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小粒黑豆抗胞囊线虫SSH-cDNA文库构建及重要基因表达分析

中文摘要第1-13页
英文摘要第13-17页
第一章 文献综述第17-38页
   ·大豆胞囊线虫及其危害第17-18页
     ·大豆胞囊线虫的分类地位及生活史第17页
     ·大豆胞囊线虫寄主范围及危害症状第17-18页
   ·植物寄生线虫与寄主之间的分子互作第18-23页
     ·大豆胞囊线虫致病相关基因第18-23页
   ·植物寄主抗病基因第23-31页
     ·基因对基因学说第23-24页
     ·植物寄生线虫抗病基因第24-27页
     ·植物寄主抗性机制第27-31页
   ·植物抗病基因克隆方法第31-38页
     ·转座子标签技术(Transposon tagging)第31页
     ·图位克隆技术(Map-based cloning)第31-32页
     ·抗病基因同源克隆技术(Resistance-gene analog,RGA)第32页
     ·植物基因差异表达分析及克隆方法第32-38页
第二章 大豆胞囊线虫的鉴定及大豆根部接种观察第38-49页
   ·大豆胞囊线虫的鉴定第38-43页
     ·材料第38页
     ·方法第38-41页
     ·结果与分析第41-43页
   ·大豆根部组织接种观察第43-45页
     ·材料第43页
     ·方法第43-44页
     ·结果与分析第44-45页
   ·接种 SCN 大豆根尖的分子生物学检测第45-48页
     ·材料第45页
     ·方法第45-46页
     ·结果与分析第46-48页
   ·讨论第48-49页
第三章 大豆胞囊线虫诱导小粒黑豆 SSH-cDNA 文库的构建第49-68页
   ·材料第50-51页
     ·植物材料第50页
     ·线虫繁殖与孵化第50页
     ·主要酶及生化试剂第50-51页
   ·仪器设备第51-52页
   ·方法第52-61页
     ·接种及取样第52页
     ·大豆根尖总 RNA 的提取第52页
     ·总 RNA 中基因组 DNA 的去除第52-53页
     ·cDNA 第一链的合成第53-54页
     ·LD-PCR cDNA 扩增第54页
     ·柱层析双链 cDNA第54-55页
     ·双链 cDNA Rsa I 酶切第55页
     ·Rsa I 酶切的 Tester cDNA 片段与接头连接第55-56页
     ·第一次差减杂交第56-57页
     ·第二次差减杂交第57页
     ·第一次 PCR 扩增第57-58页
     ·第二次 PCR 扩增第58-59页
     ·第二次 PCR 产物的纯化第59页
     ·差减文库的 TA 克隆、转化第59-60页
     ·转化重组子的 PCR 检测第60-61页
   ·结果与分析第61-65页
     ·样品总 RNA 浓度与质量的检测第61-62页
     ·双链 cDNA 合成检测第62页
     ·cDNA 合成及 Rsa I 酶切双链 cDNA 效果分析第62-63页
     ·抑制消减 PCR 电泳检测第63-64页
     ·消减文库检测第64页
     ·文库插入片段大小检测第64-65页
   ·讨论第65-68页
     ·获得高质量和高浓度的总 RNA 是构建文库的前提第65-66页
     ·采用 SMART 技术TM合成 cDNA 的优越性第66-67页
     ·构建大豆 EST 基因差异表达文库的必要性第67-68页
第四章 SSH-cNDA 文库差异表达基因的筛选及功能分析第68-83页
   ·材料第68-69页
     ·主要化学试剂第68页
     ·试验药品的配置第68-69页
     ·杂交膜的制备第69页
   ·方法第69-72页
     ·DIG-cDNA 标记第69-70页
     ·杂交探针标记效率检测第70页
     ·样品的点膜及固定第70-71页
     ·预杂交及杂交第71页
     ·洗膜及信号检测第71-72页
   ·结果与分析第72-78页
     ·杂交探针标记效率分析第72页
     ·反向 Northern 斑点杂交分析第72-73页
