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Leucobacter triazinivorans sp JW-1代谢扑草净脱甲硫基酶基因克隆表达及功能研究

致谢第5-6页
摘要第6-7页
ABSTRACT第7-8页
术语与缩略语表第9-14页
第一章 文献综述第14-22页
    1.1 三嗪类除草剂的微生物降解研究进展第14-19页
        1.1.1 三嗪类除草剂概述第14页
        1.1.2 降解三嗪类除草剂的微生物菌株第14-15页
        1.1.3 三嗪类除草剂微生物降解主要途径与基因第15-19页
    1.2 扑草津的微生物降解第19-22页
        1.2.1 扑草净概述第19-20页
        1.2.2 扑草净的残留危害第20-21页
        1.2.3 扑草净的微生物降解第21-22页
第二章 引言第22-23页
    2.1 研究背景与意义第22-23页
第三章 材料与方法第23-35页
    3.1 实验材料与仪器第23-25页
        3.1.1 药品与试剂第23页
        3.1.2 供试菌株第23-24页
        3.1.3 实验仪器第24页
        3.1.4 培养基与试剂配方第24-25页
        3.1.5 实验所用引物第25页
    3.2 菌株JW-1的质粒基因序列分析第25-28页
        3.2.1 菌株的质粒提取第25-26页
        3.2.2 样品检测与测序第26-28页
    3.3 脱甲硫基酶克隆载体的构建第28-29页
        3.3.1 目的基因的PCR扩增第28-29页
        3.3.2 克隆反应与阳性克隆检测第29页
    3.4 脱甲硫基表达载体的构建第29-30页
        3.4.1 trzN的PCR扩增第29页
        3.4.2 PCR产物和pET-28b+质粒的双酶切、产物纯化和酶连第29-30页
        3.4.3 酶连产物转化和阳性克隆转化子的筛选第30页
    3.5 脱甲基酶的功能验证第30-31页
        3.5.1 表达菌株的诱导第30-31页
        3.5.2 降解功能验证第31页
    3.6 最佳诱导条件筛选第31-32页
        3.6.1 诱导条件的设计第31页
        3.6.2 粗酶样品的制备第31页
        3.6.3 粗酶蛋白含量测定第31-32页
        3.6.4 粗酶活性测定第32页
    3.7 目标蛋白TrzN的GraviTrap亲和层析纯化第32-33页
        3.7.1 粗酶样品制备第32页
        3.7.2 目的蛋白的纯化第32-33页
        3.7.3 蛋白脱盐第33页
    3.8 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第33页
        3.8.1 样品处理第33页
        3.8.2 SDS-PAGE凝胶的制备第33页
        3.8.3 蛋白凝胶电泳第33页
        3.8.4 蛋白凝胶染色与脱色第33页
    3.9 酶的功能鉴定第33页
    3.10 酶学性质研究第33-34页
        3.10.1 重组酶TrzN最适反应温度和温度稳定性试验第33-34页
        3.10.2 重组酶TrzN最适pH和pH稳定性试验第34页
        3.10.3 酶动力学常数测定第34页
    3.11 重组酶TrzN降解底物谱测定第34-35页
        3.11.1 底物谱测定实验方法第34页
        3.11.2 仪器检测方法第34-35页
第四章 结果与分析第35-48页
    4.1 菌JW-1的质粒测序和脱甲硫基基因预测第35-38页
        4.1.1 质粒样品检测第35页
        4.1.2 质粒样品建库测序第35-36页
        4.1.3 数据组装第36-38页
        4.1.4 脱甲硫基的查找级生物学信息学预测第38页
    4.2 trzN基因克隆载体的构建第38页
    4.3 trzN基因表达载体的构建第38-40页
        4.3.1 PCR产物和pET-28b+的双酶切、产物纯化第38-39页
        4.3.2 酶切产物酶连、转化第39-40页
    4.4 脱甲硫基基因功能验证第40-42页
        4.4.1 扑草净降解产物2-羟基扑灭津标准曲线绘制第40页
        4.4.2 酶学功能验证第40-42页
    4.5 最佳诱导条件筛选结果第42页
    4.6 降解酶的分离与纯化第42-43页
    4.7 重组酶TrzN酶学特性研究第43-46页
        4.7.1 酶TrzN最适反应温度测定第43-44页
        4.7.2 酶TrzN最适反应pH测定第44-45页
        4.7.3 酶TrzN反应动力学常数第45-46页
    4.8 重组酶TrzN底物特异性第46-48页
第五章 讨论第48-50页
    5.1 扑草净脱甲硫基基因trzN的克隆与表达第48页
    5.2 温度对重组酶TrzN活性质的影响第48页
    5.3 pH对重组酶TrzN酶活性的影响第48-49页
    5.4 重组酶TrzN的酶动力学研究第49页
    5.5 重组酶TrzN酶降解底物谱研究第49-50页
第六章 结论第50-51页
参考文献第51-57页
附录1第57-58页
作者简介第58页

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