摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-10页 |
第一章 序言 | 第10-16页 |
(一) 可移动元素概述 | 第10-12页 |
(二) 基因组中的L1-LINE元件 | 第12-14页 |
(三) 基因组中的Alu-SINE元件 | 第14-16页 |
第二章 L1编码蛋白k-mer频数分布的研究 | 第16-33页 |
(一) 数据库构建 | 第16页 |
(二) L1编码蛋白k-mer频数分布的周期性 | 第16-22页 |
1 二项分布与泊松分布 | 第16页 |
2 k-mer频数分布 | 第16-17页 |
3 Z score定义 | 第17页 |
4 结果与分析 | 第17-22页 |
(三) Z score间隔内氨基酸对出现的概率所遵循的规律 | 第22-24页 |
1 Weibull分布 | 第22页 |
2 结果与分析 | 第22-24页 |
(四) 五种泛函的特性研究 | 第24-33页 |
1 在"字(k-mer)"域内的Shannon信息熵 | 第24页 |
2 信息冗余量 | 第24-25页 |
3 k-mer频数的相对均方偏差值 | 第25页 |
4 在"频数"域内的Shannon信息熵 | 第25页 |
5 在"频数"域内的Fisher信息熵 | 第25-26页 |
6 结果与分析 | 第26-33页 |
第三章 Alu中剪接位点的研究 | 第33-47页 |
(一) 引言 | 第33页 |
(二) 数据库的建立 | 第33页 |
(三) 研究方法 | 第33-38页 |
1 Pearson定理 | 第33-34页 |
2 关联量 | 第34-38页 |
(四) 结果与分析 | 第38-45页 |
1 Alu中剪接位点的分布特征 | 第38-43页 |
2 Alu序列中二联体的关联对Alu中剪接位点的影响 | 第43-45页 |
(五) 讨论 | 第45-47页 |
参考文献 | 第47-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第53页 |