基于多视角特征融合的蛋白质属性预测
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 1 绪论 | 第7-10页 |
| ·引言 | 第7页 |
| ·研究背景 | 第7-9页 |
| ·研究意义 | 第7页 |
| ·国内外研究进展 | 第7-9页 |
| ·论文研究主要内容 | 第9页 |
| ·论文结构安排 | 第9-10页 |
| 2 蛋白质属性预测概述 | 第10-13页 |
| ·蛋白质概述 | 第10-11页 |
| ·蛋白质组成与结构 | 第11-12页 |
| ·蛋白质属性预测 | 第12页 |
| ·序列对比 | 第12页 |
| ·蛋白质结构预测 | 第12页 |
| ·本章小结 | 第12-13页 |
| 3 基于多视角特征融合的蛋白质属性预测系统框架 | 第13-26页 |
| ·预测框架 | 第13页 |
| ·特征提取 | 第13-18页 |
| ·PseAAC | 第14-15页 |
| ·PSSM | 第15-18页 |
| ·特征融合与降维 | 第18-21页 |
| ·特征融合 | 第18-19页 |
| ·主成分分析(PCA) | 第19-20页 |
| ·广义主成分分析(GPCA) | 第20-21页 |
| ·建立预测模型 | 第21-24页 |
| ·最小距离(MD) | 第21页 |
| ·贝叶斯判别函数 | 第21-22页 |
| ·最短马氏距离(MDD) | 第22页 |
| ·朴素贝叶斯分类 | 第22页 |
| ·最近邻(1NN) | 第22-23页 |
| ·最优信息理论K近邻(OET-KNN) | 第23-24页 |
| ·预测结果评价 | 第24-25页 |
| ·评价指标 | 第24-25页 |
| ·交叉验证 | 第25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 4 膜蛋白亚细胞定位预测 | 第26-35页 |
| ·引言 | 第26-27页 |
| ·数据集和方法 | 第27-28页 |
| ·基准数据集 | 第27-28页 |
| ·从不同视角提取特征 | 第28页 |
| ·预测模型 | 第28页 |
| ·实验结果与分析 | 第28-34页 |
| ·膜蛋白亚细胞定位数据集的预测结果 | 第28-33页 |
| ·酵母蛋白亚细胞定位数据集的预测结果 | 第33-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 5 蛋白质结构类预测 | 第35-47页 |
| ·引言 | 第35页 |
| ·数据集和方法 | 第35-36页 |
| ·基准数据集 | 第35-36页 |
| ·从不同视角提取特征 | 第36页 |
| ·复空间中的预测模型 | 第36页 |
| ·实验结果与分析 | 第36-45页 |
| ·关于4类结构数据集的预测结果 | 第36-38页 |
| ·本文方法使用串行和并行融合预测结果比较 | 第38-41页 |
| ·本文方法与现有预测器性能对比 | 第41-43页 |
| ·二硫键连接数据集的预测结果 | 第43-45页 |
| ·本章小结 | 第45-47页 |
| 6 总结与展望 | 第47-49页 |
| ·研究工作总结 | 第47页 |
| ·未来的工作和展望 | 第47-49页 |
| 致谢 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 附录 | 第57页 |