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实时荧光PCR检测肠出血性大肠杆菌O157和禽流感H5亚型的研究

中文摘要第1-11页
英文摘要第11-14页
第一部分 实时荧光 PCR 检测肠出血性大肠杆菌 0157 的研究第14-62页
 1 引言第14-25页
   ·实时荧光PCR 应用的荧光探针技术第15-19页
     ·分子信标第15-16页
     ·TaqMan 探针或水解探针第16-17页
     ·杂交探针第17-18页
     ·双链荧光探针第18页
     ·荧光标记引物第18-19页
     ·SYBR Green I 荧光染料第19页
   ·实时荧光PCR 在临床检测上的应用第19-22页
   ·肠出血性大肠杆菌0157 的研究第22-25页
 2 材料与方法第25-35页
   ·实验材料第25页
   ·主要试剂第25-26页
   ·引物和Y 型荧光探针的设计与合成第26-28页
     ·检测rbf E 基因的引物和Y 型荧光探针的设计合成第26页
     ·茎、尾长度不同的Y 型荧光探针的设计合成第26-27页
     ·生物素探针捕获实验设计第27-28页
     ·其他毒力基因的设计合成第28页
   ·主要仪器第28-29页
   ·常用溶液的配制第29-30页
   ·实验方法第30-35页
     ·模板准备第30页
     ·rbf E 基因的扩增第30-31页
     ·Y 型荧光探针的熔解曲线第31页
     ·不同荧光探针的熔解曲线第31-32页
     ·Y 型荧光探针的特异性实验第32-33页
     ·荧光探针的灵敏度实验第33页
     ·其它实验第33-34页
     ·电泳检测第34-35页
 3 结果第35-45页
   ·普通PCR 对rbf E 基因片段的扩增结果第35页
   ·Y 型荧光探针的反应原理第35-37页
   ·Y 型荧光探针的熔解曲线第37-38页
   ·不同荧光探针的熔解曲线第38页
   ·Y 型荧光探针特异性实验结果第38-41页
     ·Y 型荧光探针与合成靶序列的变温反应第38-39页
     ·实时荧光PCR 反应检测样品的结果第39-41页
   ·Y 型荧光探针灵敏度实验结果第41页
   ·磁珠捕获实验结果第41-42页
   ·多重PCR 反应实验结果第42-45页
 4. 讨论第45-50页
   ·Y 型荧光探针的作用原理第45-46页
   ·Y 型荧光探针的优化第46-47页
   ·检测肠出血性大肠杆菌0157 的实时荧光PCR 体系第47-48页
   ·磁珠捕获体系和多重PCR 体系的建立第48-49页
   ·待解决的问题第49-50页
 小结第50-51页
 参考文献第51-62页
第二部分 实时荧光 PCR 检测禽流感 H5 亚型的研究第62-93页
 1 引言第62-66页
 2 材料与方法第66-74页
   ·实验材料第66页
   ·主要试剂第66页
   ·主要仪器第66页
   ·引物与荧光探针的设计与合成第66-67页
   ·常用溶液的配制第67页
   ·实验方法第67-74页
     ·禽流感病毒RNA 的提取第67-68页
     ·病毒RNA 的反转录第68页
     ·HA 基因的克隆第68-69页
     ·PCR 产物的纯化第69-70页
     ·DNA 连接反应第70页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第70页
     ·连接产物转化感受态细胞第70页
     ·阳性克隆的筛选第70-71页
     ·Y 型荧光探针的特异性实验第71-72页
     ·反转录-实时荧光PCR 体系的建立第72-73页
     ·Y 型荧光探针检测病毒RNA 特异性实验第73页
     ·Y 型荧光探针检测病毒RNA 灵敏度实验第73-74页
 3 结果第74-84页
   ·病毒RNA 反转录PCR 扩增的结果第74页
   ·pMD18-HA 质粒的构建第74-76页
   ·Y 型荧光探针的特异性实验第76-77页
     ·与靶序列的变温曲线实验第76页
     ·实时荧光PCR 检测pMD18-HA 实验第76-77页
   ·Y 型荧光探针检测病毒RNA 体系的优化第77-82页
   ·Y 型荧光探针检测H5 亚型禽流感病毒RNA 的特异性实验.第82页
   ·Y 型荧光探针检测病毒RNA 灵敏度的实验第82-84页
 4. 讨论第84-87页
 小结第87-88页
 参考文献第88-93页
附录第93-94页
 硕士期间获得奖励第93页
 硕士期间发表文章第93-94页
致谢第94页

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