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鹤性别鉴定及线粒体遗传多样性与鹤系统发育分析

中文摘要第1-10页
Abstract第10-13页
第一章 鹤类简介第13-26页
 1 鹤的分类第13-14页
 2 世界十五种鹤的生物学习性及地理分布第14-18页
 3 鹤类的保护第18-24页
   ·就地保护第18-22页
     ·建立自然保护区第18-19页
     ·栖息地的保护与修复第19页
     ·加强保护鹤类迁飞途中的停歇地和越冬地第19-20页
     ·进行数量分布调查第20-21页
     ·开展宣传教育与国际合作第21-22页
   ·易地保护第22-23页
     ·笼养的种类和数量第22页
     ·人工饲养繁殖第22页
     ·野外放飞第22-23页
   ·法律与公约保护第23-24页
     ·《中华人民共和国野生动物保护法》和《国家重点保护野生动物名录》第23页
     ·世界自然保护联盟(IUCN)和国际鸟类保护联盟(Bird Life)第23页
     ·国际公约第23-24页
 4 鹤类研究现状第24-26页
第二章 鹤类性别鉴定第26-40页
 1 文献综述第26-31页
   ·形态学方法第26-27页
   ·细胞生物学方法第27页
   ·分子生物学方法第27-31页
     ·DNA 含量测定法第27页
     ·性染色体特异性DNA 探针法第27-28页
     ·PCR 法第28-31页
       ·CHD 基因鉴定法第28-29页
       ·ATP5A1 基因鉴定法第29页
       ·EE 0.6 序列鉴定法第29-30页
       ·鸟类性别鉴定的通用序列鉴定法第30-31页
 2 材料与方法第31-34页
   ·材料第31-33页
     ·实验材料第31页
     ·主要仪器第31-32页
     ·主要试剂第32页
     ·主要溶液的配制第32-33页
   ·方法第33-34页
     ·羽毛基因组DNA 的提取第33页
     ·性别相关基因的引物第33-34页
     ·PCR 扩增及检测第34页
 3 结果与分析第34-36页
   ·CHD 基因相关引物2550F/2718R 的扩增结果第34-35页
   ·EE0.6 序列相关引物组合的扩增结果第35-36页
 4 讨论第36-40页
   ·基因组DNA 的提取第36-37页
   ·CHD 基因、EE0.6 序列与性别鉴定第37-40页
第三章 鹤线粒体DNA 控制区序列遗传多样性及鹤系统发育关系分析第40-82页
 1 文献综述第40-53页
   ·研究遗传多样性的意义、内容和方法第40-48页
     ·遗传多样性的概念第40页
     ·野生动物遗传多样性概况第40-41页
     ·动物遗传多样性保护的意义第41-42页
     ·动物遗传多样性评价的内容第42-43页
     ·动物遗传多样性的研究方法第43-44页
       ·形态学方法第43-44页
       ·细胞遗传学方法第44页
       ·蛋白质检测方法第44页
       ·分子生物学方法第44页
     ·动物遗传多样性评价指标第44-48页
       ·平均数和变异系数第44-45页
       ·基因和基因型频率第45页
       ·遗传平衡检验第45页
       ·遗传变异的度量参数第45页
       ·遗传距离估计数学模型第45-47页
       ·系统发育分化的推断方法第47-48页
   ·线粒体DNA 控制区及其在保护遗传学中的应用第48-52页
     ·脊椎动物及鸟类线粒体DNA 的结构特性第48-50页
     ·鸟类线粒体DNA 控制区的结构特点及序列变异特征第50-52页
   ·线粒体DNA 在保护遗传学中的应用及其优劣之处第52-53页
 2 材料与方法第53-61页
   ·材料第53-55页
     ·实验材料第53-54页
     ·主要仪器第54页
     ·主要试剂第54页
     ·菌株与质粒第54页
     ·主要溶液的配制第54-55页
   ·方法第55-61页
     ·从血液中提取基因组DNA第55-56页
     ·利用通用引物扩增、克隆鹤线粒体DNA 控制区序列片段第56-59页
       ·利用通用引物扩增鹤线粒体DNA 控制区部分序列第56-57页
       ·扩增所得片段的电泳检测第57页
       ·扩增所得DNA 片段的克隆第57-59页
         ·DNA 纯化第57页
         ·感受态细胞的制备第57-58页
         ·连接第58页
         ·转化第58页
         ·筛选第58-59页
         ·重组质粒DNA 的小规模提取和鉴定第59页
       ·测序第59页
       ·数据分析第59页
     ·利用自行设计的引物进行鹤线粒体 DNA 控制区序列的多态性分析第59-61页
       ·利用自行设计的引物进行PCR 扩增第59-60页
       ·扩增所得DNA 片段的电泳检测第60页
       ·扩增所得DNA 片段的克隆和测序第60-61页
       ·数据分析第61页
     ·统计方法及软件应用第61页
       ·核苷酸序列多态性分析第61页
       ·单倍型间的系统进化分析第61页
       ·单倍型间的网络分析第61页
 3 结果与分析第61-77页
   ·通用引物对鹤线粒体DNA 控制区序列的扩增、克隆、测序结果第61-63页
     ·通用引物扩增产物的电泳检测结果第62页
     ·通用引物扩增产物的克隆结果第62-63页
     ·测序结果第63页
     ·数据分析第63页
   ·利用自行设计的引物对鹤线粒体DNA 控制区序列的扩增、克隆与测序第63-65页
     ·引物BZ-For/BZ-Rev、BZ-S/SY-A 对鹤进行PCR 扩增的结果第63-64页
     ·扩增产物单克隆的PCR 检测结果第64-65页
     ·测序结果第65页
     ·数据分析结果第65页
   ·鹤线粒体DNA 控制区部分序列的遗传多样性第65-69页
     ·鹤线粒体DNA 控制区部分序列的序列长度与碱基组成第65页
     ·序列的核苷酸多态位点变异第65-67页
     ·序列的核苷酸多态位点的变异类型第67页
     ·四个鹤群体mtDNA 控制区单倍型第67-69页
   ·四个鹤群体mtDNA 控制区部分序列的遗传结构第69-72页
     ·四个鹤群体内单倍型多样度第69页
     ·四个鹤群体内核苷酸多样度第69页
     ·四个鹤群体间核苷酸多态性第69-70页
     ·四种鹤群体历史动态分析第70页
     ·四种鹤群体间遗传距离第70-71页
     ·分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)第71-72页
   ·mtDNA 控制区单倍型的分子系统树第72-76页
   ·四个鹤群体控制区序列单倍型网络图第76-77页
 4 讨论第77-82页
   ·鹤线粒体DNA 控制区特异性引物的设计第77页
   ·四个鹤群体mtDNA 控制区部分序列的遗传多态性第77-79页
   ·四个鹤群体内线粒体DNA 控制区遗传多样性第79-80页
   ·四个鹤群体间线粒体DNA 控制区遗传多样性第80-81页
   ·鹤的系统发育关系分析第81-82页
全文结论第82-84页
参考文献第84-96页
致谢第96-98页
攻读硕士学位期间发表的学术论文目录第98页
攻读硕士学位期间申请专利目录第98-99页

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