叉头框基因家族结构域分析及O亚家族的进化研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 1 导论 | 第12-38页 |
| ·Fox 转录因子家族 | 第13-19页 |
| ·Fox 家族的由来 | 第13页 |
| ·命名与分类 | 第13-14页 |
| ·Fox 蛋白的结构和转录调节机制 | 第14-15页 |
| ·Fox 蛋白的活性调节 | 第15-17页 |
| ·Fox 蛋白的功能 | 第17-19页 |
| ·基因复制与功能分化的研究 | 第19-24页 |
| ·基因复制的普遍性 | 第19页 |
| ·基因复制的分子机制 | 第19-20页 |
| ·复制基因的保留机制 | 第20-23页 |
| ·复制基因的功能分化 | 第23-24页 |
| ·进化选择与功能分化研究方法 | 第24-35页 |
| ·生物信息学的产生与发展 | 第24-25页 |
| ·比较基因组分析 | 第25页 |
| ·分子系统发育分析和分子进化研究方法 | 第25-27页 |
| ·在分子进化过程中同义替换率和错义替换率的计算 | 第27-30页 |
| ·分子进化中对自然选择作用的检验方法概述 | 第30-35页 |
| ·研究目的与意义 | 第35-38页 |
| 2 Fox 结构域的分析 | 第38-48页 |
| ·材料与方法 | 第38-40页 |
| ·实验序列 | 第38页 |
| ·Fox 基因的命名 | 第38-39页 |
| ·序列比对与进化树的构建 | 第39页 |
| ·基因转换事件的分析 | 第39页 |
| ·进化选择压力的分析 | 第39页 |
| ·DNA 结合特异性的分析 | 第39-40页 |
| ·结果与分析 | 第40-46页 |
| ·序列的选取 | 第40页 |
| ·进化分析 | 第40页 |
| ·基因转换事件的检测 | 第40-42页 |
| ·Fox 基因进化的选择压力 | 第42页 |
| ·DNA 结合特异性的分析 | 第42-46页 |
| ·讨论 | 第46-48页 |
| 3 FoxO 亚家族的进化选择与功能分化研究 | 第48-58页 |
| ·材料与方法 | 第48-49页 |
| ·序列的获取 | 第48页 |
| ·序列比对与系统发育树的构建 | 第48页 |
| ·选择压力的分析 | 第48页 |
| ·功能分化与决定功能分化的氨基酸位点的分析 | 第48-49页 |
| ·结果与分析 | 第49-55页 |
| ·序列比对分析结果 | 第49页 |
| ·进化分析结果 | 第49页 |
| ·FoxO 基因选择压力的分析 | 第49-54页 |
| ·氨基酸水平选择压力的检测 | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-58页 |
| 4 结语 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-68页 |
| 附录 | 第68-92页 |
| 附录1 Fox 家族转录因子序列总列表 | 第68-78页 |
| 附录2 基因转换事件列表 | 第78-90页 |
| 附录3 预测SDPs 列表 | 第90-92页 |
| 致谢 | 第92-94页 |
| 攻读硕士学位期间发表或录用的论文 | 第94页 |
