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嗜热毛壳菌热稳定几丁质酶基因的克隆、表达与性质研究

摘要第1-13页
ABSTRACT第13-16页
英文缩略词及中文对照表第16-17页
第一章 文献综述第17-32页
 引言第17-18页
 1. 几丁质酶的研究进展第18-29页
   ·几丁质酶系组成第18-19页
   ·几丁质酶的分子结构第19-22页
     ·信号肽序列第20页
     ·催化域第20页
     ·几丁质结合区(CHBD)第20-21页
     ·富含Ser/Thr 区和C 端序列第21-22页
   ·几丁质酶的性质第22-23页
   ·产几丁质酶的微生物第23页
   ·几丁质酶基因克隆第23-24页
   ·几丁质酶基因的表达调控第24-25页
   ·几丁质酶基因的表达转化第25-27页
   ·几丁质酶基因的应用第27-29页
     ·几丁质酶降解产物的应用第27页
     ·在生物防治中的应用第27-28页
       ·用于植物病原真菌的生物防治第27-28页
       ·用于抗病基因工程第28页
     ·在调节生命代谢活动中的应用第28页
     ·在生物学研究方面的应用第28-29页
 2. 本研究的目的和内容第29-32页
   ·研究目的和意义第29-30页
   ·研究内容第30页
   ·技术路线第30-32页
第二章 嗜热毛壳菌热稳定几丁质酶基因的克隆及序列分析第32-76页
 1. 材料和方法第32-47页
   ·材料第32-34页
     ·供试菌株第32页
     ·菌株与质粒第32页
     ·酶和生化试剂第32页
     ·仪器第32-33页
     ·培养基第33页
     ·溶液配制第33-34页
   ·嗜热毛壳菌CT2 几丁质酶基因的cDNA 克隆第34-46页
     ·引物设计第34页
     ·总RNA 的提取( Trizol 法)第34-35页
     ·反转录cDNA 第一链的合成第35-36页
     ·目的基因cDNA 中间片段的分离第36-42页
       ·目的基因cDNA 中间片段的扩增第36页
       ·PCR 产物回收第36-38页
       ·与载体连接第38-39页
       ·E.coli 感受态细胞的制备和转化第39-40页
         ·大肠杆菌感受态的制备第39页
         ·大肠杆菌感受态的转化第39-40页
       ·重组质粒的筛选与鉴定第40-42页
         ·IPTG-X-gal 筛选第40页
         ·菌落PCR 检测第40-41页
         ·碱法小量提取质粒DNA第41页
         ·质粒DNA 的酶切鉴定第41-42页
       ·序列测定第42页
     ·嗜热毛壳菌几丁质酶基因3’末端的分离(3’-RACE)第42页
     ·嗜热毛壳菌几丁质酶基因5’末端的分离(5’-RACE)第42-46页
       ·cDNA 第一链的合成第42-43页
       ·cDNA 第一链的纯化第43页
       ·cDNA 第一链的加尾第43-44页
       ·RACE-PCR 扩增第44-45页
       ·二次PCR(巢式PCR)第45-46页
     ·目的基因全长cDNA 的克隆第46页
     ·全长序列的生物信息学分析第46页
   ·嗜热毛壳菌几丁质酶基因DNA 的克隆及序列分析第46-47页
     ·菌丝体DNA 的抽提(CTAB 法)第46-47页
     ·嗜热毛壳菌几丁质酶基因DNA 的PCR 扩增第47页
     ·嗜热毛壳菌几丁质酶基因DNA 的序列分析第47页
 2. 结果与分析第47-68页
   ·嗜热毛壳菌总RNA 的提取第47-48页
   ·嗜热毛壳菌几丁质酶基因cDNA 的分离第48-64页
     ·C. thermophilum 几丁质酶基因cDNA 中间片段的分离第48-49页
     ·C. thermophilum 几丁质酶基因cDNA3’末端的分离及序列分析第49-51页
     ·C. thermophilum 几丁质酶基因cDNA 5’末端的分离第51-52页
     ·C. thermophilum几丁质酶基因全长cDNA 的分离及扩增片段的序列拼接第52-53页
     ·C. thermophilum 几丁质酶基因的cDNA 和氨基酸序列分析第53-64页
       ·C. thermophilum 几丁质酶基因的cDNA 序列分析第55-56页
       ·C. thermophilum 几丁质酶基因的氨基酸序列分析第56-63页
       ·C. thermophilum 几丁质酶基因的结构预测第63-64页
         ·C. thermophilum 几丁质酶基因的跨膜区预测第63页
         ·C. thermophilum 几丁质酶基因的三级结构预测第63-64页
   ·C. thermophilum 几丁质酶基因DNA 的扩增第64-68页
     ·C. thermophilum 几丁质酶DNA 基因序列分析第66-68页
     ·C. thermophilum 几丁质酶DNA 基因的核苷酸序列分析第68页
 3 讨论第68-76页
   ·小结第68-69页
   ·基因分离技术第69-74页
     ·菌丝总RNA 的提取第69-70页
     ·PCR 引物设计第70页
     ·分离基因的技术第70-74页
       ·RACE 技术第70-73页
       ·热不对称交错PCR(TAIL-PCR)第73-74页
   ·后续工作的展望第74-76页
第三章 嗜热毛壳菌几丁质酶基因在毕赤酵母中的表达第76-117页
 1. 材料和方法第76-93页
   ·材料第76-79页
     ·菌株和质粒第76-77页
     ·酶和生化试剂第77页
     ·培养基及有关溶液的配制第77-78页
     ·主要仪器设备第78-79页
   ·实验方法第79-93页
     ·Chaetomium thermophilum 几丁质酶成熟肽基因序列的分离第79-80页
