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西北干旱与半干旱地区锦鸡儿属根瘤菌多样性及系统发育研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 文献综述第12-23页
   ·引言第12-13页
   ·根瘤菌多样性的意义第13页
   ·根瘤菌分类的历史及研究进展第13页
   ·根瘤菌分类的研究的技术体系第13-18页
     ·根瘤菌的表型多样性研究第14-15页
     ·根瘤菌的遗传多样性研究第15-18页
   ·根瘤菌的系统发育研究第18-20页
     ·细菌系统发育学的发展第18页
     ·依据“分子钟”基因序列建立的根瘤菌系统发育关系第18-19页
     ·结瘤和固氮基因序列分析第19-20页
   ·根瘤菌最新分类系统第20页
   ·根瘤菌分类及系统发育的研究的问题与展望第20-23页
     ·基因水平转移与系统发育第20-22页
     ·展望第22-23页
第二章 立题依据及研究意义第23-25页
   ·西北地区根瘤菌生长环境的特异性第23页
   ·锦鸡儿属根瘤菌的研究意义第23-25页
第三章 表型多样性及数值分类研究第25-39页
   ·供试菌株第25-27页
     ·采样第25-27页
     ·供试菌株的分离纯化与保藏第27页
   ·生理生化特性测定第27-31页
     ·唯一碳源的利用第27-28页
     ·唯一氮源的利用第28页
     ·抗生素的抗性测定第28-29页
     ·对染料的抗性测定第29页
     ·对化学药物的耐受性测定第29页
     ·耐盐性测定第29页
     ·初始pH 生长范围测定第29页
     ·生长温度范围测定第29页
     ·过氧化氢酶测定第29-30页
     ·脲酶测定第30页
     ·L-苯丙氨酸脱氢酶测定第30页
     ·肉质蛋白胨生长测定第30页
     ·硝酸盐还原反应测定第30-31页
   ·试验结果处理第31页
     ·性状编码第31页
     ·两态形状编码第31页
     ·定量多态性状编码(有序多态性状)第31页
     ·定性多态性状编码(无序多态性状)第31页
     ·聚类分类第31页
     ·表现群中心菌株确定第31页
   ·结果与分析第31-38页
     ·生理生化结果分析第31-34页
     ·数值分类结果第34-36页
     ·各个群之间的鉴别第36-38页
   ·讨论第38-39页
第四章 16S RDNA PCR-RFLP 分析及系统发育地位研究第39-51页
   ·材料与方法第39-43页
     ·菌株第39页
     ·少量模板DNA 提取第39-41页
     ·PCR 扩增第41-42页
     ·酶切与电泳第42-43页
     ·16S rDNA 全序列测定第43页
   ·结果与分析第43-49页
     ·DNA 纯度、浓度检查第43页
     ·16S rDNA PCR-RFLP 分析第43-45页
     ·16S rDNA 全序列及系统分类分析第45-49页
   ·讨论第49-51页
第五章 结瘤基因(nodA)和固氮基因(nifH)限制性片段长度多态 性(PCR-RFLP)研究第51-68页
   ·结瘤基因(nodA)限制性片段多样性(PCR-RFLP)研究第52-60页
     ·材料与方法第52页
     ·nodA 基因片段扩增第52-53页
     ·nodA 扩增片段的酶切与电泳第53页
     ·nodA 全序列的测定及系统发育树的构建第53页
     ·结果与分析第53-59页
       ·nodA PCR-RFLP 分析第53页
       ·nodA 全序列及系统发育树分析第53-59页
     ·讨论第59-60页
   ·固氮基因(NIFH)限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)研究第60-68页
     ·材料与方法第60页
     ·nifH 片段扩增第60-61页
     ·nifH 扩增片段的酶切与电泳第61页
     ·nifH 的全序列测定及系统发育树的构建第61页
     ·结果与分析第61-66页
       ·nifH PCR-RFLP 分析第61-65页
       ·nifH 全序列及系统发育树分析第65-66页
     ·讨论第66-68页
第六章 代表菌株RECA 基因序列分析第68-72页
   ·材料第68页
   ·recA 基因片段扩增第68-69页
     ·引物第68页
     ·PCR 扩增反应体系第68页
     ·PCR 扩增条件第68-69页
     ·PCR 产物检测第69页
   ·recA 代表菌株全序列的测定及系统发育树的构建第69页
   ·recA 全序列及系统发育树分析第69-70页
   ·讨论第70-72页
第七章 锦鸡儿根瘤菌共生结瘤研究第72-74页
   ·菌株来源第72页
   ·根瘤菌的回接第72-73页
   ·结果与分析第73页
   ·讨论第73-74页
第八章 结果分析与讨论第74-78页
   ·锦鸡儿属根瘤菌多样性与系统发育分析第74-75页
   ·讨论第75-78页
参考文献第78-86页
附录第86-104页
缩略词(Abbreviations)第104-105页
致谢第105-106页
作者简介第106页

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