| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-5页 |
| 符号与缩略语说明 | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-20页 |
| ·氮循环中的氨氧化细菌 | 第9-10页 |
| ·氮素循环 | 第9页 |
| ·硝化作用 | 第9页 |
| ·氨氧化作用 | 第9-10页 |
| ·氨氧化细菌的分类情况 | 第10-12页 |
| ·基于形态学的分类情况 | 第10-11页 |
| ·基于16 rDNA的分类情况 | 第11-12页 |
| ·氨氧化细菌的研究方法 | 第12-16页 |
| ·纯培养方法 | 第12-13页 |
| ·分子生物学研究方法 | 第13-16页 |
| ·氨氧化细菌在土壤中的多样性 | 第16-20页 |
| ·土壤中氨氧化细菌的种类 | 第16-17页 |
| ·土壤因素对氨氧化细菌群落结构的影响 | 第17-20页 |
| 2 研究意义与研究方法 | 第20-23页 |
| ·研究意义 | 第20-21页 |
| ·研究方法 | 第21-23页 |
| 3 土壤性质分析 | 第23-29页 |
| ·材料与方法 | 第23-26页 |
| ·取样地点与方法 | 第23页 |
| ·样品处理与保存 | 第23页 |
| ·土壤样品理化性质 | 第23页 |
| ·培养基与试剂 | 第23-25页 |
| ·平板活菌计数 | 第25页 |
| ·氨氧化细菌MPN计数 | 第25-26页 |
| ·结果与分析 | 第26-27页 |
| ·平板活菌计数结果 | 第26页 |
| ·氨氧化细菌MPN结果 | 第26-27页 |
| ·讨论 | 第27-29页 |
| 4 红壤荒草地土样总DNA的提取及纯化 | 第29-37页 |
| ·材料与方法 | 第29-33页 |
| ·取样地点 | 第29页 |
| ·试剂与仪器 | 第29-30页 |
| ·土壤总DNA的提取方法 | 第30-31页 |
| ·土壤总DNA的纯化 | 第31-33页 |
| ·提取及回收总DNA的纯度检验 | 第33页 |
| ·结果与分析 | 第33-35页 |
| ·三种提取方法的对比 | 第33-34页 |
| ·三种回收方法的对比 | 第34页 |
| ·扩增稳定性情况 | 第34-35页 |
| ·讨论 | 第35-37页 |
| 5. 红壤荒草地特异性16S rDNA文库的构建与初步分析 | 第37-48页 |
| ·材料与方法 | 第37-43页 |
| ·取样地点 | 第37页 |
| ·试剂与仪器 | 第37-38页 |
| ·大肠杆菌总DNA的提取 | 第38-39页 |
| ·细菌通用16S rRNA基因的PCR扩增 | 第39页 |
| ·特异性16S rRNA基因的扩增 | 第39-40页 |
| ·高效感受态细胞的制备 | 第40页 |
| ·PCR产物的T/A克隆 | 第40-41页 |
| ·酶连产物的转化 | 第41页 |
| ·文库的构建、检查与保存 | 第41页 |
| ·插入片段的扩增 | 第41-42页 |
| ·限制性内切酶酶切 | 第42页 |
| ·酶切产物的电泳分析 | 第42页 |
| ·文库指标分析 | 第42-43页 |
| ·序列测定 | 第43页 |
| ·系统发育分析 | 第43页 |
| ·结果分析 | 第43-46页 |
| ·巢式PCR扩增 | 第43-44页 |
| ·文库的RFLP分析 | 第44-45页 |
| ·文库分析 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-48页 |
| 6 氨氧化细菌富集液特异性16S rDNA文库的建立与初步分析 | 第48-57页 |
| ·材料与方法 | 第48-51页 |
| ·实验土样 | 第48页 |
| ·氨氧化细菌培养基 | 第48页 |
| ·对土样的富集培养 | 第48页 |
| ·总DNA提取与性质测定 | 第48页 |
| ·amoA基因扩增 | 第48-49页 |
| ·特异性16S rDNA扩增 | 第49页 |
| ·氨氧化细菌特异性16S rDNA文库的构建 | 第49-50页 |
| ·酶切分型 | 第50-51页 |
| ·库容分析 | 第51页 |
| ·测序比对 | 第51页 |
| ·序列登录号 | 第51页 |
| ·结果与分析 | 第51-55页 |
| ·富集效果检测 | 第51-52页 |
| ·富集液总DNA定量 | 第52-53页 |
| ·文库的RFLP分析 | 第53-54页 |
| ·多样性分析 | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-57页 |
| 总结 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |