| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-19页 |
| ·研究背景 | 第11-17页 |
| ·蛋白质相互作用网络研究的目的及意义 | 第11-12页 |
| ·蛋白质相互作用网络分析的研究现状 | 第12-16页 |
| ·蛋白质相互作用网络研究面临的困难与挑战 | 第16-17页 |
| ·论文的主要工作与创新 | 第17-18页 |
| ·论文结构 | 第18-19页 |
| 第二章 常用的数据库、工具软件及评价指标 | 第19-30页 |
| ·常用数据库 | 第19-23页 |
| ·工具软件 | 第23-27页 |
| ·常用的网络特征度量和网络分析评价指标 | 第27-29页 |
| ·相似性评价指标 | 第28页 |
| ·有效性评价指标 | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 利用谱分析法挖掘蛋白质相互作用网络中的特征模式 | 第30-41页 |
| ·谱分析法 | 第30-31页 |
| ·拓扑结构的表示和识别 | 第31-32页 |
| ·拓扑结构的表示 | 第31页 |
| ·拓扑模式识别 | 第31-32页 |
| ·数据来源 | 第32页 |
| ·利用谱分析法挖掘蛋白质相互作用网络中的特征模式 | 第32-34页 |
| ·算法步骤 | 第32-33页 |
| ·分析结果的评价 | 第33-34页 |
| ·实验结果与分析 | 第34-40页 |
| ·实验结果 | 第34页 |
| ·分析与讨论 | 第34-40页 |
| ·本章小结 | 第40-41页 |
| 第四章 利用谱分析法划分蛋白质相互作用网络中的社团 | 第41-52页 |
| ·复杂网络中的社团结构 | 第41-44页 |
| ·复杂网络 | 第41-43页 |
| ·复杂网络中的社团结构 | 第43-44页 |
| ·谱平分法 | 第44-45页 |
| ·谱平分法的基本思想 | 第44-45页 |
| ·基于规范化邻接矩阵的谱平分法 | 第45页 |
| ·蛋白质数据库及评价方法 | 第45-46页 |
| ·蛋白质数据库 | 第45页 |
| ·评价方法 | 第45-46页 |
| ·利用谱分析法划分蛋白质相互作用网络的社团 | 第46-51页 |
| ·数据集合 | 第46-47页 |
| ·算法步骤 | 第47页 |
| ·功能注释 | 第47-49页 |
| ·社团的相关系数 | 第49页 |
| ·参数选择 | 第49-51页 |
| ·本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章 研究工作总结与展望 | 第52-54页 |
| ·结论 | 第52-53页 |
| ·进一步研究的建议 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第62-63页 |
| 攻读硕士期间参加的科研工作 | 第63页 |