自适应聚类算法挖掘网络模块结构及其在酵母蛋白作用网络中的应用
| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 目录 | 第11-13页 |
| 图目录 | 第13-14页 |
| 表目录 | 第14-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-27页 |
| ·引言 | 第15-16页 |
| ·网络生物学的兴起 | 第16-24页 |
| ·本文的工作与组织 | 第24-27页 |
| 第二章 蛋白质相互作用网络研究概述 | 第27-34页 |
| ·引言 | 第27页 |
| ·蛋白质相互作用的实验技术 | 第27-32页 |
| ·蛋白质相互作用的数据评估 | 第32页 |
| ·蛋白质相互作用数据库 | 第32-34页 |
| 第三章 复杂网络模块化结构研究介绍 | 第34-55页 |
| ·引言 | 第34-36页 |
| ·网络的基本概念 | 第36-43页 |
| ·复杂网络中的模块化结构定义 | 第43-47页 |
| ·复杂网络模块结构求解算法 | 第47-55页 |
| 第四章 网络模块化自适应聚类算法 | 第55-77页 |
| ·引言 | 第55-56页 |
| ·分裂式聚类算法的局限性 | 第56-57页 |
| ·凝聚式聚类算法的局限性 | 第57-58页 |
| ·自适应聚类算法 | 第58-65页 |
| ·自适应聚类算法Java代码实现 | 第65-67页 |
| ·算法性能评估 | 第67-73页 |
| ·自适应聚类算法在Zachary网络上的应用 | 第73-74页 |
| ·自适应聚类算法在足球网络上的应用 | 第74-77页 |
| 第五章 酵母蛋白网络的模块化结构 | 第77-94页 |
| ·引言 | 第77页 |
| ·酵母蛋白网络的数据预处理 | 第77-78页 |
| ·酵母蛋白网络的模块结构 | 第78-80页 |
| ·模块结构的生物功能验证 | 第80-89页 |
| ·与Newman-fast算法的性能比较 | 第89-94页 |
| 第六章 结论与展望 | 第94-98页 |
| ·引言 | 第94页 |
| ·论文结论 | 第94-96页 |
| ·研究展望 | 第96-98页 |
| 参考文献 | 第98-107页 |
| 附录一:自适应聚类算法Java代码 | 第107-113页 |
| 附录二:Zachary网络 | 第113-115页 |
| 附录三:北美大学生足球联赛网络 | 第115-126页 |
| 附录四:酵母蛋白相互作用网络 | 第126-142页 |
| 附录五:酵母蛋白网络的模块列表 | 第142-147页 |
| 作者简历及发表论文 | 第147页 |
