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银山铅锌矿酸性矿坑水微生物群落结构分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 绪论第12-34页
   ·酸性矿坑水的微生物多样性第12-17页
     ·自养和异养生命形式第13-14页
     ·温度对嗜酸性微生物的约束第14-16页
     ·嗜酸性微生物对分子氧的反应第16-17页
   ·AMD环境中嗜酸性微生物的基本特征第17页
   ·酸性矿坑水中的混合群落及微生物相互作用第17-20页
     ·竞争第17-19页
     ·捕食第19页
     ·互利共生第19页
     ·协同作用第19-20页
   ·嗜酸性微生物的能量代谢第20-22页
     ·铁作为能源第20-21页
     ·硫作为能源第21-22页
     ·其它类型能源第22页
   ·嗜酸性微生物在冶金中的应用第22-24页
     ·生物浸出机制第22-23页
     ·生物浸出操作系统第23-24页
   ·环境微生物多样性的常用分子生物学分析方法第24-28页
     ·GC含量分析第24-25页
     ·核酸分子杂交法第25-26页
     ·PCR基础的分析方法第26-28页
     ·基因序列系统发育分析法第28页
   ·基因芯片技术在环境微生物群落多样性及功能研究中的应用第28-31页
     ·用于环境微生物研究的基因芯片第28-30页
     ·基因芯片在环境微生物研究中应用的技术难点第30-31页
   ·本文研究内容第31-34页
     ·研究内容与目的第31页
     ·研究技术路线第31-32页
     ·本文研究结果与意义第32-34页
第二章 银山铅锌矿酸性矿坑水微生物16S rRNA基因分子多样性研究第34-46页
   ·前言第34-35页
   ·材料与方法第35-37页
     ·样点描述及样品采集第35页
     ·样品地球化学性质分析第35页
     ·DNA抽提及纯化第35页
     ·16S rRNA基因的PCR扩增及纯化第35-36页
     ·16S rRNA基因的克隆及限制性酶切第36页
     ·序列测定和系统发育分析第36页
     ·统计方法第36-37页
     ·核苷酸序列登记号第37页
   ·结果第37-43页
     ·样品的地理化学性状第37页
     ·16Sr RNA基因克隆文库的RFLP分析第37-40页
     ·16S rRNA基因系统发育分析第40-43页
   ·讨论与分析第43-45页
   ·本章小结第45-46页
第三章 银山铅锌矿AMD微生物群落gyrB基因分子多样性及与16S rRNA多样性比较第46-56页
   ·前言第46页
   ·材料与方法第46-48页
     ·样点描述及样品采集第46-47页
     ·样品地球化学性质分析第47页
     ·DNA抽提及纯化第47页
     ·gyrB基因的PCR扩增及纯化第47页
     ·gyrB基因的克隆及限制性酶切第47页
     ·序列测定和系统发育分析第47页
     ·统计方法第47页
     ·核苷酸序列登记号第47-48页
   ·结果第48-53页
     ·样品的地理化学性状第48页
     ·gyrB基因克隆文库的RFLP分析第48-50页
     ·gyrB基因系统发育分析及与16S rRNA多样性比较第50-53页
   ·讨论与分析第53-55页
   ·本章小结第55-56页
第四章 应用寡核苷酸基因芯片分析AMD环境和浸矿体系微生物群落结构及其影响因子第56-72页
   ·前言第56页
   ·材料与方法第56-60页
     ·样点描述和样品采集第56-57页
     ·样品的地球化学性质分析第57页
     ·DNA提取与纯化第57页
     ·50mer寡核苷酸基因芯片的设计与构建第57-58页
     ·DNA标记,芯片杂交,图像和数据处理第58-59页
     ·统计学方法第59-60页
   ·结果第60-69页
     ·样品地理化学性状第60页
     ·微生物群落多样性、相似性与特异性第60-61页
     ·地球化学性质和微生物群落结构的DCA分析第61-63页
     ·16S rRNA和功能基因的聚类分析第63页
     ·样品的系统发育多样性和区别第63-66页
     ·功能基因多样性和区别第66-68页
     ·地球化学性质与微生物群落与结构之间的关系第68-69页
   ·讨论与分析第69-71页
   ·本章小结第71-72页
第五章 结论第72-74页
参考文献第74-87页
致谢第87-88页
攻读学位期间主要研究成果第88页

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