| 中文摘要 | 第10-15页 |
| 英文摘要 | 第15-19页 |
| 英文缩略词说明 | 第20-21页 |
| 前言 | 第21-30页 |
| 1 研究背景 | 第21-28页 |
| 1.1 概述 | 第21-22页 |
| 1.2 病原学特征 | 第22-23页 |
| 1.3 流行病学特征 | 第23-25页 |
| 1.4 胃肠炎病毒的环境污水监测 | 第25-27页 |
| 1.5 国内外研究现状 | 第27-28页 |
| 2 研究目的及意义 | 第28-29页 |
| 2.1 本研究目的 | 第28页 |
| 2.2 本研究意义 | 第28-29页 |
| 3 本研究技术路线图 | 第29-30页 |
| 材料与方法 | 第30-43页 |
| 1 材料 | 第30-34页 |
| 1.1 标本的采集所需试剂和设备 | 第30页 |
| 1.2 病毒浓缩富集所需试剂和设备 | 第30页 |
| 1.3 病毒核酸提取所需试剂和设备 | 第30-31页 |
| 1.4 基因扩增所需试剂和设备 | 第31-32页 |
| 1.5 琼脂糖凝胶电泳所需试剂和设备 | 第32页 |
| 1.6 基因扩增产物分离纯化所需试剂和设备 | 第32-33页 |
| 1.7 TA克隆所需试剂和设备 | 第33-34页 |
| 1.8 参考序列来源 | 第34页 |
| 1.9 软件来源 | 第34页 |
| 2 方法 | 第34-41页 |
| 2.1 环境污水标本的采集 | 第34-35页 |
| 2.2 环境污水中胃肠炎病毒的浓缩富集 | 第35-36页 |
| 2.3 病毒核酸提取 | 第36页 |
| 2.4 逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR) | 第36-37页 |
| 2.5 琼脂糖凝胶电泳 | 第37页 |
| 2.6 RT-PCR产物的分离纯化 | 第37-38页 |
| 2.7 TA克隆 | 第38-40页 |
| 2.8 序列整理和分子定型 | 第40页 |
| 2.9 数据分析 | 第40-41页 |
| 3 质量控制 | 第41-43页 |
| 3.1 研究设计阶段 | 第41页 |
| 3.2 标本采集阶段 | 第41-42页 |
| 3.3 标本检测阶段 | 第42页 |
| 3.4 序列分析阶段 | 第42-43页 |
| 结果 | 第43-88页 |
| 1 RVA、NoV和HAstV检出情况 | 第43页 |
| 2 RVA、NoV和HAstV型别分布特征 | 第43-54页 |
| 2.1 RVA G基因型 | 第43-46页 |
| 2.2 RVA P基因型 | 第46-48页 |
| 2.3 NoV GⅠ基因型 | 第48-50页 |
| 2.4 NoV GⅡ基因型 | 第50-52页 |
| 2.5 HAstV基因型 | 第52-54页 |
| 3 优势型别同源性和系统发生学分析 | 第54-70页 |
| 3.1 RVA | 第54-60页 |
| 3.2 NoV | 第60-67页 |
| 3.3 HAstV | 第67-70页 |
| 4 重组分析 | 第70-78页 |
| 4.1 RVA | 第70页 |
| 4.2 NoV | 第70-73页 |
| 4.3 HAstV | 第73-78页 |
| 5 优势型别进化遗传学分析 | 第78-88页 |
| 5.1 RVA | 第78-81页 |
| 5.2 NoV | 第81-85页 |
| 5.3 HAstV | 第85-88页 |
| 讨论 | 第88-100页 |
| 1 RVA、NoV和HAstV检出情况 | 第88-89页 |
| 2 RVA、NoV和HAstV型别分布特征 | 第89-91页 |
| 2.1 RVA | 第89-90页 |
| 2.2 NoV | 第90-91页 |
| 2.3 HAstV | 第91页 |
| 3 RVA、NoV和HAstV优势型别序列同源性和系统发生学分析 | 第91-96页 |
| 3.1 RVA | 第91-93页 |
| 3.2 NoV | 第93-95页 |
| 3.3 HAstV | 第95-96页 |
| 4 RVA、NoV和HAstV序列重组分析 | 第96-98页 |
| 4.1 RVA | 第96-97页 |
| 4.2 NoV | 第97-98页 |
| 4.3 HAstV | 第98页 |
| 5 RVA、NoV和HAstV优势型别序列进化遗传学分析 | 第98-100页 |
| 5.1 RVA | 第98页 |
| 5.2 NoV | 第98-99页 |
| 5.3 HAstV | 第99-100页 |
| 结论与建议 | 第100-101页 |
| 本研究主要创新点和不足 | 第101-102页 |
| 参考文献 | 第102-111页 |
| 致谢 | 第111-113页 |
| 攻读学位期间发表论文 | 第113-114页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第114-115页 |
| 中文综述 | 第115-126页 |
| 参考文献 | 第121-126页 |
| 外文论文 | 第126-163页 |