中文摘要 | 第2-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
中文文摘 | 第6-10页 |
绪论 | 第10-16页 |
0.1 蛋白质结构与构象病的研究现状 | 第10-11页 |
0.2 红外光谱在分子结构研究中的应用 | 第11-13页 |
0.3 本论文的研究现状与意义 | 第13-16页 |
第一章 红外固体样品自动研磨仪以及红外液体样品池装置 | 第16-22页 |
1.1 一体化红外液体样品池装置 | 第16-17页 |
1.2 连续进样式红外液体样品池装置 | 第17-19页 |
1.3 自动研磨压片机 | 第19-22页 |
第二章 分子模拟手段在结构检测中的应用 | 第22-42页 |
2.1 量子化学计算 | 第22-29页 |
2.1.1 结构优化 | 第22-25页 |
2.1.2 简正模式的频率计算和指认 | 第25-27页 |
2.1.3 非谐性频率计算 | 第27-29页 |
2.2 分子动力学模拟 | 第29-34页 |
2.2.1 分子力学力场 | 第29-30页 |
2.2.2 GROMACS分子动力学模拟 | 第30-32页 |
2.2.3 NAMD分子动力学模拟 | 第32-34页 |
2.2.4 DSSP分析 | 第34页 |
2.3 VMD软件在蛋白质结构检测中的应用 | 第34-42页 |
2.3.1 VMD软件简介 | 第35-39页 |
2.3.2 蛋白质动态结构统计信息 | 第39-42页 |
第三章 多肽中酰胺-Ⅰ带的非谐性振动 | 第42-52页 |
3.1 计算方法与实验 | 第42-43页 |
3.1.1 分子动力学模拟 | 第42-43页 |
3.1.2 量子化学计算 | 第43页 |
3.2 结果与讨论 | 第43-51页 |
3.2.1 势能分布分析(PED)与一维红外光谱分析 | 第43-46页 |
3.2.3 非谐性常数分析 | 第46-47页 |
3.2.4 2D IR点光谱模拟 | 第47-51页 |
3.3 本章小结 | 第51-52页 |
第四章 Aβ(25-35)片段与石墨烯以及氧化石墨烯的相互作用 | 第52-60页 |
4.1 分子动力学模拟 | 第53-54页 |
4.2 结果及讨论 | 第54-58页 |
4.2.1 Aβ(25-35)片段的动态过程 | 第54-56页 |
4.2.2 Aβ(25-35)片段的结构变化 | 第56-58页 |
4.3 本章小结 | 第58-60页 |
第五章 炔基修饰的丙氨酸二肽的红外光谱模拟 | 第60-64页 |
5.1 计算方法与实验 | 第60-61页 |
5.1.1 分子动力学模拟 | 第60页 |
5.1.2 量子化学计算 | 第60页 |
5.1.3 PPG dipeptide的静电频率转换图的构建 | 第60-61页 |
5.2 结果与讨论 | 第61-63页 |
5.3 本章小结 | 第63-64页 |
第六章 总结 | 第64-66页 |
参考文献 | 第66-80页 |
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第80-82页 |
致谢 | 第82-84页 |
个人简历 | 第84-88页 |