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中国合作猪SLAⅠ类和Ⅱ类分子的克隆及基因结构与多态性分析

摘要第1-6页
Abstract第6-14页
第一部分 文献综述第14-34页
 第一章 猪MHC分子的研究进展第14-21页
   ·猪MHC的发现及特点第14页
     ·MHC的发现第14页
     ·猪MHC的发现第14页
   ·猪MHC(SLA)的生物学功能第14-16页
     ·参与T细胞的免疫应答第15页
     ·参与免疫应答的遗传控制第15页
     ·约束免疫细胞间的相互作用第15页
     ·参与抗原处理第15页
     ·参与免疫调节第15-16页
     ·参与免疫细胞的分化第16页
   ·SLA分类、特点及组成第16-21页
     ·SLAⅠ类分子的分布、特点及组成第16-18页
     ·SLAⅡ类分子的分布、特点及组成第18-21页
 第二章 猪MHC分子的多态性第21-29页
   ·猪MHC的多态性第21页
   ·SLAⅠ类分子基因及启动子区的多态性第21-23页
     ·SLAⅠ类分子基因的多态性第21-22页
     ·SLAⅠ类基因启动子区多态性第22-23页
   ·SLAⅡ类分子及启动子区基因多态性第23-29页
     ·SLAⅡ类分子基因的多态性第23-24页
     ·SLAⅡ类基因启动子区的多态性第24-27页
     ·MHCⅡ类基因启动子的多态性对基因表达调控影响第27页
     ·MHCⅡ类基因启动子多态性的的形成及与疾病的相关性第27-29页
 第三章 SLAⅠ类和Ⅱ类分子基因与疾病及生产性状的相关性第29-34页
   ·SLAⅠ类和Ⅱ类分子基因组织、细胞表达及与机体免疫水平的相关性第29页
   ·SLAⅠ类和Ⅱ类分子基因与疾病的相关性第29-32页
   ·SLA与生产性状的相关性第32页
   ·前景展望第32-34页
第二部分 试验研究第34-149页
 第四章 合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子CDNA的克隆及序列分析第34-74页
   ·实验材料第34-36页
     ·实验动物第34页
     ·菌种和载体第34页
     ·酶和试剂第34-35页
     ·仪器与设备第35页
     ·引物第35-36页
   ·实验方法第36-41页
     ·猪脾脏淋巴细胞的分离与培养第36页
     ·总RNA的提取第36-37页
     ·RT-PCR扩增目的片段第37-39页
     ·目的基因的克隆第39-40页
     ·重组质粒的提取与鉴定第40-41页
   ·结果与分析第41-71页
     ·RT-PCR扩增产物第41-43页
     ·重组质粒的酶切鉴定第43-44页
     ·测序结果第44-45页
     ·SLA Ⅰ类分子功能基因的序列分析第45-58页
     ·SLA Ⅱ类分子功能基因的序列分析第58-67页
     ·合作猪DR基因的生物信息学分析第67-71页
   ·讨论第71-74页
     ·关于SLA Ⅰ和Ⅱ类分子功能基因序列cDNA水平多态性的探讨第71-72页
     ·SLA Ⅰ和Ⅱ类分子功能基因多态性对其功能的影响第72页
     ·合作猪DR基因与不同猪种和物种间的同源关系的比较第72-74页
 第五章 合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子新等位基因的预测分析第74-90页
   ·实验材料第74页
   ·方法第74页
   ·结果与分析第74-89页
     ·测序结果第74页
     ·SLAⅠ类和Ⅱ类分子新等位基因的预测分析第74-89页
   ·讨论第89-90页
     ·合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子等位基因新的SNPs位点的预测第89页
     ·合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子新等位基因的预测第89-90页
 第六章 合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子基因组DNA的克隆及序列分析第90-127页
   ·实验材料第90-92页
     ·实验动物第90页
     ·菌种和载体第90页
     ·酶和试剂第90-91页
     ·仪器与设备第91页
     ·引物第91-92页
   ·实验方法第92-95页
     ·猪脾脏淋巴细胞的分离与培养第92页
     ·基因组DNA的提取第92-93页
     ·SLA基因组的扩增第93页
     ·目的片段的克隆第93-95页
     ·重组质粒的提取与鉴定第95页
   ·结果与分析第95-122页
     ·提取的基因组DNA琼脂糖凝胶电泳第95-96页
     ·合作猪与商品化白猪MHC基因PCR产物第96-98页
     ·重组质粒的酶切鉴定第98-100页
     ·测序结果第100-101页
     ·合作猪和商品化白猪SLAⅠ类分子基因组序列的分析及新等位基因的预测第101-109页
     ·合作猪和商品化白猪SLAⅡ类功能基因组序列的分析第109-119页
     ·合作猪DRB基因外显子2序列遗传变异的分析第119-121页
     ·合作猪DQA外显子2的多态性及其遗传进化的分析第121-122页
   ·讨论第122-127页
     ·关于长片段基因组的克隆的探讨第122-123页
     ·关于SLAⅠ类分子基因组的结构及其多态性的分析第123页
     ·关于SLAⅡ类分子基因组的结构及其多态性的分析第123-124页
     ·关于合作猪DRB基因外显子2的多态性的分析第124页
     ·关于合作猪DQA基因外显子2的多态性的分析第124页
     ·关于SLA Ⅰ类分子和Ⅱ类分子基因组中内含子的多态性第124-125页
     ·合作猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子等位基因新的SNPs位点的预测分析第125页
     ·合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子新等位基因的预测第125页
     ·关于抗原结合区编码外显子序列的多态性第125-127页
 第七章 合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子上游启动子区序列的分析及新等位基因的预测第127-148页
   ·材料第127页
   ·实验方法第127页
   ·结果与分析第127-145页
     ·基因组的克隆和测序第127页
     ·SLA Ⅰ类分子上游启动子区序列的分析及新等位基因的预测第127-134页
     ·SLA Ⅱ类分子上游启动子区序列的分析及新等位基因的预测第134-142页
     ·DRB和DQB URR序列的遗传进化关系第142-145页
   ·讨论第145-148页
     ·关于SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子基因启动子区的多态性探讨第145页
     ·关于SLA Ⅰ类分子和Ⅱ类分子基因启动子区各调控元件的功能的探讨第145-146页
     ·关于SLA Ⅱ类分子基因DQB和DRB启动子区等位基因的分类第146页
     ·合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子启动子等位基因新的SNPs位点的预测第146页
     ·合作猪和商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子启动子新等位基因的预测第146-147页
     ·SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子等位基因上游调控区多态性与基因的表达调控第147-148页
 第八章 结论第148-149页
参考文献第149-155页
附录1 溶液的配方第155-156页
附录2 克隆载体PMD~(TM)18-T质粒图谱第156-157页
附录3 克隆载体PGEM-TEASY质粒图谱第157-158页
附录4 载体PCDNA3.1/CT-GFP-TOPO质粒图谱第158-159页
附录5 合作猪与商品化白猪SLA Ⅰ类和Ⅱ类分子CDNA序列第159-162页
致谢第162-163页
导师简介第163-164页
作者简介第164-166页

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