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低木质素转基因挪威云杉的植株再生及功能基因表达的微阵列检测

目录第1-8页
论文摘要第8-7页
缩略词简表第7-10页
第一部分 文献综述第10-26页
 1 前言第10-11页
 2 挪威云杉的转基因育种第11-12页
 3 木质素生物合成的转基因调控第12-20页
   ·木质素的种类和分布第12-14页
   ·木质素生物合成途径第14页
   ·木质素生物合成的基因调控第14-19页
     ·木质素生物合成的基因调控策略第14-15页
     ·木质素生物合成基因调控研究现状第15页
     ·木质素生物合成相关基因的分离和克隆第15-18页
     ·反义技术调控第18-19页
     ·新的突变体第19页
   ·木质素基因调控研究的趋势第19-20页
 4 微阵列(Microarray)技术第20-26页
   ·微阵列技术的发展第20-21页
   ·微阵列技术基础第21-22页
   ·微阵列技术的应用第22-26页
     ·DNA序列测定第22页
     ·基因表达水平检测第22-23页
     ·基因诊断第23页
     ·基因点突变和多态性检测第23页
     ·新药开发第23-24页
     ·微阵列在农林业中的应用及展望第24-26页
第二部分 论文正文第26-64页
 1 低木质素转基因挪威云杉的胚胎诱导和植株再生第26-31页
   ·引言第26页
   ·材料和方法第26-28页
     ·实验材料第26页
     ·实验方法第26-28页
   ·结果与分析第28-29页
   ·结论与讨论第29-31页
 2 转基因挪威云杉反义CCR基因表达的RT-PCR鉴定第31-38页
   ·引言第31页
   ·材料和方法第31-34页
     ·实验材料第31-32页
     ·实验方法第32-34页
       ·RNA的分离第32-33页
         ·分离试剂第32页
         ·方法步骤第32-33页
       ·RT-PCR鉴定第33-34页
         ·RNA纯化第33页
         ·反转录合成cDNA第33页
         ·PCR扩增第33页
         ·凝胶电泳检测第33-34页
   ·结果与分析第34-35页
     ·总RNA的分离第34页
     ·RT-PCR检测第34-35页
   ·结论与讨论第35-38页
     ·结论第35-36页
     ·总RNA分离第36页
     ·RT-PCR检测第36-38页
 3 转基因挪威云杉功能基因表达的微阵列检测第38-63页
   ·引言第38页
   ·材料和方法第38-47页
     ·实验材料第38-39页
     ·实验方法第39-47页
       ·微阵列芯片的构建第39页
         ·基因的筛选第39页
         ·芯片基因的扩增第39页
       ·尼龙芯片膜的印制第39-41页
       ·探针的标记和纯化第41-42页
       ·杂交第42-43页
       ·严谨洗膜和荧光检测第43-44页
       ·数据收集和分析第44-47页
         ·数据收集第44页
         ·数据的正态化处理第44-46页
         ·数据的分析第46-47页
           ·基因表达强度的频率分布第46页
           ·基因表达强度的相关性第46页
           ·基因表达差异显著性检验第46-47页
   ·结果与分析第47-58页
     ·基因表达强度频率分布的正态检验第47-48页
     ·不同亚系和发育形态与对照的相关性第48-47页
       ·回归相关第48-49页
       ·Pearson相关第49-47页
     ·基因表达的差异显著性检验第47-52页
       ·四种不同正态化方法的表达差异检验比较第50页
       ·各亚系在不同发育阶段与对照比较的表达差异检验第50-51页
       ·不同发育阶段的表达差异检验第51-52页
     ·表达差异的功能基因第52-57页
       ·各亚系与对照比较的表达差异第53-54页
       ·三个不同发育阶段间比较的表达差异第54-57页
     ·与木质素生物合成有关的基因的表达分析第57-58页
   ·结论与讨论第58-63页
     ·转基因亚系的微阵列检测结果第58-59页
     ·有关基因的筛选和微阵列的构建第59页
     ·有关微阵列操作程序的优化第59-60页
     ·有关芯片膜信号强弱和噪信背景第60-61页
     ·有关数据收集和分析第61页
     ·关于木质素生物合成的转基因调控应用和展望第61-63页
 4 本研究的创新点第63-64页
主要参考文献第64-71页
Abstract(英文摘要)第71-74页
致谢第74-75页
作者简介第75-77页
附录第77-120页
 附表1: 微阵列构建的384个基因功能简表第78-86页
 附表2: 四个96孔母碟的基因构建序列第86-88页
 附表3: 三个芯片膜印制碟的基因构建序列第88-90页
 附表4: 各个亚系在不同发育阶段间的Pearson相关系数第90-91页
 附表5: 各亚系与对照比较及三个不同发育阶段比较的基因表达差异显著性检验第91-105页
 附表6: 转基因亚系在各个生长发育阶段与对照比较的基因表达差异显著性检验第105-119页
 附图1: 各亚系表达强度平均值及对数变换后的频率分布比较第119-120页
 附图2: 各亚系经不同方法正态化后与对照的线性回归比较第120页

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