       ·C. thermophilum 几丁质酶成熟肽基因序列的限制性酶切位点分析第79页
       ·引物设计和C. thermophilum 几丁质酶成熟肽基因序列的分离第79-80页
     ·几丁质酶基因在毕赤酵母中的表达第80-88页
       ·酵母表达载体的构建第80页
       ·线性化质粒DNA 的制备第80-82页
         ·线性化酶切第80-81页
         ·线状质粒DNA 的脱磷酸化处理第81-82页
       ·酵母转化第82-83页
         ·Pichia pastoris G5115 感受态细胞的制备(电击法)第82页
         ·重组表达质粒pPIC9K第82-83页
       ·酵母转化子的筛选与鉴定第83-84页
         ·酵母转化子甲醇利用表型的平板筛选第83页
         ·酵母基因组DNA 的分离第83-84页
       ·酵母转化子的PCR 鉴定第84-86页
         ·pPIC9K AOX1 通用引物鉴定第84-85页
         ·chit 基因的特异性引物鉴定第85-86页
       ·外源基因多拷贝整合转化子筛选第86-87页
       ·酵母工程菌的培养和几丁质酶的诱导分泌表达第87页
       ·表达产物的分离纯化第87-88页
         ·粗酶液的制备第87页
         ·硫酸铵沉淀第87页
         ·DEAE-Sepharose 阴离子交换柱层析第87-88页
     ·蛋白质含量测定第88-89页
       ·标准曲线的绘制第88-89页
         ·0-100μg/mL 标准曲线的制作第88页
         ·0-1000μg/mL 标准曲线的制作第88页
         ·考马斯亮蓝G-250 试剂的配制第88-89页
         ·样品蛋白质浓度的测定第89页
     ·蛋白质纯度鉴定第89-90页
       ·电泳操作步骤第89-90页
     ·蛋白质分子量的测定第90页
       ·SDS-PAGE 法测定蛋白质分子量第90页
         ·凝胶电泳方法参照《生物化学实验技术》进行第90页
         ·电泳迁移率的计算和标准曲线的制作第90页
         ·分子量测定第90页
       ·凝胶过滤层析法第90页
     ·几丁质酶表达产物的生物学活性检测第90-92页
       ·N-乙酰氨基葡萄糖(NAG)标准曲线的建立第90-91页
       ·表达产物几丁质酶的SDS-PAGE 分析第91-92页
     ·几丁质酶工程菌产酶曲线的测定第92页
     ·几丁质酶工程菌的遗传稳定性分析第92页
     ·几丁质酶工程菌表达产物的酶学性质第92-93页
       ·反应最适温度第92页
       ·反应最适pH 值第92页
       ·热稳定性第92-93页
       ·pH 值稳定性第93页
       ·不同金属离子对几丁质酶活性的影响第93页
       ·几种变性剂和蛋白抑制剂对几丁质酶活性的影响第93页
 2. 结果与分析第93-108页
   ·C. thermophilum 几丁质酶成熟肽基因序列的分离第93-95页
     ·C. thermophilum 几丁质酶成熟肽基因序列的限制性酶切位点分析结果第93-95页
     ·C. thermophilum 几丁质酶成熟肽基因序列的分离第95页
   ·C. thermophilum 几丁质酶基因chit 在毕赤酵母中的表达第95-108页
     ·酵母表达载体的构建和鉴定第95-99页
     ·重组酵母表达质粒pPIC9K/chit转化Pichia pastoris GS115及酵母转化子的筛选第99-101页
       ·酵母转化子的甲醇利用表型的筛选第99页
       ·酵母转化子的PCR 鉴定第99-101页
       ·chit 基因多拷贝整合子的筛选第101页
     ·C. thermophilum 几丁质酶chit 基因在Pichia pastoris 中的高效表达及表达产物的检测第101-103页
       ·C. thermophilum 几丁质酶chit 基因在Pichia pastoris 中的诱导表达和高表达酵母菌株的筛选第101-102页
       ·C. thermophilum 几丁质酶酵母工程菌产酶曲线的测定第102页
       ·C. thermophilum 几丁质酶基因表达产物的SDS-PAGE 检测第102-103页
     ·C. thermophilum 几丁质酶酵母工程菌的遗传稳定性分析第103页
     ·表达几丁质酶CHIT 的纯化与酶学性质研究第103-108页
       ·表达几丁质酶CHIT 的纯化第103-104页
         ·DEAE-Sepharose 阴离子交换柱层析第103-104页
       ·表达产物几丁质酶CHIT 的最适反应温度第104-105页
       ·表达产物几丁质酶CHIT 的最适反应pH 值第105-106页
       ·表达产物几丁质酶CHIT 的热稳定性第106页
       ·表达产物几丁质酶CHIT 的pH 稳定性第106-107页
       ·金属离子对表达产物几丁质酶CHIT 活性的影响第107页
       ·变性剂和蛋白酶抑制剂对表达产物几丁质酶CHIT 几丁质酶活性的影响第107-108页
 3 讨论第108-117页
   ·小结第108-110页
   ·表达重组几丁质酶的Pichia pastoris 表达系统评析第110-116页
     ·巴斯德毕赤酵母表达系统高效表达重组几丁质酶的优势第110-111页
     ·影响Pichia pastoris 表达系统表达重组几丁质酶的因素..第111-115页
     ·摇瓶培养与发酵罐培养第115-116页
   ·后续工作展望第116-117页
第四章 结论和展望第117-119页
   ·结论第117页
   ·展望第117-119页
参考文献第119-130页
致谢第130页

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