| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-34页 |
| ·酸性矿坑水的微生物多样性 | 第12-17页 |
| ·自养和异养生命形式 | 第13-14页 |
| ·温度对嗜酸性微生物的约束 | 第14-16页 |
| ·嗜酸性微生物对分子氧的反应 | 第16-17页 |
| ·AMD环境中嗜酸性微生物的基本特征 | 第17页 |
| ·酸性矿坑水中的混合群落及微生物相互作用 | 第17-20页 |
| ·竞争 | 第17-19页 |
| ·捕食 | 第19页 |
| ·互利共生 | 第19页 |
| ·协同作用 | 第19-20页 |
| ·嗜酸性微生物的能量代谢 | 第20-22页 |
| ·铁作为能源 | 第20-21页 |
| ·硫作为能源 | 第21-22页 |
| ·其它类型能源 | 第22页 |
| ·嗜酸性微生物在冶金中的应用 | 第22-24页 |
| ·生物浸出机制 | 第22-23页 |
| ·生物浸出操作系统 | 第23-24页 |
| ·环境微生物多样性的常用分子生物学分析方法 | 第24-28页 |
| ·GC含量分析 | 第24-25页 |
| ·核酸分子杂交法 | 第25-26页 |
| ·PCR基础的分析方法 | 第26-28页 |
| ·基因序列系统发育分析法 | 第28页 |
| ·基因芯片技术在环境微生物群落多样性及功能研究中的应用 | 第28-31页 |
| ·用于环境微生物研究的基因芯片 | 第28-30页 |
| ·基因芯片在环境微生物研究中应用的技术难点 | 第30-31页 |
| ·本文研究内容 | 第31-34页 |
| ·研究内容与目的 | 第31页 |
| ·研究技术路线 | 第31-32页 |
| ·本文研究结果与意义 | 第32-34页 |
| 第二章 银山铅锌矿酸性矿坑水微生物16S rRNA基因分子多样性研究 | 第34-46页 |
| ·前言 | 第34-35页 |
| ·材料与方法 | 第35-37页 |
| ·样点描述及样品采集 | 第35页 |
| ·样品地球化学性质分析 | 第35页 |
| ·DNA抽提及纯化 | 第35页 |
| ·16S rRNA基因的PCR扩增及纯化 | 第35-36页 |
| ·16S rRNA基因的克隆及限制性酶切 | 第36页 |
| ·序列测定和系统发育分析 | 第36页 |
| ·统计方法 | 第36-37页 |
| ·核苷酸序列登记号 | 第37页 |
| ·结果 | 第37-43页 |
| ·样品的地理化学性状 | 第37页 |
| ·16Sr RNA基因克隆文库的RFLP分析 | 第37-40页 |
| ·16S rRNA基因系统发育分析 | 第40-43页 |
| ·讨论与分析 | 第43-45页 |
| ·本章小结 | 第45-46页 |
| 第三章 银山铅锌矿AMD微生物群落gyrB基因分子多样性及与16S rRNA多样性比较 | 第46-56页 |
| ·前言 | 第46页 |
| ·材料与方法 | 第46-48页 |
| ·样点描述及样品采集 | 第46-47页 |
| ·样品地球化学性质分析 | 第47页 |
| ·DNA抽提及纯化 | 第47页 |
| ·gyrB基因的PCR扩增及纯化 | 第47页 |
| ·gyrB基因的克隆及限制性酶切 | 第47页 |
| ·序列测定和系统发育分析 | 第47页 |
| ·统计方法 | 第47页 |
| ·核苷酸序列登记号 | 第47-48页 |
| ·结果 | 第48-53页 |
| ·样品的地理化学性状 | 第48页 |
| ·gyrB基因克隆文库的RFLP分析 | 第48-50页 |
| ·gyrB基因系统发育分析及与16S rRNA多样性比较 | 第50-53页 |
| ·讨论与分析 | 第53-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第四章 应用寡核苷酸基因芯片分析AMD环境和浸矿体系微生物群落结构及其影响因子 | 第56-72页 |
| ·前言 | 第56页 |
| ·材料与方法 | 第56-60页 |
| ·样点描述和样品采集 | 第56-57页 |
| ·样品的地球化学性质分析 | 第57页 |
| ·DNA提取与纯化 | 第57页 |
| ·50mer寡核苷酸基因芯片的设计与构建 | 第57-58页 |
| ·DNA标记,芯片杂交,图像和数据处理 | 第58-59页 |
| ·统计学方法 | 第59-60页 |
| ·结果 | 第60-69页 |
| ·样品地理化学性状 | 第60页 |
| ·微生物群落多样性、相似性与特异性 | 第60-61页 |
| ·地球化学性质和微生物群落结构的DCA分析 | 第61-63页 |
| ·16S rRNA和功能基因的聚类分析 | 第63页 |
| ·样品的系统发育多样性和区别 | 第63-66页 |
| ·功能基因多样性和区别 | 第66-68页 |
| ·地球化学性质与微生物群落与结构之间的关系 | 第68-69页 |
| ·讨论与分析 | 第69-71页 |
| ·本章小结 | 第71-72页 |
| 第五章 结论 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 攻读学位期间主要研究成果 | 第88页 |