| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 1 前言 | 第10-20页 |
| 1.1 植物草甘膦药害研究进展 | 第10-17页 |
| 1.1.1 草甘膦简介 | 第10页 |
| 1.1.2 草甘膦在植物中的作用机理 | 第10页 |
| 1.1.3 草甘膦在植物中吸收和迁移 | 第10-11页 |
| 1.1.4 草甘膦对植物生理变化的影响 | 第11-15页 |
| 1.1.5 草甘膦作用靶标酶EPSPS | 第15-16页 |
| 1.1.6 抗草甘膦转基因作物 | 第16-17页 |
| 1.2 转录组测序技术的发展与应用 | 第17-18页 |
| 1.3 目前存在的问题 | 第18-19页 |
| 1.4 本研究目的与意义 | 第19页 |
| 1.5 技术路线 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-38页 |
| 2.1 植物材料 | 第20页 |
| 2.2 质粒与菌种 | 第20页 |
| 2.3 试剂 | 第20页 |
| 2.4 草甘膦浓度筛选 | 第20页 |
| 2.5 生理试验方法 | 第20-24页 |
| 2.5.1 叶绿素和β-胡萝卜素含量的测定 | 第20-21页 |
| 2.5.2 叶绿素荧光动力学参数的测定 | 第21页 |
| 2.5.3 含水量的测定 | 第21页 |
| 2.5.4 脯氨酸含量的测定 | 第21页 |
| 2.5.5 可溶性糖含量的测定 | 第21-22页 |
| 2.5.6 过氧化物酶(POD)活性测定 | 第22页 |
| 2.5.7 超氧化物歧化酶(SOD)活性测定 | 第22页 |
| 2.5.8 莽草酸含量测定 | 第22-23页 |
| 2.5.9 激素含量测定 | 第23-24页 |
| 2.6 分子生物学方法 | 第24-37页 |
| 2.6.1 生物信息学分析 | 第24-25页 |
| 2.6.2 叶片总RNA提取 | 第25页 |
| 2.6.3 cDNA第一链的合成 | 第25-26页 |
| 2.6.4 EPSPS基因的克隆 | 第26-28页 |
| 2.6.5 EPSPS基因的表达分析 | 第28-30页 |
| 2.6.6 草甘膦作用下橡胶树叶片转录组测序 | 第30-37页 |
| 2.7 统计分析和作图 | 第37-38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-75页 |
| 3.1 草甘膦对巴西橡胶树芽接苗浓度效应 | 第38页 |
| 3.2 草甘膦对巴西橡胶树芽接苗叶片形态的影响 | 第38-39页 |
| 3.3 草甘膦对巴西橡胶树芽接苗生理变化的影响 | 第39-46页 |
| 3.3.1 草甘膦对橡胶树叶绿素和β-胡萝卜素含量变化的影响 | 第39-40页 |
| 3.3.2 草甘膦对橡胶树叶片光合特性的影响 | 第40-41页 |
| 3.3.3 草甘膦对橡胶树含水量的影响 | 第41-42页 |
| 3.3.4 草甘膦对橡胶树脯氨酸的影响 | 第42页 |
| 3.3.5 草甘膦对橡胶树可溶性糖的影响 | 第42-43页 |
| 3.3.6 草甘膦对橡胶树过氧化物酶活性的影响 | 第43-44页 |
| 3.3.7 草甘膦对橡胶树超氧化物歧化酶活性的影响 | 第44页 |
| 3.3.8 草甘膦对橡胶树莽草酸含量变化的影响 | 第44-45页 |
| 3.3.9 草甘膦对橡胶树激素含量变化的影响 | 第45-46页 |
| 3.4 巴西橡胶树EPSPS基因的克隆与表达分析 | 第46-53页 |
| 3.4.1 巴西橡胶树EPSPS基因的克隆及生物信息学分析 | 第46-50页 |
| 3.4.2 巴西橡胶树EPSPS基因的表达分析 | 第50-53页 |
| 3.5 草甘膦作用下橡胶树芽接苗叶片转录组分析 | 第53-75页 |
| 3.5.1 RNA样品质量分析 | 第53页 |
| 3.5.2 测序数据质量分析 | 第53页 |
| 3.5.3 De novo组装 | 第53-54页 |
| 3.5.4 Unigene功能注释分析 | 第54-60页 |
| 3.5.5 编码序列(CDS)预测 | 第60-61页 |
| 3.5.6 转录因子(TF)预测 | 第61-62页 |
| 3.5.7 简单序列重复(SSR)检测 | 第62-63页 |
| 3.5.8 单核苷酸多态性(SNP)检测 | 第63-64页 |
| 3.5.9 Unigene表达分析 | 第64-65页 |
| 3.5.10 差异表达基因(DEG)分析 | 第65-75页 |
| 4 讨论 | 第75-80页 |
| 4.1 草甘膦对巴西橡胶树生理机制 | 第75-76页 |
| 4.2 草甘膦对巴西橡胶树分子机制 | 第76-77页 |
| 4.2.1 巴西橡胶树EPSPS结构与功能分析 | 第76页 |
| 4.2.2 巴西橡胶树EPSPS基因受草甘膦等多因素差异调控 | 第76-77页 |
| 4.3 草甘膦对巴西橡胶树叶片转录组分析 | 第77-80页 |
| 4.3.1 草甘膦对巴西橡胶树叶片转录组测序 | 第77-79页 |
| 4.3.2 草甘膦对巴西橡胶树叶片差异基因表达分析 | 第79-80页 |
| 5 结论 | 第80-81页 |
| 6 创新之处 | 第81-82页 |
| 7 后续研究 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-96页 |
| 附录 | 第96-97页 |
| 致谢 | 第97页 |
