猪microRNA及其启动子的生物信息学分析
摘要 | 第6-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
文献综述 | 第11-22页 |
第一章 miRNA 的研究进展 | 第11-22页 |
1.1 miRNA 的发现历史及其特征 | 第11-12页 |
1.1.1 miRNA 的发现历史 | 第11-12页 |
1.1.2 miRNA 的特征 | 第12页 |
1.2 miRNA 的起源和功能 | 第12-17页 |
1.2.1 miRNA 的起源与调控 | 第12-15页 |
1.2.2 miRNA 的功能 | 第15-17页 |
1.3 miRNA 的基因组结构和转录 | 第17-19页 |
1.3.1 成簇 miRNA 的功能 | 第17页 |
1.3.2 其它基因转录单元内的 miRNA | 第17-18页 |
1.3.3 miRNA 的转录 | 第18-19页 |
1.4 miRNA 的鉴定方法 | 第19-20页 |
1.4.1 基因芯片技术 | 第19页 |
1.4.2 深度测序 | 第19-20页 |
1.4.3 实时荧光定量 PCR | 第20页 |
1.4.4 计算方法 | 第20页 |
1.5 研究的目的和意义 | 第20-22页 |
实验研究 | 第22-45页 |
第二章 猪 miRNA 的鉴定及其启动子分析 | 第22-45页 |
2.1 材料 | 第22-24页 |
2.1.1 研究起始序列 | 第22页 |
2.1.2 相关软件与系统平台 | 第22-24页 |
2.2 方法与步骤 | 第24-29页 |
2.2.1 猪 miRNA 的预测 | 第24-26页 |
2.2.2 猪 miRNA 的特征分析 | 第26页 |
2.2.3 猪 miRNA 的启动子分析 | 第26-29页 |
2.3 实验结果 | 第29-43页 |
2.3.1 猪新 miRNA | 第29页 |
2.3.2 猪 miRNA 基因特征 | 第29-31页 |
2.3.3 猪 miRNA 基因分布 | 第31-33页 |
2.3.4 猪 miRNA 基因簇 | 第33-37页 |
2.3.5 猪新 miRNA 基因族 | 第37-38页 |
2.3.6 猪 miRNA 的启动子 | 第38-40页 |
2.3.7 猪 miRNA 基因上游的特定序列 | 第40-42页 |
2.3.8 猪 miRNA 基因簇的调控 | 第42-43页 |
2.4 讨论 | 第43-45页 |
总结 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-55页 |
附录 | 第55-67页 |
致谢 | 第67-68页 |
作者简介 | 第68页 |