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棉田土壤中Verticillium dahliae.Kleb.定量检测

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第12-20页
    1.1 棉花黄萎病的概述第12-13页
        1.1.1 棉花黄萎病的发生危害与寄主范围第12-13页
        1.1.2 棉花黄萎病发病特点、病害循环第13页
    1.2 棉花黄萎病的致病机理第13页
        1.2.1 导管堵塞第13页
        1.2.2 致病毒素第13页
    1.3 微菌核研究概况第13-14页
    1.4 微菌核的时空分布研究概况第14页
        1.4.1 棉田土壤中大丽轮枝菌微菌核的空间分布第14页
        1.4.2 棉田土壤中大丽轮枝菌微菌核的动态分布第14页
    1.5 大丽轮枝菌微菌核的定量检测技术第14-16页
        1.5.1 选择性培养基平板计数法第14-15页
        1.5.2 分子生物学检测方法第15-16页
    1.6 环介导等温扩增技术(LAMP)第16-17页
        1.6.1 基本原理第16页
        1.6.2 环介导等温扩增技术(LAMP)的应用第16-17页
        1.6.3 环介导等温扩增技术的特点第17页
    1.7 实时荧光定量PCR技术(qPCR)第17-18页
        1.7.1 基本原理第17-18页
        1.7.2 实时荧光定量PCR技术的应用第18页
        1.7.3 实时荧光定量PCR的特点第18页
    1.8 本研究目的意义及技术路线第18-20页
        1.8.1 本研究目的意义第18-19页
        1.8.2 技术路线第19-20页
第二章 大丽轮枝菌微菌核在棉田土壤中的分布动态第20-26页
    1 材料与方法第20-21页
        1.1 实验地点第20页
        1.2 供试菌株第20页
        1.3 供试土样第20页
        1.4 供试培养基及溶液第20页
        1.5 微菌核的培养与收集第20-21页
        1.6 微菌核在大丽轮枝菌选择性培养基(MSEA)上的萌发第21页
        1.7 土壤样品的采集和处理第21页
        1.8 选择性培养基法定量土壤中大丽轮枝菌微菌核第21页
        1.9 数据收集及处理第21页
    2 结果与分析第21-24页
        2.1 微菌核的萌发测定第21-23页
        2.2 微菌核在棉田土层中的垂直分布第23页
        2.3 土壤中微菌核的季节变化动态第23-24页
    3 结论与讨论第24-26页
第三章 棉田土壤中微菌核密度与病害之间的相关性第26-32页
    1 材料与方法第26-27页
        1.1 供试土样的采集第26-27页
            1.1.1 土壤中微菌核的定量检测第26页
            1.1.2 田间病害调查第26页
            1.1.3 数据分析第26-27页
        1.2 不同抗病性品种对土壤中微菌核累积的影响第27页
            1.2.1 供试土样的采集第27页
            1.2.2 土壤中微菌核的定量检测第27页
            1.2.3 不同抗病性棉花材料的选择第27页
    2 结果与分析第27-30页
        2.1 土壤中微菌核数量与田间病害发生的相关性分析第27-30页
        2.2 不同抗病性棉花品种对土壤中微菌核累积的影响第30页
    3 结论与讨论第30-32页
第四章 棉花黄萎病菌微菌核LAMP检测技术的构建及优化第32-40页
    1 材料与方法第32-35页
        1.1 实验材料第32页
        1.2 供试土样第32页
        1.3 实验仪器第32页
        1.4 试验试剂第32-33页
        1.5 引物来源第33页
        1.6 引物的处理第33-34页
        1.7 实验方法第34页
            1.7.1 棉花黄萎病菌基因组DNA的提取第34页
            1.7.2 LAMP反应体系和PCR反应体系第34页
        1.8 LAMP反应条件优化第34-35页
            1.8.1 Mg~(2+)浓度的优化第34页
            1.8.2 dNTPs浓度的优化第34页
            1.8.3 甜菜碱的优化第34-35页
            1.8.4 内外引物比的优化第35页
            1.8.5 反应时间的优化第35页
            1.8.6 反应温度的优化第35页
        1.9 特异性引物PCR第35页
        1.10 LAMP检测灵敏度验证第35页
    2 结果与分析第35-39页
        2.1 LAMP反应条件的优化第35-38页
        2.2 LAMP反应和特异性PCR反应的灵敏度比较第38-39页
    3 结论与讨论第39-40页
第五章 环介导等温实时荧光定量扩增检测VerticilliudahliaeKleb.菌核第40-49页
    1 材料与方法第40-42页
        1.1 试验材料第40页
        1.2 试验方法第40-42页
            1.2.1 土壤中棉花黄萎病菌微菌核DNA提取方法第40页
            1.2.2 环介导等温实时荧光定量扩增的反应体系第40-41页
            1.2.3 不同浓度微菌核的制备第41页
            1.2.4 标准曲线的建立第41页
            1.2.5 环介导等温实时荧光定量扩增检测体系的特异性评价第41页
            1.2.6 环介导等温实时荧光定量扩增体系的灵敏性评价第41页
            1.2.7 环介导等温实时荧光定量扩增体系的重复性评价第41-42页
            1.2.8 数据收集及处理第42页
        1.3 环介导等温实时荧光定量扩增检测棉田土壤中微菌核第42页
            1.3.1 供试土样及DNA的提取第42页
            1.3.2 田间病害调查第42页
            1.3.3 环介导等温实时荧光定量扩增的反应体系第42页
    2 结果与分析第42-48页
        2.1 环介导等温实时荧光定量扩增检测体系的建立第42-46页
        2.2 棉田土壤中微菌核的环介导等温实时荧光定量检测第46-48页
    3 结论与讨论第48-49页
第六章 主要结论第49-50页
    1 结论第49页
    2 创新点第49-50页
参考文献第50-55页
致谢第55-56页
作者简介第56-57页
石河子大学硕士研究生学位论文导师评阅表第57页

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