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中国华东地区基因Ⅳ型戊型肝炎病毒人畜共患与进化起源研究

摘要第1-8页
Abstract第8-12页
英文缩写词表第12-14页
前言第14-20页
第一部分 华东地区研究现场介绍第20-24页
第二部分 华东地区戊型肝炎流行病学特征研究第24-38页
   ·戊肝病例来源第24-25页
   ·戊肝病例的"三间分布"第25-26页
   ·戊肝患者血清HEV RNA检出率第26-28页
   ·病毒核酸两种片段扩增效果比较第28页
   ·基因Ⅳ型HEV病毒血症的持续时间第28-34页
   ·讨论第34-37页
   ·结论第37-38页
第三部分 华东地区商品猪群戊型肝炎病毒感染率研究第38-50页
   ·标本采集第38-39页
   ·猪粪便HEV RNA检出率第39-40页
   ·猪胆汁混合标本检测方法第40-41页
   ·猪胆汁HEV RNA检出率第41-42页
   ·猪群中基因Ⅳ型HEV检出率的季节变化第42-44页
   ·讨论第44-49页
   ·结论第49-50页
第四部分 华东地区基因Ⅳ型戊型肝炎病毒进化起源研究第50-97页
   ·戊肝病毒序列第50-51页
   ·技术路线第51-52页
   ·HEV核苷酸序列与氨基酸序列基本信息第52-54页
     ·基本进化变异参数第52-53页
     ·核苷酸置换模型第53-54页
   ·基因Ⅳ型HEV分离株同源性分析第54-71页
     ·同源性比较的"三间分布"第54-62页
     ·系统进化树(最大似然法)第62-71页
   ·基因Ⅳ型HEV的进化起源探索第71-90页
     ·"分子钟"假设验证第71-75页
     ·进化速率与分歧时间第75-78页
     ·病毒种群演变与宿主感染数量第78-84页
     ·系统进化树(Bayesian后验概率分布)第84-90页
   ·讨论第90-96页
   ·结论第96-97页
第五部分 研究总结第97-101页
   ·研究创新点与特色第97页
   ·主要研究内容与结论第97-99页
   ·进一步的研究方向第99-101页
参考文献第101-112页
综述第112-133页
 参考文献第123-133页
附录一 血清学与分子生物学检测方法第133-144页
   ·标本处理第133页
   ·血清抗HEV IgM抗体ELISA检测方法第133-135页
   ·戊肝病毒RNA巢式RT-PCR检测方法第135-144页
附录二 统计学方法第144-146页
   ·"三间分布"的统计学比较第144-145页
   ·基因Ⅳ型HEV病毒血症持续时间的推算第145-146页
附录三 生物信息学软件应用第146-154页
   ·MEGA软件与序列基本信息统计第146-148页
   ·Modeltest软件与核苷酸置换模型第148-149页
   ·BioEdit软件与最大似然法进化树第149-150页
   ·BEAST系列软件与"分子钟"假设第150-153页
   ·参考文献第153-154页
附录四 GenBank数据库下载戊肝病毒序列第154-161页
发表论文情况第161-163页
致谢第163-165页

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