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真姬菇AFLP分子标记的建立和遗传多样性分析及酿酒酵母细胞絮凝主效基因的定位克隆

摘要第1-14页
ABSTRACT第14-19页
符号与名词缩写第19-21页
第一章 文献综述第21-39页
 1 复杂性状研究概况第21-29页
   ·表型变异的遗传基础第21页
   ·复杂性状的遗传解析第21-29页
     ·复杂性状的遗传分析方法第21-23页
     ·复杂性状基因的遗传鉴定第23-26页
     ·QTL分析的原理和方法第26-27页
     ·复杂性状研究的挑战和展望第27-29页
 2 真姬菇概述第29页
   ·真姬菇的分类地位第29页
   ·真姬菇的价值第29页
 3 遗传标记第29-32页
   ·遗传标记在食用菌遗传育种中的应第29-30页
   ·AFLP分子标记技术第30-32页
 4 酵母细胞絮凝第32-38页
   ·酵母模式生物的应用第32-33页
   ·酵母的絮凝第33-38页
     ·酵母絮凝的机理第33-35页
     ·酵母絮凝遗传学研究第35-38页
 5 研究目的和意义第38-39页
第二章 真姬菇AFLP分子标记的建立和遗传多样性分析第39-53页
 1 试剂和材料第39-41页
   ·药品和试剂第39-40页
   ·溶液第40-41页
   ·工具软件第41页
   ·仪器第41页
   ·菌株材料第41页
 2 实验方法第41-45页
   ·真姬菇基因组DNA的提取第41-43页
   ·AFLP标记技术分析第43-45页
     ·基因组DNA的酶切第43页
     ·酶切片断与人工接头连接第43页
     ·预扩增反应第43-44页
     ·选择性扩增反应第44页
     ·自动化荧光检测和数据分析第44-45页
 3 结果和分析第45-51页
   ·真姬菇AFLP标记技术方法第45-47页
   ·AFLP标记多态性第47-49页
   ·基于UPGMA方法的真姬菇遗传多样性分析第49-50页
   ·主成分分析第50-51页
 4 讨论第51-53页
   ·真姬菇基因组DNA的提取第51页
   ·真姬菇遗传多样性评价第51-53页
第三章 酵母F_2单倍体分离群体的QTL作图第53-67页
 1 试剂和材料第53-56页
   ·试剂第53-54页
   ·溶液第54-55页
   ·工具软件第55页
   ·仪器第55页
   ·材料第55-56页
 2 实验方法第56-58页
   ·F_2分离群体的构建第56页
   ·分离群体的表型测定第56页
   ·SNP标记的设计第56-57页
   ·酵母DNA提取第57页
   ·DNA片断的回收纯化第57-58页
   ·全基因组的QTL扫描第58页
 3 结果和分析第58-65页
   ·F_2单倍体分离群体的构建和表型测定第58-60页
   ·酵母全基因组QTL扫描第60-61页
   ·PCR-RFLP的SNP检测第61-62页
   ·精细作图第62-65页
 4 讨论与小结第65-67页
   ·分类性状的遗传基础研究第65页
   ·超亲分离是一种普遍存在的遗传现象第65-67页
第四章 酵母絮凝主效基因的定位克隆第67-115页
 1 试剂和材料第68-71页
   ·试剂第68页
   ·溶液第68-71页
   ·工具软件第71页
   ·仪器第71页
 2 实验方法第71-90页
   ·基因敲除第71-76页
     ·FPQ2敲除引物设计第71-72页
     ·置换片断PCR扩增第72页
     ·酵母转化第72-73页
     ·转化子验证第73页
     ·2号染色体QTL区域其余非必需基因的敲除第73-76页
   ·FPQ2编码区及部分上游间隔区序列分析第76页
   ·FPQ2编码蛋白与同源蛋白的多序列比对及蛋白结构域预测第76页
   ·FPQ2等位基因置换第76-82页
     ·长片断PCR扩增第77页
     ·T载体克隆第77-78页
     ·细菌转化第78-79页
     ·连接反应第79-80页
     ·基因置换质粒的构建第80页
     ·酵母转化第80-82页
   ·定点突变和QTN鉴定第82-84页
     ·定点突变引物设计第82页
     ·基因拼接第82-84页
   ·FPQ2表达水平检测第84-88页
     ·酵母RNA提取第84-85页
     ·逆转录第85页
     ·定量PCR第85-86页
     ·Western印迹分析第86-88页
   ·QTL基因FPQl5的鉴定第88页
   ·QTL基因的加性和互作效应第88-89页
     ·QTL基因表型贡献率的计算第88页
     ·多基因敲除菌株的构建第88-89页
   ·子细胞特异表达基因的表达量分析第89页
   ·FPQ2缺失对酵母乙醇耐受性的影响第89-90页
 3 结果和分析第90-105页
   ·基因敲除第90-91页
     ·获得正确敲除FPQ2基因的酵母菌株第90页
     ·FPQ2基因敲除菌株的絮凝表型测定第90-91页
   ·两亲本FPQ2基因编码区序列差异第91页
   ·FPQ2编码蛋白与同源蛋白的多序列比对及蛋白结构域预测第91-93页
   ·FPQ2等位基因置换第93-94页
     ·置换质粒的构建第93页
     ·酵母转化第93-94页
     ·等位基因置换菌株的表型测定第94页
   ·QTN的鉴定第94-96页
   ·FPQ2表达水平检测第96-97页
   ·QTL基因FPQ15的鉴定第97-101页
     ·FPQ15的功能验证第97-98页
     ·FPQ15的结构分析第98-101页
   ·QTL基因的加性和互作效应第101-103页
     ·4个QTL基因对絮凝表型变异的贡献率第101页
     ·多基因敲除菌株的构建和表型测定第101-103页
   ·子细胞特异表达基因的表达量分析第103页
   ·细胞絮凝对酵母乙醇耐受性的影响第103-105页
 4 讨论第105-115页
   ·运用简单模型研究复杂性状是切实可行的第105页
   ·絮凝性状复杂遗传结构解析第105-106页
   ·絮凝多基因网络的初步探讨第106-107页
   ·絮凝QTL基因的遗传互作第107-110页
   ·对FPQ2和FPQ15影响絮凝的作用方式的假设第110-115页
第五章 全文总结第115-117页
展望第117-119页
参考文献第119-129页
致谢第129-131页
攻读学位期间发表的学术论文目录第131页

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