| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略语 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-41页 |
| ·微生物基因组学 | 第12-24页 |
| ·微生物基因组学的发展历史 | 第12-14页 |
| ·微生物基因组学的研究进展 | 第14-24页 |
| ·微生物基因组的物理结构和遗传组成 | 第15-16页 |
| ·微生物基因组的进化 | 第16-18页 |
| ·微生物代谢 | 第18-21页 |
| ·寻找微生物基因组中的致病因子 | 第21-23页 |
| ·小结与展望 | 第23-24页 |
| ·蜡状芽胞杆菌群的基因组 | 第24-34页 |
| ·基因组测序情况概述 | 第24-27页 |
| ·炭疽芽胞杆菌 | 第25-26页 |
| ·蜡状芽胞杆菌 | 第26页 |
| ·苏云金芽胞杆菌 | 第26-27页 |
| ·典型菌株的染色体分析 | 第27-30页 |
| ·炭疽芽胞杆菌菌株Ames | 第27-28页 |
| ·蜡状芽胞杆菌菌株ATCC 14579 | 第28-30页 |
| ·基因组比较 | 第30-34页 |
| ·染色体的保守性 | 第30-31页 |
| ·共同祖先 | 第31-32页 |
| ·基因组的可塑性以及环境适应性 | 第32-33页 |
| ·致病性 | 第33-34页 |
| ·苏云金芽胞杆菌研究进展 | 第34-38页 |
| ·基本生物学特征 | 第34-35页 |
| ·杀虫晶体蛋白和基因 | 第35-37页 |
| ·基因分类 | 第35-36页 |
| ·蛋白的结构 | 第36-37页 |
| ·蛋白的作用机理 | 第37页 |
| ·质粒 | 第37-38页 |
| ·菌株YBT-1520简介 | 第38页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第38-41页 |
| 2 材料与方法 | 第41-44页 |
| ·基因组测序和拼接 | 第41-42页 |
| ·基因组注释和分析 | 第42-44页 |
| ·基因预测和相关分析 | 第42页 |
| ·比较基因组分析 | 第42-44页 |
| ·基于KEGG的代谢途径比较 | 第42-43页 |
| ·染色体间的插入/缺失分析 | 第43-44页 |
| 3 结果与讨论 | 第44-97页 |
| ·YBT-1520染色体的初步分析 | 第44-64页 |
| ·基本特征 | 第44-45页 |
| ·编码的毒性因子 | 第45-48页 |
| ·基因调控 | 第48-54页 |
| ·可能被PlcR蛋白调控的ORF | 第48-51页 |
| ·双组分调控系统 | 第51-54页 |
| ·与蜡状芽胞杆菌群中其它典型菌株的比较 | 第54-63页 |
| ·染色体间的整体比较 | 第54-59页 |
| ·基于KEGG数据库的代谢途径比较 | 第59-62页 |
| ·在蜡状芽胞杆菌群中的特有基因 | 第62-63页 |
| ·小结 | 第63-64页 |
| ·YBT-1520质粒的初步分析 | 第64-97页 |
| ·质粒概述 | 第64页 |
| ·质粒pBMB131的初步分析 | 第64-77页 |
| ·基本特征 | 第64-67页 |
| ·复制 | 第67-68页 |
| ·与杀虫有关的毒性因子 | 第68-70页 |
| ·调控蛋白 | 第70页 |
| ·可移动的遗传因子 | 第70-72页 |
| ·其它可能影响表型的ORF | 第72页 |
| ·与相似质粒的比较以及pBMB131中潜在致病岛的发现 | 第72-77页 |
| ·质粒pBMB95的初步分析 | 第77-80页 |
| ·基本特征 | 第77-78页 |
| ·复制 | 第78页 |
| ·杀虫晶体蛋白 | 第78-79页 |
| ·调控蛋白 | 第79页 |
| ·可移动的遗传因子 | 第79页 |
| ·其它可能影响表型的ORF | 第79-80页 |
| ·质粒pBMB69的初步分析 | 第80-83页 |
| ·基本特征 | 第80页 |
| ·复制 | 第80-81页 |
| ·杀虫晶体蛋白 | 第81页 |
| ·调控蛋白 | 第81-83页 |
| ·可移动的遗传因子 | 第83页 |
| ·其它可能影响表型的ORF | 第83页 |
| ·质粒pBMB67的初步分析 | 第83-92页 |
| ·基本特征 | 第83-84页 |
| ·控制区域 | 第84-88页 |
| ·转移区域 | 第88-90页 |
| ·主要由可移动的遗传因子组成的区域 | 第90页 |
| ·与致病质粒pXO1的比较 | 第90-92页 |
| ·YBT-1520中的其它质粒 | 第92-95页 |
| ·小结 | 第95-97页 |
| 4 总结与展望 | 第97-99页 |
| ·总结 | 第97-98页 |
| ·展望 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 附录1 文章发表情况 | 第118-119页 |
| 附录2 质粒pBMB131的DNA序列 | 第119-129页 |
| 附录3 质粒pBMB95的DNA序列 | 第129-137页 |
| 附录4 质粒pBMB69的DNA序列 | 第137-143页 |
| 附录5 质粒pBMB12的DNA序列 | 第143-144页 |
| 附录6 质粒pBMB9的DNA序列 | 第144-145页 |
| 附录7 质粒pBMB8的DNA序列 | 第145页 |