| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-26页 |
| ·EST技术概述 | 第7-8页 |
| ·EST分析常用数据库 | 第8-13页 |
| ·EST序列分析流程 | 第13-21页 |
| ·cDNA文库构建 | 第14页 |
| ·EST随机测序 | 第14-15页 |
| ·序列前处理 | 第15页 |
| ·聚类和拼接 | 第15-17页 |
| ·EST数据注释 | 第17-18页 |
| ·基因功能分类 | 第18-19页 |
| ·其他分析方法 | 第19-21页 |
| ·EST的应用 | 第21-23页 |
| ·基因图谱的绘制 | 第21页 |
| ·基因表达谱的分析 | 第21-22页 |
| ·鉴定基因和发现新基因 | 第22页 |
| ·电子PCR克隆 | 第22-23页 |
| ·发现SNP | 第23页 |
| ·用于制备cDNA微阵列 | 第23页 |
| ·EST技术的局限性 | 第23-24页 |
| ·七鳃鳗研究进展 | 第24-25页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第25-26页 |
| 第二章 日本七鳃鳗肝脏cDNA文库的构建与EST测序 | 第26-28页 |
| ·材料与方法 | 第26-27页 |
| ·材料 | 第26页 |
| ·方法 | 第26-27页 |
| ·cDNA文库的质量鉴定 | 第27页 |
| ·文库的效价 | 第27页 |
| ·文库中cDNA片段长度的检测 | 第27页 |
| ·讨论 | 第27-28页 |
| 第三章 日本七鳃鳗肝脏表达序列表达标签(ESTs)分析 | 第28-49页 |
| ·方法 | 第28-30页 |
| ·原始数据的预处理 | 第28页 |
| ·EST拼接及全长cDNA的检测 | 第28页 |
| ·ORF的预测和3'UTR分析 | 第28-29页 |
| ·EST注释、功能分类及新基因的寻找 | 第29页 |
| ·转录组的比较分析 | 第29-30页 |
| ·结果与分析 | 第30-39页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏cDNA文库EST测序 | 第30页 |
| ·EST拼接、片段重叠群分析和全长cDNA拼接检测 | 第30-34页 |
| ·3'UTR区microRNA靶标分析 | 第34页 |
| ·EST的注释、蛋白功能分类和新基因的发现 | 第34-38页 |
| ·转录组比较分析 | 第38-39页 |
| ·讨论 | 第39-49页 |
| ·拼接软件的选择 | 第39-40页 |
| ·全长cDNA的预测以及ORF分析 | 第40-41页 |
| ·3'UTR区microRNA靶标预测的意义 | 第41-42页 |
| ·日本七鳃鳗肝脏转录组的注释 | 第42-45页 |
| ·转录组的比较 | 第45-49页 |
| 第四章 全文总结 | 第49-50页 |
| ·完成了cDNA文库的构建和后续序列测定工作 | 第49页 |
| ·完成了对所获表达序列标签EST的生物信息学分析 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 附录 | 第56-60页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
