摘要 | 第1-8页 |
Abstract | 第8-12页 |
英文缩写词表 | 第12-14页 |
前言 | 第14-20页 |
第一部分 华东地区研究现场介绍 | 第20-24页 |
第二部分 华东地区戊型肝炎流行病学特征研究 | 第24-38页 |
·戊肝病例来源 | 第24-25页 |
·戊肝病例的"三间分布" | 第25-26页 |
·戊肝患者血清HEV RNA检出率 | 第26-28页 |
·病毒核酸两种片段扩增效果比较 | 第28页 |
·基因Ⅳ型HEV病毒血症的持续时间 | 第28-34页 |
·讨论 | 第34-37页 |
·结论 | 第37-38页 |
第三部分 华东地区商品猪群戊型肝炎病毒感染率研究 | 第38-50页 |
·标本采集 | 第38-39页 |
·猪粪便HEV RNA检出率 | 第39-40页 |
·猪胆汁混合标本检测方法 | 第40-41页 |
·猪胆汁HEV RNA检出率 | 第41-42页 |
·猪群中基因Ⅳ型HEV检出率的季节变化 | 第42-44页 |
·讨论 | 第44-49页 |
·结论 | 第49-50页 |
第四部分 华东地区基因Ⅳ型戊型肝炎病毒进化起源研究 | 第50-97页 |
·戊肝病毒序列 | 第50-51页 |
·技术路线 | 第51-52页 |
·HEV核苷酸序列与氨基酸序列基本信息 | 第52-54页 |
·基本进化变异参数 | 第52-53页 |
·核苷酸置换模型 | 第53-54页 |
·基因Ⅳ型HEV分离株同源性分析 | 第54-71页 |
·同源性比较的"三间分布" | 第54-62页 |
·系统进化树(最大似然法) | 第62-71页 |
·基因Ⅳ型HEV的进化起源探索 | 第71-90页 |
·"分子钟"假设验证 | 第71-75页 |
·进化速率与分歧时间 | 第75-78页 |
·病毒种群演变与宿主感染数量 | 第78-84页 |
·系统进化树(Bayesian后验概率分布) | 第84-90页 |
·讨论 | 第90-96页 |
·结论 | 第96-97页 |
第五部分 研究总结 | 第97-101页 |
·研究创新点与特色 | 第97页 |
·主要研究内容与结论 | 第97-99页 |
·进一步的研究方向 | 第99-101页 |
参考文献 | 第101-112页 |
综述 | 第112-133页 |
参考文献 | 第123-133页 |
附录一 血清学与分子生物学检测方法 | 第133-144页 |
·标本处理 | 第133页 |
·血清抗HEV IgM抗体ELISA检测方法 | 第133-135页 |
·戊肝病毒RNA巢式RT-PCR检测方法 | 第135-144页 |
附录二 统计学方法 | 第144-146页 |
·"三间分布"的统计学比较 | 第144-145页 |
·基因Ⅳ型HEV病毒血症持续时间的推算 | 第145-146页 |
附录三 生物信息学软件应用 | 第146-154页 |
·MEGA软件与序列基本信息统计 | 第146-148页 |
·Modeltest软件与核苷酸置换模型 | 第148-149页 |
·BioEdit软件与最大似然法进化树 | 第149-150页 |
·BEAST系列软件与"分子钟"假设 | 第150-153页 |
·参考文献 | 第153-154页 |
附录四 GenBank数据库下载戊肝病毒序列 | 第154-161页 |
发表论文情况 | 第161-163页 |
致谢 | 第163-165页 |