| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 引言 | 第11-22页 |
| 1.1 沙塘鳢科鱼类的地理分布及生态习性 | 第11-12页 |
| 1.2 系统发育、生物地理及遗传多样性研究的相关理论 | 第12-16页 |
| 1.2.1 系统发育 | 第12-13页 |
| 1.2.2 生物地理学 | 第13页 |
| 1.2.3 溯祖理论 | 第13-14页 |
| 1.2.4 遗传多样性 | 第14-15页 |
| 1.2.5 哈迪-温伯格平衡定律 | 第15-16页 |
| 1.3 沙塘鳢科鱼类的研究现状 | 第16-19页 |
| 1.3.1 传统分类 | 第16-17页 |
| 1.3.2 系统发育 | 第17-18页 |
| 1.3.3 遗传多样性 | 第18-19页 |
| 1.4 本研究的内容和意义 | 第19-22页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第19-20页 |
| 1.4.2 目的与意义 | 第20-21页 |
| 1.4.3 技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 沙塘鳢科(Gobiiformes: Odontobutidae)的分类与系统发育 | 第22-42页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-31页 |
| 2.1.1 样本采集和DNA提取 | 第23页 |
| 2.1.2 探针设计 | 第23-24页 |
| 2.1.3 文库构建、基因富集、混样测序 | 第24页 |
| 2.1.4 数据组装 | 第24页 |
| 2.1.5 系统发育重建 | 第24-28页 |
| 2.1.6 X光成像 | 第28页 |
| 2.1.7 分化时间估算 | 第28-30页 |
| 2.1.8 重建祖先分布区域 | 第30-31页 |
| 2.2 结果 | 第31-33页 |
| 2.2.1 测序和组装结果统计 | 第31页 |
| 2.2.2 系统发育分析 | 第31页 |
| 2.2.3 肩带的骨骼特征 | 第31-33页 |
| 2.2.4 化石校正 | 第33页 |
| 2.2.5 生物地理 | 第33页 |
| 2.3 讨论 | 第33-41页 |
| 2.3.1 确定沙塘鳢科的新成员 | 第33-35页 |
| 2.3.2 分类地位修正 | 第35-37页 |
| 2.3.3 单系性 | 第37-38页 |
| 2.3.4 沙塘鳢科鱼类的系统发育关系 | 第38-39页 |
| 2.3.5 分化时间和历史生物地理 | 第39-41页 |
| 2.4 小结 | 第41-42页 |
| 第三章 沙塘鳢属鱼类的系统发育和生物地理 | 第42-58页 |
| 3.1 材料与方法 | 第46-48页 |
| 3.1.1 样本采集和DNA提取 | 第46页 |
| 3.1.2 文库构建、基因富集、测序和数据组装 | 第46页 |
| 3.1.3 系统发育重建 | 第46-47页 |
| 3.1.4 分化时间估算 | 第47页 |
| 3.1.5 重建祖先分布 | 第47-48页 |
| 3.2 结果 | 第48-51页 |
| 3.2.1 测序数据和组装结果统计 | 第48页 |
| 3.2.2 系统发育分析 | 第48-50页 |
| 3.2.3 化石校正 | 第50页 |
| 3.2.4 祖先分布区域 | 第50-51页 |
| 3.3 讨论 | 第51-57页 |
| 3.3.1 分类地位的确定 | 第51-53页 |
| 3.3.2 单系性 | 第53页 |
| 3.3.3 系统发育关系 | 第53-54页 |
| 3.3.4 分化时间和历史生物地理 | 第54-57页 |
| 3.4 小结 | 第57-58页 |
| 第四章 中国沙塘鳢的群体遗传现状分析 | 第58-79页 |
| 4.1 材料与方法 | 第58-60页 |
| 4.1.1 采样和提DNA | 第58页 |
| 4.1.2 文库构建、基因富集、测序和数据组装 | 第58-59页 |
| 4.1.3 筛选单核苷酸多态性位点 | 第59页 |
| 4.1.4 重建系统发育关系 | 第59页 |
| 4.1.5 种群遗传结构分析 | 第59-60页 |
| 4.2 结果 | 第60-73页 |
| 4.2.1 测序数据和组装结果统计 | 第60-71页 |
| 4.2.2 系统发育结果 | 第71页 |
| 4.2.3 种群遗传结构 | 第71-73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-78页 |
| 4.3.1 河川沙塘鳢 | 第73-77页 |
| 4.3.2 中华沙塘鳢 | 第77页 |
| 4.3.3 鸭绿沙塘鳢 | 第77-78页 |
| 4.4 小结 | 第78-79页 |
| 全文小结 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-88页 |
| 在校期间科研情况 | 第88-89页 |
| 致谢 | 第89页 |