| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1.1 引言 | 第10页 |
| 1.2 蛋白激酶抑制剂 | 第10-13页 |
| 1.3 蛋白激酶与疾病 | 第13-15页 |
| 1.3.1 癌症 | 第13页 |
| 1.3.2 高血压 | 第13-14页 |
| 1.3.3 帕金森氏症 | 第14页 |
| 1.3.4 炎症和自身免疫性疾病 | 第14-15页 |
| 1.4 虚拟筛选 | 第15-16页 |
| 1.5 研究内容及章节安排 | 第16-18页 |
| 第二章 研究采用基于分子对接的方法筛选双靶点抑制剂的可行性 | 第18-42页 |
| 2.1 引言 | 第18-19页 |
| 2.2 材料和方法 | 第19-23页 |
| 2.2.1 数据收集 | 第19-20页 |
| 2.2.2 晶体结构的结构聚类 | 第20页 |
| 2.2.3 蛋白质准备 | 第20页 |
| 2.2.4 配体准备 | 第20-21页 |
| 2.2.5 分子对接 | 第21页 |
| 2.2.6 研究分子对接对于单靶点激酶抑制剂的分类能力 | 第21-22页 |
| 2.2.7 研究分子对接对于双靶点激酶抑制剂的分类能力 | 第22-23页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第23-41页 |
| 2.3.1 蛋白质和配体的准备 | 第23-24页 |
| 2.3.2 研究分子对接对于单靶点激酶抑制剂的分类能力 | 第24-38页 |
| 2.3.3 研究分子对接对于双靶点激酶抑制剂的分类能力 | 第38-41页 |
| 2.4 小结 | 第41-42页 |
| 第三章 通过伞形采样和 MM/GBSA 结合揭示 P38 MAP 激酶/抑制剂的解离路径 | 第42-54页 |
| 3.1 引言 | 第42-43页 |
| 3.2 材料和方法 | 第43-46页 |
| 3.2.1 常规分子动力学 | 第43-44页 |
| 3.2.2 伞形采样 | 第44-45页 |
| 3.2.3 MM/GBSA 结合自由能计算 | 第45-46页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第46-52页 |
| 3.3.1 ATP 口袋通道和别构口袋通道配体出口袋的细节 | 第46-49页 |
| 3.3.2 ATP 口袋通道和别构口袋通道的结合自由能 | 第49-52页 |
| 3.4 小结 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-64页 |
| 攻读学位期间本人出版或公开发表的论著、论文 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
