| 中文摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 序言 | 第10-14页 |
| ·量子化学的发展 | 第10-11页 |
| ·论文选题背景 | 第11-13页 |
| ·氯胺 | 第11-12页 |
| ·DNA碱基——鸟嘌呤 | 第12-13页 |
| ·论文结构安排 | 第13-14页 |
| 第二章 相关理论知识概况 | 第14-22页 |
| ·双分子亲核取代反应 | 第14-16页 |
| ·双分子亲核取代反应的反应历程 | 第14-15页 |
| ·双分子亲核取代反应速率的决定因素 | 第15-16页 |
| ·混合量子力学/分子力学（QM/MM）方法 | 第16-17页 |
| ·密度泛函理论 | 第17-18页 |
| ·耦合簇理论 | 第18-19页 |
| ·过渡态理论 | 第19页 |
| ·Nudged elastic band (NEB)方法 | 第19-20页 |
| ·SPC/E（extended simple point charge）水分子模型 | 第20-22页 |
| 第三章 NH_2Cl + OH? → NH_2OH+Cl~?在液相下的反应研究 | 第22-36页 |
| ·研究背景 | 第22-23页 |
| ·多层次的混合QM/MM方法的实现 | 第23-25页 |
| ·系统设置与模拟过程 | 第25-26页 |
| ·结果分析 | 第26-34页 |
| ·反应物、过渡态和产物 | 第26-28页 |
| ·自由能曲线 | 第28-30页 |
| ·水溶剂对反应的影响 | 第30-32页 |
| ·沿反应路径的有效电荷分布变化 | 第32-33页 |
| ·反应能的比较 | 第33-34页 |
| ·以氮和碳为中心的双分子亲核取代反应的比较 | 第34页 |
| ·总结 | 第34-36页 |
| 第四章 8-羟基鸟嘌呤的氢转移反应 | 第36-45页 |
| ·研究背景 | 第36-37页 |
| ·先前的理论研究 | 第36-37页 |
| ·本论文研究的主要内容及创新点 | 第37页 |
| ·模型构建及模拟过程简述 | 第37-38页 |
| ·结果分析 | 第38-44页 |
| ·反应物、过渡态和产物的结构 | 第38-41页 |
| ·反应路径上电荷分布变化 | 第41-42页 |
| ·NEB路径的自由能曲线 | 第42-43页 |
| ·水溶剂对该反应的影响 | 第43-44页 |
| ·反应速率常数 | 第44页 |
| ·总结 | 第44-45页 |
| 第五章 总结与展望 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-51页 |
| 攻读硕士期间完成的论文 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52页 |
