| 摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-13页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-23页 |
| 1.1 深海沉积物的来源 | 第15-16页 |
| 1.2 深海沉积物中微生物的研究概况 | 第16-19页 |
| 1.2.1 深海沉积物中的微生物群落结构 | 第16页 |
| 1.2.2 深海沉积物中微生物的垂直分布 | 第16-17页 |
| 1.2.3 深海沉积物中微生物的区域分布 | 第17-18页 |
| 1.2.4 深海沉积物中微生物的研究意义 | 第18-19页 |
| 1.3 深海钻探项目的发展 | 第19-21页 |
| 1.4 南海地质环境概括 | 第21页 |
| 1.5 本论文的设计与研究意义 | 第21-23页 |
| 第二章 近2千万年以来的南海沉积柱细菌群落结构演替 | 第23-49页 |
| 2.1 前言 | 第23-24页 |
| 2.2 材料与方法 | 第24-33页 |
| 2.2.1 航次介绍和样品采集 | 第24-26页 |
| 2.2.2 DNA提取,PCR和MiSeq测序 | 第26-31页 |
| 2.2.3 序列分析 | 第31页 |
| 2.2.4 统计分析 | 第31-32页 |
| 2.2.5 定量PCR | 第32-33页 |
| 2.3 实验结果与讨论 | 第33-48页 |
| 2.3.1 污染控制 | 第33-35页 |
| 2.3.2 细菌群落的垂直分布 | 第35-36页 |
| 2.3.3 细菌群落的多样性分析 | 第36-39页 |
| 2.3.4 不同深度上细菌群落组成 | 第39-46页 |
| 2.3.5 影响深度细菌群落组成变化的关键因素 | 第46-48页 |
| 2.4 本章节小结 | 第48-49页 |
| 第三章 一株南海新种的鉴定 | 第49-70页 |
| 3.1 前言 | 第49-50页 |
| 3.2 材料与方法 | 第50-55页 |
| 3.2.1 菌株来源及培养基 | 第50页 |
| 3.2.2 鉴定方法 | 第50-55页 |
| 3.2.2.1 菌落及细胞形态 | 第50-51页 |
| 3.2.2.2 实验菌株形态特征鉴定 | 第51页 |
| 3.2.2.3 实验菌株生理生化特性鉴定 | 第51-53页 |
| 3.2.2.4 实验菌株呼吸醌测定 | 第53页 |
| 3.2.2.5 实验菌株DNA提取、G+C%测定及DNA杂交 | 第53-54页 |
| 3.2.2.6 菌体脂肪酸含量分析 | 第54-55页 |
| 3.2.2.7 细胞极性脂的测定 | 第55页 |
| 3.2.2.8 16S rRNA基因和系统发育分析 | 第55页 |
| 3.3 实验结果与讨论 | 第55-69页 |
| 3.3.1 菌落及菌体形态 | 第55-56页 |
| 3.3.2 生长特性 | 第56-58页 |
| 3.3.3 菌株APIZYM、API20E、API 20NE以及Biolog快速鉴定结果分析 | 第58-61页 |
| 3.3.4 JL3085~T的化学特性鉴定 | 第61-67页 |
| 3.3.4.1 菌体细胞脂肪酸分析 | 第61-62页 |
| 3.3.4.2 极性脂 | 第62-65页 |
| 3.3.4.3 呼吸醌 | 第65页 |
| 3.3.4.4 细胞基因组DNA的G+C mol%和杂交结果 | 第65-66页 |
| 3.3.4.5 16S rRNA基因序列分析 | 第66-67页 |
| 3.3.5 鉴定总结 | 第67-69页 |
| 3.3.5.1 对比分析总结 | 第67-68页 |
| 3.3.5.2 新种描述 | 第68-69页 |
| 3.4 本章节小结 | 第69-70页 |
| 第四章 本论文的主要结论、创新点、不足与展望 | 第70-72页 |
| 4.1 本研究的主要结论 | 第70页 |
| 4.2 创新点 | 第70页 |
| 4.3 不足之处 | 第70-71页 |
| 4.4 研究展望 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-82页 |
| 硕士期间已发表和撰写的学术论文 | 第82-83页 |
| 致谢 | 第83页 |
