基于表达序列标签的玉米单核苷酸多态性标记开发
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-22页 |
| 前言 | 第11页 |
| ·分子标记概述 | 第11-14页 |
| ·DNA分子标记的概念 | 第11-12页 |
| ·分子标记的主要类型 | 第12-14页 |
| ·SNP在玉米遗传育种中的应用及研究进展 | 第14-15页 |
| ·构建高密度遗传连锁图谱 | 第14页 |
| ·遗传图谱和物理图谱的整合 | 第14页 |
| ·基因型与表现型关联分析 | 第14-15页 |
| ·种质资源遗传多样性研究和保存 | 第15页 |
| ·物种进化和生物多样性研究 | 第15页 |
| ·SNP位点的生物信息学发掘 | 第15-18页 |
| ·基于EST序列的SNP发掘 | 第16-18页 |
| ·SNP的实验室检测方法 | 第18-20页 |
| ·直接测序 | 第18页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第18页 |
| ·变性高效液相色谱法(DHPLC) | 第18页 |
| ·等位基因特异寡核苷酸片段分析(ASO) | 第18-19页 |
| ·TaqMan技术 | 第19页 |
| ·基因芯片技术 | 第19页 |
| ·高分辨率溶解(HRM) | 第19-20页 |
| ·现有的SNP数据库 | 第20页 |
| ·研究目的及方法 | 第20-22页 |
| 2 材料和方法 | 第22-39页 |
| ·本地化数据分析系统的构建 | 第22-29页 |
| ·实用数据提取系统的构建 | 第22-24页 |
| ·本地化序列比对系统的构建 | 第24-27页 |
| ·SNP分子标记开发系统的构建 | 第27-29页 |
| ·SNP分子标记的开发 | 第29-33页 |
| ·原始数据来源 | 第29页 |
| ·EST序列前期处理 | 第29页 |
| ·与CDS同源的EST序列聚类 | 第29-30页 |
| ·EST序列拼接与SNP位点发掘 | 第30-31页 |
| ·保守序列的获取及引物设计 | 第31页 |
| ·电子PCR及引物筛选 | 第31页 |
| ·多态性信息含量计算 | 第31-32页 |
| ·SNP分子标记数据库建立 | 第32页 |
| ·供验证SNP分子标记挑选 | 第32-33页 |
| ·SNP分子标记的验证 | 第33-39页 |
| ·玉米材料 | 第33-35页 |
| ·实验仪器 | 第35页 |
| ·玉米基因组DNA的提取及检测 | 第35-37页 |
| ·SNP分子标记验证—HRM技术 | 第37-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-53页 |
| ·SNP分子标记开发 | 第39-41页 |
| ·SNP标记及其数据结构 | 第39页 |
| ·SNP标记在染色体上的分布 | 第39-41页 |
| ·SNP位点的多态性信息含量 | 第41页 |
| ·SNP分子标记验证 | 第41-53页 |
| ·高分辨率熔解曲线 | 第41-47页 |
| ·自交系间SNP分型 | 第47-53页 |
| 4 讨论 | 第53-59页 |
| ·SNP的高多态性及适应性 | 第53页 |
| ·本地化数据分析系统构建的必要性 | 第53-54页 |
| ·EST序列质量控制 | 第54页 |
| ·EST-SNP位点发掘 | 第54-55页 |
| ·SNP位点的多态信息含量 | 第55页 |
| ·高分辨率熔解技术用于SNP检测的优势 | 第55-56页 |
| ·PCR引物质量与特异性 | 第56页 |
| ·SNP分型 | 第56-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
