ·DGGE 与TGGE 方法 | 第14页 |
| ·RAPD 方法 | 第14-15页 |
| ·盐环境中放线菌的分离 | 第15页 |
| ·放线菌的多相分类 | 第15-19页 |
| ·表型信息 | 第16-18页 |
| ·细胞化学组分分析 | 第16页 |
| ·磷酸类脂分析 | 第16-18页 |
| ·醌组分分析 | 第18页 |
| ·全细胞脂肪酸分析 | 第18页 |
| ·基因型和系统发育信息 | 第18-19页 |
| ·DNA 碱基组成比例 | 第18页 |
| ·DNA-DNA 分子杂交 | 第18页 |
| ·16S rDNA 基因序列分析 | 第18-19页 |
| ·论文的设计思路 | 第19-21页 |
| ·设计思路 | 第19页 |
| ·研究方案 | 第19-20页 |
| ·技术路线 | 第20-21页 |
| 第二章 艾丁湖免培养放线菌多样性研究 | 第21-34页 |
| ·材料和方法 | 第21-25页 |
| ·材料 | 第21-22页 |
| ·样品的采集 | 第21页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第21-22页 |
| ·方法 | 第22-25页 |
| ·样品组分的测定 | 第22页 |
| ·样品总DNA 的提取 | 第22-23页 |
| ·放线菌特异性序列的扩增 | 第23页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第23页 |
| ·回收纯化 | 第23-24页 |
| ·连接T 载体 | 第24页 |
| ·转化大肠杆菌感受态细胞 | 第24页 |
| ·构建克隆文库 | 第24页 |
| ·克隆文库的检验及RFLP 分析 | 第24-25页 |
| ·结果与分析 | 第25-33页 |
| ·沉积物样品盐离子组分的测定结果 | 第25页 |
| ·免培养方法分析艾丁湖沉积物放线菌多样性 | 第25-33页 |
| ·沉积物总DNA 的提取及放线菌特异性序列的扩增 | 第25-28页 |
| ·克隆文库的构建 | 第28页 |
| ·克隆文库的检验及放线菌多样性指数分析 | 第28-30页 |
| ·艾丁湖免培养放线菌多样性分析 | 第30-33页 |
| ·讨论 | 第33-34页 |
| 第三章 艾丁湖可培养放线菌多样性研究 | 第34-43页 |
| ·材料与方法 | 第34-36页 |
| ·分离培养方法 | 第34-35页 |
| ·稀释涂布平板法 | 第34页 |
| ·培养基 | 第34-35页 |
| ·放线菌种类的初步鉴定 | 第35-36页 |
| ·放线菌基因组DNA 的提取 | 第35-36页 |
| ·放线菌16S rDNA 基因的扩增 | 第36页 |
| ·测序结果的比对分析 | 第36页 |
| ·放线菌菌种的保藏 | 第36页 |
| ·结果与分析 | 第36-42页 |
| ·艾丁湖沉积物可培养放线菌的多样性 | 第36-42页 |
| ·讨论 | 第42-43页 |
| 第四章 两株潜在放线菌新种的多相分类 | 第43-64页 |
| ·材料与方法 | 第43-49页 |
| ·分子生物学鉴定 | 第43-44页 |
| ·16S rDNA 基因的克隆测序 | 第43-44页 |
| ·依据16S rDNA 基因序列进行系统发育分析 | 第44页 |
| ·放线菌基因组DNA (G+C)%含量的测定 | 第44页 |
| ·形态学特征 | 第44-45页 |
| ·生理生化特征 | 第45-47页 |
| ·碳源利用 | 第45页 |
| ·淀粉水解 | 第45页 |
| ·牛奶凝固与胨化 | 第45-46页 |
| ·明胶液化 | 第46页 |
| ·纤维素分解利用 | 第46页 |
| ·硝酸盐还原 | 第46页 |
| ·硫化氢产生 | 第46页 |
| ·氧化酶产生 | 第46页 |
| ·过氧化氢酶产生 | 第46-47页 |
| ·尿素酶产生 | 第47页 |
| ·脂酶试验 | 第47页 |
| ·温度耐受及最适生长温度的确定 | 第47页 |
| ·盐度耐受及最适生长盐浓度的确定 | 第47页 |
| ·pH 耐受及最适生长pH 的确定 | 第47页 |
| ·细胞化学组分分析 | 第47-49页 |
| ·全细胞糖组分分析 | 第48页 |
| ·全细胞氨基酸组分分析 | 第48页 |
| ·磷酸类脂分析 | 第48页 |
| ·脂肪酸分析 | 第48页 |
| ·醌组分的测定 | 第48-49页 |
| ·结果与分析 | 第49-63页 |
| ·分子特征鉴定结果 | 第49-52页 |
| ·系统发育分析 | 第49-51页 |
| ·(G+C)%含量测定结果 | 第51-52页 |
| ·形态特征 | 第52-53页 |
| ·生理生化指标测定结果 | 第53-56页 |
| ·碳源利用实验结果 | 第53-54页 |
| ·温度耐受实验结果 | 第54页 |
| ·NaCI 耐受实验结果 | 第54-55页 |
| ·pH 耐受试验结果 | 第55页 |
| ·酶学特征实验结果 | 第55页 |
| ·代谢实验结果 | 第55-56页 |
| ·细胞化学组分分析结果 | 第56-60页 |
| ·全细胞糖组分和DAP 测定结果 | 第56页 |
| ·磷酸类脂分析结果 | 第56-57页 |
| ·脂肪酸分析结果 | 第57-58页 |
| ·醌组分的测定结果 | 第58-60页 |
| ·与相近菌株的比较 | 第60-63页 |
| ·菌株TRM46004 与相近菌株的比较 | 第60-61页 |
| ·菌株TRM46012 与相近菌株的比较 | 第61-63页 |
| ·讨论 | 第63-64页 |
| 第五章总结与展望 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 作者简介 | 第70页 |