| 第一章：概述 | 第1-21页 |
| ·研究意义 | 第9-11页 |
| ·分子动力学模拟的最新进展 | 第11-16页 |
| ·微孔 | 第11-12页 |
| ·扩散系数 | 第12-15页 |
| ·水和甲烷 | 第15-16页 |
| 本章小结 | 第16-17页 |
| 本章符号列表 | 第17-18页 |
| 本章参考文献 | 第18-21页 |
| 第二章：基础理论 | 第21-50页 |
| ·分子动力学模拟 | 第21-27页 |
| ·分子动力学的理论基础 | 第21-22页 |
| ·分子动力学的基本算法 | 第22-27页 |
| ·各类微孔的构型 | 第27-30页 |
| ·平板型微孔 | 第27-28页 |
| ·由单层粒子壁面构成的微孔 | 第28-29页 |
| ·由多层粒子壁面构成的微孔 | 第29-30页 |
| ·扩散系数 | 第30-43页 |
| ·扩散系数的微观物理意义 | 第30-32页 |
| ·相关函数 | 第32页 |
| ·Einstein方程和Green-Kubo方程 | 第32-35页 |
| ·计算速度自相关函数 | 第35-37页 |
| ·应用Green-Kubo方程计算混合物的扩散系数 | 第37-39页 |
| ·宏量下纯物质扩散系数的数学模型 | 第39-41页 |
| ·宏量下混合物扩散系数的数学模型 | 第41-43页 |
| ·水的势能模型 | 第43-45页 |
| ·早期水的势能模型 | 第43-44页 |
| ·水的SPC和SPC／E势能模型 | 第44-45页 |
| 本章小结 | 第45-46页 |
| 本章符号列表 | 第46-47页 |
| 本章参考文献 | 第47-50页 |
| 第三章：宏量条件下简单流体混合物扩散系数的分子动力学模拟 | 第50-63页 |
| ·宏量条件下简单流体混合物扩散系数的模拟 | 第50-57页 |
| ·结果和讨论 | 第57-58页 |
| T~* | 第58-60页 |
| 本章小结 | 第60-61页 |
| 本章符号列表 | 第61-62页 |
| 本章参考文献 | 第62-63页 |
| 第四章：“湿壁”窄缝孔中简单流体混合物扩散系数的分子动力学模拟 | 第63-70页 |
| ·“湿壁”窄缝孔中简单流体混合物扩散系数的模拟 | 第63-65页 |
| ·结果和讨论 | 第65-67页 |
| 本章小结 | 第67-68页 |
| 本章符号列表 | 第68-69页 |
| 本章参考文献 | 第69-70页 |
| 第五章：硅酸岩窄缝孔中流体混合物扩散系数的分子动力学模拟 | 第70-81页 |
| ·硅酸岩窄缝孔中流体混合物扩散系数的模拟 | 第70-74页 |
| ·硅酸岩窄缝孔 | 第70-73页 |
| ·参数设置 | 第73-74页 |
| ·结果与讨论 | 第74-79页 |
| ·模型Ⅰ | 第74-77页 |
| ·模型Ⅱ | 第77-79页 |
| 本章小结 | 第79-80页 |
| 本章符号列表 | 第80页 |
| 本章参考文献 | 第80-81页 |
| 第六章：硅酸岩窄缝孔中水／甲烷混合流体吸附现象的分子动力学模拟 | 第81-88页 |
| ·硅酸岩窄缝孔中水／甲烷混合流体的模拟 | 第81-82页 |
| ·结果与讨论 | 第82-86页 |
| 本章小结 | 第86-87页 |
| 本章符号列表 | 第87页 |
| 本章参考文献 | 第87-88页 |
| 第七章：硅酸岩窄缝孔中水自扩散系数的并行分子动力学模拟 | 第88-107页 |
| ·概述 | 第88-92页 |
| ·从串行到并行是计算机模拟发展方向 | 第88-89页 |
| ·并行分子动力学的基本算法 | 第89-91页 |
| ·并行分子动力学的最新进展 | 第91-92页 |
| ·计算机集群与并行分子动力学模拟的基本设置 | 第92-94页 |
| ·结果与讨论 | 第94-103页 |
| ·集群建立初的效率 | 第94-96页 |
| ·改进SD算法 | 第96-100页 |
| ·宏量条件下水的速度自相关函数 | 第100页 |
| ·受限于硅酸岩窄缝中水分子的速度自相关函数 | 第100-101页 |
| ·并行算法的计算效率 | 第101-103页 |
| 本章小结 | 第103-104页 |
| 本章符号列表 | 第104-105页 |
| 本章参考文献 | 第105-107页 |
| 结论与展望 | 第107-109页 |
| 附录A 缩略语索引 | 第109-110页 |
| 附录B 致谢 | 第110-111页 |
| 附录C 作者简介 | 第111页 |
