| 中文摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1. 卵巢功能简介 | 第12-14页 |
| 1.1 卵巢排卵功能 | 第12页 |
| 1.2 卵巢内分泌功能 | 第12-13页 |
| 1.3 卵巢功能的调控 | 第13-14页 |
| 2. 山羊高繁殖力分子遗传研究进展 | 第14-16页 |
| 3. 转录组测序技术 | 第16-17页 |
| 4. 表达谱测序技术 | 第17-18页 |
| 4.1 表达谱定义 | 第17页 |
| 4.2 高通量测序 | 第17-18页 |
| 5. 表达谱测序在动物中的应用 | 第18-19页 |
| 6. 实时荧光定量PCR | 第19-20页 |
| 6.1 实时荧光定量PCR概述 | 第19页 |
| 6.2 实时荧光定量PCR方法 | 第19-20页 |
| 7. PCR-SSCP技术 | 第20页 |
| 8. 实验羊只简介 | 第20-22页 |
| 8.1 大足黑山羊简介 | 第20-21页 |
| 8.2 内蒙古绒山羊简介 | 第21页 |
| 8.3 南江黄羊简介 | 第21-22页 |
| 第二章 引言 | 第22-24页 |
| 第三章 实验材料与方法 | 第24-34页 |
| 1. 实验材料 | 第24-26页 |
| 1.1 实验动物及样本采集 | 第24页 |
| 1.2 主要试剂和实验耗材 | 第24-25页 |
| 1.3 主要仪器设备 | 第25页 |
| 1.4 主要试剂配制 | 第25-26页 |
| 2. 实验方法 | 第26-34页 |
| 2.1 转录组测序与表达谱测序 | 第26页 |
| 2.2 实时荧光定量PCR | 第26-29页 |
| 2.2.1 组织RNA的提取 | 第26-27页 |
| 2.2.2 反转录反应 | 第27-28页 |
| 2.2.3 实时荧光定量PCR | 第28-29页 |
| 2.3 PCR-SSCP多态性分析 | 第29-34页 |
| 2.3.1 基因组DNA的提取 | 第29页 |
| 2.3.2 DNA浓度和纯度的检测 | 第29-30页 |
| 2.3.3 引物的设计合成 | 第30页 |
| 2.3.4 PCR反应条件和反应体系 | 第30-31页 |
| 2.3.5 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第31页 |
| 2.3.6 SSCP结果分析 | 第31-33页 |
| 2.3.7 SSCP与产羔数的相关性分析 | 第33-34页 |
| 第四章 实验结果 | 第34-54页 |
| 1. 转录组测序及其生物信息学分析 | 第34-40页 |
| 1.1 总RNA样品检测 | 第34页 |
| 1.2 测序产量统计 | 第34-35页 |
| 1.3 De novo组装质量统计 | 第35页 |
| 1.4 Unigene注释统计 | 第35-36页 |
| 1.5 基因覆盖度(Coverage) | 第36-37页 |
| 1.6 基因表达量注释 | 第37-38页 |
| 1.7 基因蛋白功能注释 | 第38-40页 |
| 2. 差异表达基因筛选 | 第40-45页 |
| 2.1 基因的表达量与差异基因筛选 | 第40-41页 |
| 2.2 GO显著富集分析 | 第41-43页 |
| 2.3 pathway显著富集分析 | 第43-45页 |
| 3. 实时荧光定量PCR | 第45-48页 |
| 3.1 RNA提取质量检测 | 第45-46页 |
| 3.2 实时荧光定量PCR(real-time PCR)结果 | 第46-47页 |
| 3.3 实时荧光定量PCR数据统计分析 | 第47-48页 |
| 4. PCR-SSCP多态性分析 | 第48-54页 |
| 4.1 基因组DNA提取结果 | 第48-49页 |
| 4.2 PCR扩增结果 | 第49-50页 |
| 4.3 PCR-SSCP分析 | 第50-54页 |
| 4.3.1 Unigene13218 PCR-SSCP分析 | 第50页 |
| 4.3.2 Unigene7507 PCR-SSCP分析 | 第50页 |
| 4.3.3 Unigene286 PCR-SSCP分析 | 第50-54页 |
| 第五章 讨论 | 第54-60页 |
| 1. Unigene表达差异分析 | 第54-56页 |
| 1.1 基因表达量注释 | 第54页 |
| 1.2 差异表达基因的筛选 | 第54-55页 |
| 1.3 差异Unigene的GO和Pathway分析 | 第55-56页 |
| 2. 繁殖相关差异表达基因的筛选 | 第56-57页 |
| 2.1 繁殖相关基因的筛选 | 第56-57页 |
| 2.2 差异表达基因的筛选 | 第57页 |
| 2.3 繁殖相关差异表达基因的筛选 | 第57页 |
| 3. 繁殖相关差异表达基因的PCR-SSCP多态性分析 | 第57-60页 |
| 3.1 Unigene13218的多态性 | 第57-58页 |
| 3.2 Unigene7507的多态性 | 第58页 |
| 3.3 Unigene286的多态性 | 第58-60页 |
| 第六章 结论 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-66页 |
| 附表 | 第66-80页 |
| 致谢 | 第80-82页 |
| 在读期间参与的课题和发表的文章 | 第82页 |
