牛支原体的分离鉴定及其全基因组序列测定与分析
| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 縮略语表 | 第9-10页 |
| 1 引言 | 第10-21页 |
| 1.1 牛支原体病简介 | 第10-16页 |
| 1.1.1 病原学 | 第10-11页 |
| 1.1.2 流行病学 | 第11-12页 |
| 1.1.3 致病机理 | 第12页 |
| 1.1.4 临床症状、病理变化及组织学病变 | 第12-13页 |
| 1.1.5 诊断 | 第13-15页 |
| 1.1.6 防治 | 第15-16页 |
| 1.2 牛支原体全基因组测序简介 | 第16-18页 |
| 1.2.1 基因测序技术简介 | 第16-17页 |
| 1.2.2 牛支原体全基因测序简介 | 第17-18页 |
| 1.3 牛支原体研究热点 | 第18-21页 |
| 1.3.1 热休克蛋白 | 第18页 |
| 1.3.2 烯醇化酶 | 第18-19页 |
| 1.3.3 生物膜 | 第19-20页 |
| 1.3.4 可变表面脂蛋白 | 第20-21页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-26页 |
| 2.1 材料 | 第21页 |
| 2.1.1 病料来源 | 第21页 |
| 2.1.2 试剂与仪器 | 第21页 |
| 2.2 方法 | 第21-26页 |
| 2.2.1 培养基配置方法 | 第21-22页 |
| 2.2.2 菌株分离纯化方法 | 第22页 |
| 2.2.3 菌株生化鉴定方法 | 第22页 |
| 2.2.4 PCR鉴定方法 | 第22-23页 |
| 2.2.5 目的片段的测序和比对 | 第23-24页 |
| 2.2.6 酚氯仿提取全基因组DNA | 第24页 |
| 2.2.7 3份全基因组DNA样品检测 | 第24页 |
| 2.2.8 基因公司进行样品合格性检测 | 第24-25页 |
| 2.2.9 基因组DNA测序方法 | 第25页 |
| 2.2.10 基因组组装及评价方法 | 第25页 |
| 2.2.11 基因组组分分析方法 | 第25页 |
| 2.2.12 生物信息学分析方法 | 第25-26页 |
| 3 结果 | 第26-44页 |
| 3.1 菌落形态观察结果 | 第26页 |
| 3.2 生化鉴定结果 | 第26-27页 |
| 3.3 PCR鉴定结果 | 第27页 |
| 3.4 目的片段测序结果和BLAST比对结果 | 第27-28页 |
| 3.5.3 份全基因组DNA样品检测结果 | 第28-29页 |
| 3.6 基因公司样品合格性检测结果 | 第29页 |
| 3.7 基因组DNA测序结果 | 第29页 |
| 3.8 基因组组装及评价结果 | 第29-31页 |
| 3.9 基因组组分分析结果 | 第31页 |
| 3.10 生物信息学分析结果 | 第31-44页 |
| 3.10.1 基因组概况 | 第31-33页 |
| 3.10.2 KEGG数据库分析结果 | 第33页 |
| 3.10.3 GO数据库分析结果 | 第33-34页 |
| 3.10.4 COG数据库分析结果 | 第34-35页 |
| 3.10.5 四数据库综合分析结果 | 第35-41页 |
| 3.10.6 主要基因序列进化树的构建 | 第41-44页 |
| 4 讨论 | 第44-46页 |
| 5 结论 | 第46-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-56页 |
| 作者简介 | 第56页 |