     ·测序与序列生物信息学分析第73-76页
     ·ESTs 在 WEGO 中的功能聚类及分析第76-77页
     ·SSH-cDNA 文库中高频率表达 ESTs 功能聚类及分析第77-78页
   ·讨论第78-83页
     ·防御相关反应基因第78-79页
     ·代谢与生物合成途径第79-80页
     ·蛋白合成基因第80页
     ·能量代谢第80页
     ·运输因子第80-81页
     ·细胞周期活性及细胞结构第81页
     ·转录调节与信号传导第81-83页
第五章 实时荧光定量检测抗病相关基因的表达第83-96页
   ·材料第83-84页
     ·植物材料第83页
     ·线虫繁殖第83页
     ·主要生化试剂第83-84页
     ·主要仪器设备第84页
     ·引物设计软件第84页
   ·方法第84-87页
     ·接种及取样方法第84页
     ·大豆根尖组织总 RNA 的提取及 DNA 的去除第84-85页
     ·cDNA 的反转录合成第85页
     ·Real Time PCR 反应体系及反应程序设置第85页
     ·Real Time PCR 引物设计第85-87页
   ·结果与分析第87-91页
     ·生物合成和代谢第87页
     ·糖代谢和能量相关第87页
     ·运输因子第87页
     ·植物与病原互作和植物防御基因第87-88页
     ·信号传导第88页
     ·转录因子第88页
     ·细胞周期调节、细胞组成.和蛋白合成的基因第88-91页
   ·讨论第91-96页
第六章 大豆谷胱甘肽过氧化物酶基因的克隆及表达分析第96-108页
   ·材料第96-97页
     ·植物材料第96页
     ·线虫繁殖与.接种第96-97页
     ·主要酶及化学试剂第97页
     ·菌种及载体第97页
     ·生物信息学分析软件第97页
   ·方法第97-100页
     ·GmGPX1 特异性引物及 Real Time PCR 引物的设计第97页
     ·核酸的提取及 cDNA 合成第97-98页
     ·GmGPX1 基因的克隆第98-99页
     ·GmGPX1 实时荧光定量 RT-PCR 表达分析第99-100页
   ·结果与分析第100-105页
     ·GmGPX1 基因的克隆第100页
     ·GmGPX1 生物信息学分析第100-105页
   ·讨论第105-108页
第七章 大豆 GmHs1pro-1的基因克隆及表达分析第108-115页
   ·材料第108-109页
     ·植物材料第108页
     ·线虫繁殖与接种第108-109页
     ·主要酶及化学试剂第109页
     ·菌种及载体第109页
     ·生物信息学分析软件第109页
   ·方法第109-111页
     ·GmHslPro-1特异性引物及 Real Time PCR 引物的设计第109页
     ·核酸的提取及 cDNA 合成第109-110页
     ·GmHslPro-1基因的克隆第110页
     ·GmHslPro-1实时荧光定量 RT-PCR 表达分析第110-111页
   ·结果与分析第111-113页
     ·GmHslPro-1基因的克隆第111页
     ·GmHslPro-1生物信息学分析第111-112页
     ·GmHslPro-1基因根尖组织诱导表达分析第112-113页
   ·讨论第113-115页
第八章 讨论、结论及展望第115-120页
 1 讨论与结论第115-119页
   ·SSH-cDNA 文库的构建第115页
   ·SSH-cDNA 文库中抗病相关基因的筛选及生物学功能分析第115-116页
   ·Real Time PCR 检测抗病相关基因的表达谱分析第116-118页
   ·大豆谷胱甘肽过氧化物酶及 GmHslPro-1的克隆、生物信息学及诱导表达分析第118-119页
 2 下一步研究展望第119-120页
参考文献第120-134页
附录第134-139页
中英文缩写表第139-140页
致谢第140-141页
攻读学位期间发表的论文第141-142页
论文图表统计第142-143页

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