| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 引言 | 第12-30页 |
| 1.1 杀鱼爱德华氏菌 | 第12-22页 |
| 1.1.1 爱德华氏菌属的组成 | 第12-13页 |
| 1.1.2 杀鱼爱德华氏菌的生物学特征 | 第13页 |
| 1.1.3 杀鱼爱德华氏菌的地理分布和宿主种类 | 第13-14页 |
| 1.1.4 杀鱼爱德华氏菌的感染途径 | 第14-16页 |
| 1.1.5 杀鱼爱德华氏菌的毒力因子 | 第16-22页 |
| 1.2 细菌非编码小RNA | 第22-28页 |
| 1.2.1 细菌非编码小RNA的概况 | 第22-24页 |
| 1.2.2 细菌非编码小RNA筛选 | 第24-26页 |
| 1.2.3 细菌非编码小RNA靶基因预测 | 第26-27页 |
| 1.2.4 细菌非编码小RNA与靶标mRNA相互作用验证 | 第27-28页 |
| 1.3 本论文研究的目的与意义 | 第28-30页 |
| 第2章 杀鱼爱德华氏菌非编码小RNA测序及生物信息学分析 | 第30-40页 |
| 2.1 材料、方法及仪器设备 | 第30-32页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第30页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第30页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第30-31页 |
| 2.1.4 不同培养条件细菌样品收集 | 第31页 |
| 2.1.5 细菌RNA提取及RNA测序 | 第31页 |
| 2.1.6 测序数据分析 | 第31-32页 |
| 2.1.7 数据统计分析 | 第32页 |
| 2.2 结果 | 第32-36页 |
| 2.2.1 杀鱼爱德华氏菌不同培养条件转录组测序及分析 | 第32页 |
| 2.2.2 杀鱼爱德华氏菌中的sRNA鉴定 | 第32页 |
| 2.2.3 不同胁迫条件下杀鱼爱德华氏菌sRNA表达情况 | 第32-33页 |
| 2.2.4 环境胁迫条件下差异表达的杀鱼爱德华氏菌sRNA | 第33-34页 |
| 2.2.5 环境胁迫条件下差异表达的杀鱼爱德华氏菌mRNA | 第34-36页 |
| 2.2.6 sRNA与mRNA关联分析筛选靶基因 | 第36页 |
| 2.3 讨论 | 第36-40页 |
| 第3章 杀鱼爱德华氏菌非编码小RNA sR082 的功能研究 | 第40-64页 |
| 3.1 材料、方法及仪器设备 | 第40-56页 |
| 3.1.1 实验动物 | 第40页 |
| 3.1.2 实验菌株和质粒 | 第40-41页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第41-42页 |
| 3.1.4 实验仪器 | 第42页 |
| 3.1.5 杀鱼爱德华氏菌差异表达sRNA sR082 筛选 | 第42页 |
| 3.1.6 sR082在不同pH条件下表达分析 | 第42-45页 |
| 3.1.7 TXΔsR082敲除株构建 | 第45-52页 |
| 3.1.8 TXD1和TXΔsR082在不同pH胁迫下生长曲线测定 | 第52-53页 |
| 3.1.9 TXD1和TXΔsR082在FG细胞内复制能力检测 | 第53-55页 |
| 3.1.10 TXD1和TXΔsR082 组织侵染和致死率分析 | 第55-56页 |
| 3.2 结果 | 第56-61页 |
| 3.2.1 杀鱼爱德华氏菌sR082 在不同pH条件下表达差异分析 | 第56-57页 |
| 3.2.2 敲除株TXΔsR082 构建 | 第57-58页 |
| 3.2.3 TXD1和TXΔsR082 在不同pH条件下的生长情况 | 第58-59页 |
| 3.2.4 TXD1和TXΔsR082 感染FG细胞及胞内复制能力分析 | 第59-60页 |
| 3.2.5 TXD1和TXΔsR082 侵染牙鲆能力及致死率比较分析 | 第60-61页 |
| 3.3 讨论 | 第61-64页 |
| 第4章 杀鱼爱德华氏菌非编码小RNA sR012的功能研究 | 第64-88页 |
| 4.1 材料、方法及仪器设备 | 第64-75页 |
| 4.1.1 实验动物 | 第64页 |
| 4.1.2 实验菌株 | 第64页 |
| 4.1.3 实验试剂 | 第64-65页 |
| 4.1.4 实验仪器 | 第65页 |
| 4.1.5 杀鱼爱德华氏菌差异表达sRNA sR012筛选 | 第65页 |
| 4.1.6 sR012在不同生长时期表达分析 | 第65页 |
| 4.1.7 TXΔsR012敲除株构建 | 第65-66页 |
| 4.1.8 TXD1和TXΔsR012在不同氧化胁迫下生长曲线测定 | 第66-67页 |
| 4.1.9 TXD1和TXΔsR012组织侵染和致死率分析 | 第67页 |
| 4.1.10 TXD1和TXΔsR012在FG细胞内复制能力检测 | 第67页 |
| 4.1.11 实时荧光定量PCR验证靶基因 | 第67页 |
| 4.1.12 改良5'RACE法鉴定sR012转录起始位点 | 第67-72页 |
| 4.1.13 sR012表达载体pBAD OE构建 | 第72-75页 |
| 4.2 结果 | 第75-84页 |
| 4.2.1 杀鱼爱德华氏菌sR012在不同生长时期的差异表达分析 | 第75-76页 |
| 4.2.2 敲除株TXΔsR012构建 | 第76-77页 |
| 4.2.3 TXD1和TXΔsR012在不同氧化压力条件下的生长情况 | 第77-78页 |
| 4.2.4 TXD1和TXΔsR012感染FG细胞及胞内复制能力分析 | 第78-79页 |
| 4.2.5 TXD1和TXΔsR012侵染牙鲆能力及致死率比较分析 | 第79-80页 |
| 4.2.6 实时荧光定量PCR验证靶基因 | 第80-82页 |
| 4.2.7 sR012转录起始位点鉴定 | 第82-83页 |
| 4.2.8 sR012表达载体pBADsR012OE构建 | 第83-84页 |
| 4.3 讨论 | 第84-88页 |
| 第5章 结论与展望 | 第88-90页 |
| 参考文献 | 第90-102页 |
| 致谢 | 第102-104页 |
| 作者简历及攻读硕士期间发表的学术论文与研究成果 | 第104页 |
