| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 前言 | 第12-14页 |
| 文献综述 | 第14-33页 |
| 1 分子标记的种类 | 第14-17页 |
| 2 分子标记在水稻遗传研究中的应用 | 第17-27页 |
| 参考文献 | 第27-33页 |
| 第一章 水稻内含子长度多态性标记的开发 | 第33-46页 |
| ·材料和方法 | 第34-36页 |
| ·水稻基因组和cDNA序列数据来源 | 第34页 |
| ·ILPs的搜寻 | 第34页 |
| ·ILP标记引物设计和e-PCR验证 | 第34-35页 |
| ·候选ILP标记的实验验证和评价 | 第35-36页 |
| ·结果和分析 | 第36-41页 |
| ·水稻ILP标记的数量、分布和密度 | 第36页 |
| ·候选ILP标记 | 第36-39页 |
| ·含子长度差异分布 | 第39-40页 |
| ·ILP标记的实验验证 | 第40-41页 |
| ·WIN-PCR验证 | 第41页 |
| ·ILP数据库 | 第41页 |
| ·讨论 | 第41-46页 |
| ·水稻全基因组ILP估计数量 | 第41-42页 |
| ·ILP标记分布不均匀性 | 第42页 |
| ·ILP标记的优点 | 第42-46页 |
| 第二章 水稻ILP标记特点分析 | 第46-57页 |
| ·材料和方法 | 第46-47页 |
| ·ILP标记在水稻中的通用性和多态性检验 | 第46-47页 |
| ·ILP标记的籼粳亚种特异性检验 | 第47页 |
| ·ILP标记在不同物种间的通用性检验 | 第47页 |
| ·结果与分析 | 第47-52页 |
| ·ILP标记的通用性和多态性 | 第47-49页 |
| ·ILP标记的籼粳亚种特异性 | 第49-50页 |
| ·SSILP标记分布和所在基因的功能 | 第50-51页 |
| ·ILP标记在其它物种中的通用性 | 第51-52页 |
| ·讨论 | 第52-57页 |
| ·ILP标记的通用性和多态性 | 第52页 |
| ·SSILP形成的机理和数量 | 第52-53页 |
| ·SSILP的应用 | 第53-54页 |
| ·不同物种通用ILP标记的开发 | 第54-57页 |
| 第三章 水稻ILP标记的应用:Ⅰ.分子遗传图谱的构建 | 第57-68页 |
| ·材料与方法 | 第58-59页 |
| ·水稻材料 | 第58页 |
| ·作图群体 | 第58页 |
| ·DNA的提取 | 第58页 |
| ·ILP引物、PCR扩增和电泳检测 | 第58页 |
| ·结果统计和分子连锁图谱的构建 | 第58-59页 |
| ·结果与分析 | 第59-63页 |
| ·水稻ILP遗传图谱的构建 | 第59页 |
| ·偏分离分析 | 第59-63页 |
| ·讨论 | 第63-68页 |
| ·构建水稻遗传图谱的群体选择 | 第63页 |
| ·标记的聚集和标记的间隙 | 第63-64页 |
| ·影响分子标记偏分离的原因 | 第64-68页 |
| 第四章 水稻ILP标记的应用:Ⅱ.染色体单片段替换系构建 | 第68-85页 |
| ·材料与方法 | 第68-71页 |
| ·水稻材料 | 第68-69页 |
| ·试验方法 | 第69-71页 |
| ·标记检测的方法 | 第71页 |
| ·结果与分析 | 第71-81页 |
| ·BC_1F_1分析 | 第71-73页 |
| ·BC_2F_1分析 | 第73页 |
| ·BC_3F_1分析 | 第73页 |
| ·BC_4F_1分析 | 第73-74页 |
| ·回交各世代比较分析 | 第74-76页 |
| ·单片段替换系群体分析 | 第76-81页 |
| ·讨论 | 第81-85页 |
| 第五章 水稻ILP标记的应用:Ⅲ.品种亲缘关系分析 | 第85-94页 |
| ·材料和方法 | 第86-87页 |
| ·供试材料 | 第86页 |
| ·分子标记 | 第86页 |
| ·DNA提取、PCR反应和电泳 | 第86页 |
| ·数据分析 | 第86-87页 |
| ·结果与分析 | 第87-90页 |
| ·ILP和SSR标记的多态性水平 | 第87页 |
| ·SSR和ILP标记聚类分析 | 第87-90页 |
| ·讨论 | 第90-94页 |
| 第六章 水稻ILP标记的应用:Ⅳ亚洲栽培稻进化研究 | 第94-104页 |
| ·材料和方法 | 第95页 |
| ·试验材料 | 第95页 |
| ·DNA提取、SSILP引物、PCR方法和凝胶电泳 | 第95页 |
| ·数据分析 | 第95页 |
| ·结果与分析 | 第95-100页 |
| ·SSILP在野生稻中的遗传多样性 | 第95-97页 |
| ·野生稻和栽培稻聚类分析 | 第97-99页 |
| ·野生稻TIAs和TJAs频率分布 | 第99-100页 |
| ·爪哇稻的起源 | 第100页 |
| ·讨论 | 第100-101页 |
| References | 第101-104页 |
| 附表I 本实验所用引物序列、染色体分布、退火温度、扩增产物长度和电泳方法 | 第104-109页 |
| 致谢 | 第109页 |
