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HP/LP-PRRSV二重FQ-PCR诊断方法的建立及其Nsp2和ORF5基因变异分析

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-9页
第1章 文献综述第9-14页
 1 猪繁殖与呼吸综合征病毒的起源和分类第9页
 2 猪繁殖与呼吸综合征病毒生物学特性第9-10页
   ·病毒的形态特征第9-10页
   ·病毒的培养特性第10页
 3 猪繁殖与呼吸综合征病毒分子生物学研究第10-12页
   ·病毒的基因组结构与特点第10页
   ·病毒基因组编码的蛋白的结构、功能第10-12页
     ·主要结构蛋白第11页
     ·PRRSV 的分子遗传变异第11-12页
 4 RT-PCR 检测技术第12-13页
 5 PRRSV 与其他病原体的相互作用第13-14页
第2章 HP/LP-PRRSV 二重 FQ-PCR 诊断方法的建立第14-30页
 1 材料第15-16页
   ·主要仪器与试剂第15页
   ·菌(毒)株第15页
   ·常用溶液及培养基第15-16页
 2 方法第16-22页
   ·引物的设计和合成第16页
   ·PRRSV 模版的制备第16-20页
     ·PRRSV 核酸的提取第16-17页
     ·反转录获得 cDNA第17页
     ·二重 RT-PCR 扩增第17-18页
     ·回收 PCR 产物第18-19页
     ·回收产物与 pGEM-T Easy 载体的连接第19页
     ·连接产物的转化及鉴定第19-20页
     ·重组质粒的特异性酶切鉴定与 PCR 鉴定第20页
   ·二重 FQ-PCR 方法反应条件的优化第20-21页
   ·二重 FQ-PCR 扩增反应第21页
   ·二重 FQ-PCR 敏感性试验及标准曲线的建立第21页
   ·特异性试验第21页
   ·重复性试验第21页
   ·二重 FQ-PCR 与二重 RT-PCR 敏感性比较第21页
   ·临床应用试验第21-22页
 3 结果第22-28页
   ·重组质粒鉴定结果第22页
   ·质粒 DNA 浓度的测定第22页
   ·二重荧光定量 RT-PCR 方法反应条件的优化第22-23页
   ·荧光定量 RT-PCR 的敏感性及标准曲线第23-25页
   ·特异性试验第25-26页
   ·重复性第26-27页
   ·二重 FQ-PCR 与二重 RT-PCR 敏感性比较第27页
   ·临床样品检测结果第27-28页
 4 讨论第28-30页
第3章 河南分离株 NSP2 和 ORF5-7 基因变异分析第30-48页
 1 材料第31-33页
   ·主要仪器及试剂第31页
   ·病料和毒株第31-33页
 2 方法第33-35页
   ·引物的设计与合成第33页
   ·PRRSV 模版的制备第33-35页
     ·PRRSV 核酸的提取第33页
     ·反转录获得 cDNA第33页
     ·RT-PCR 扩增及 PCR 产物的纯化第33-34页
     ·PCR 产物回收第34页
     ·回收的 DNA 片段与 pGEM-T Easy 载体的连接第34-35页
     ·连接产物的转化及鉴定第35页
     ·序列的测定拼接和遗传进化分析第35页
     ·推导编码氨基酸的基本特性比较第35页
 3 结果第35-46页
   ·Nsp2 基因和 ORF5 基因的 RT-PCR 扩增结果第35-36页
   ·Nsp2 基因和 ORF5 基因测序和序列拼接第36页
   ·Nsp2 基因/ORF5 基因核苷酸序列的分析第36-39页
   ·依据 Nsp2 基因和 ORF5 基因核苷酸序列的遗传演化分析第39-42页
   ·Nsp2 基因/ORF5 基因推导编码氨基酸的比较第42-44页
   ·核苷酸编码的氨基酸一级结构比较第44-46页
 4 讨论第46-48页
第4章 结论第48-49页
参考文献第49-54页
缩略语词汇表第54-55页
致谢第55-56页
攻读硕士学位期间的研究成果第56页

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