| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第11-34页 |
| 1.1 中度嗜盐菌的研究进展 | 第11-18页 |
| 1.1.1 中度嗜盐菌的概念和分类 | 第11页 |
| 1.1.2 中度嗜盐菌的生态环境 | 第11-12页 |
| 1.1.3 中度嗜盐菌的形态和生理学多样性 | 第12-13页 |
| 1.1.4 中度嗜盐菌的生理特性 | 第13-18页 |
| 1.2 中度嗜盐菌渗透压适应机制研究进展 | 第18-27页 |
| 1.2.1 中度嗜盐菌应对盐胁迫渗透压的机制 | 第18-19页 |
| 1.2.2 相容性溶质简介 | 第19-27页 |
| 1.3 中度嗜盐菌主要相容性溶质的合成代谢及其调控机理研究进展 | 第27-33页 |
| 1.3.1 甘氨酸甜菜碱 | 第28-29页 |
| 1.3.2 四氢嘧啶 | 第29-31页 |
| 1.3.3 谷氨酸 | 第31-32页 |
| 1.3.4 脯氨酸 | 第32-33页 |
| 1.4 立题依据和研究意义 | 第33-34页 |
| 第二章 材料与方法 | 第34-44页 |
| 2.1 试验材料 | 第34-35页 |
| 2.1.1 菌株 | 第34页 |
| 2.1.2 培养基 | 第34页 |
| 2.1.3 主要生化试剂(盒) | 第34-35页 |
| 2.2 试验方法 | 第35-44页 |
| 2.2.1 菌株培养方法 | 第35页 |
| 2.2.2 形态特征试验 | 第35-36页 |
| 2.2.3 生理特征试验 | 第36-38页 |
| 2.2.4 生化特征鉴定 | 第38页 |
| 2.2.5 核酸特征鉴定 | 第38-39页 |
| 2.2.6 生长曲线测定 | 第39-40页 |
| 2.2.7 细胞内K~+和Na~+含量的测定 | 第40页 |
| 2.2.8 细胞内相容性溶质含量的测定 | 第40-41页 |
| 2.2.9 基因组测序及分析 | 第41-42页 |
| 2.2.10 转录组测序及分析 | 第42-43页 |
| 2.2.11 实时定量PCR验证 | 第43-44页 |
| 第三章 黄河盐单胞菌新种的鉴定 | 第44-58页 |
| 3.1 引言 | 第44页 |
| 3.2 菌落形态鉴定结果 | 第44-46页 |
| 3.3 生理鉴定结果 | 第46-50页 |
| 3.3.1 温度、需氧性、pH及耐盐度鉴定结果 | 第46页 |
| 3.3.2 菌株BJGMM-B45~T对碳源的利用结果 | 第46-49页 |
| 3.3.3 抗菌药物敏感试验结果 | 第49-50页 |
| 3.4 生化鉴定结果 | 第50-54页 |
| 3.4.1 酶活性分析 | 第50-51页 |
| 3.4.2 醌组分分析结果 | 第51页 |
| 3.4.3 磷酸类脂分析结果 | 第51-52页 |
| 3.4.4 细胞壁化学成分分析结果 | 第52-54页 |
| 3.5 16S rRNA序列分析及DNA-DNA杂交同源性测定结果 | 第54-55页 |
| 3.6 菌株BJGMM-B45~T鉴定结果总结 | 第55-57页 |
| 3.7 本章小结 | 第57-58页 |
| 第四章 黄河盐单胞菌BJGMM-B45~T盐适应机制的生理学分析 | 第58-64页 |
| 4.1 引言 | 第58页 |
| 4.2 BJGMM-B45~T在不同盐浓度培养基中的生长情况 | 第58-59页 |
| 4.3 BJGMM-B45~T在不同盐浓度下胞内K~+、Na~+浓度分析 | 第59-60页 |
| 4.4 BJGMM-B45~T在不同盐浓度下积累的相容性溶质结果分析 | 第60-61页 |
| 4.5 讨论 | 第61-63页 |
| 4.6 本章小结 | 第63-64页 |
| 第五章 黄河盐单胞菌全基因组序列分析 | 第64-82页 |
| 5.1 引言 | 第64页 |
| 5.2 黄河盐单胞菌的全基因组数据分析 | 第64-67页 |
| 5.2.1 黄河盐单胞菌的全基因组概貌 | 第64-65页 |
| 5.2.2 编码基因的COG功能分类 | 第65-66页 |
| 5.2.3 “基因岛”预测 | 第66-67页 |
| 5.3 黄河盐单胞菌的代谢特征 | 第67-70页 |
| 5.3.1 黄河盐单胞菌的代谢概况 | 第67-68页 |
| 5.3.2 与盐胁迫有关的代谢通路 | 第68-70页 |
| 5.4 相容性溶质合成的相关基因鉴定及进化分析 | 第70-79页 |
| 5.4.1 相容性溶质的合成相关基因鉴定 | 第70-72页 |
| 5.4.2 相容性溶质合成相关基因的系统发育分析 | 第72-78页 |
| 5.4.3 相容性溶质合成相关基因的共线性分析 | 第78-79页 |
| 5.5 讨论 | 第79-80页 |
| 5.6 本章小结 | 第80-82页 |
| 第六章 黄河盐单胞菌在不同盐浓度下的转录组分析 | 第82-102页 |
| 6.1 引言 | 第82页 |
| 6.2 转录组测序概况 | 第82-84页 |
| 6.3 差异表达分析 | 第84-87页 |
| 6.3.1 GO功能富集分析 | 第84-85页 |
| 6.3.2 KEGG通路富集分析 | 第85-87页 |
| 6.4 黄河盐单胞菌BJGMM-B45~T盐胁迫下的基因表达差异 | 第87-89页 |
| 6.4.1 黄河盐单胞菌在不同盐浓度下表达上调的基因 | 第87页 |
| 6.4.2 黄河盐单胞菌在不同盐浓度下表达下调的基因 | 第87-88页 |
| 6.4.3 黄河盐单胞菌在不同盐浓度下的代谢变化 | 第88-89页 |
| 6.5 与胞内Na~+输出和K~+积累有关的基因表达差异分析 | 第89-92页 |
| 6.5.1 与胞内Na~+输出有关的基因表达差异 | 第89-91页 |
| 6.5.2 与胞内K~+积累有关的基因表达差异 | 第91-92页 |
| 6.6 与相容性溶质有关的转录数据分析及实时定量PCR验证 | 第92-97页 |
| 6.6.1 与四氢嘧啶合成及代谢相关基因的表达差异 | 第92-93页 |
| 6.6.2 与甘氨酸甜菜碱合成及转运相关基因的表达差异 | 第93-95页 |
| 6.6.3 与谷氨酸和脯氨酸合成及转运相关基因的表达差异 | 第95-97页 |
| 6.7 讨论 | 第97-101页 |
| 6.7.1 三个盐浓度下的差异表达概况 | 第97-98页 |
| 6.7.2 Na~+输出和K~+积累 | 第98-99页 |
| 6.7.3 谷氨酸的合成与转运 | 第99页 |
| 6.7.4 四氢嘧啶的合成 | 第99页 |
| 6.7.5 甘氨酸甜菜碱 | 第99-100页 |
| 6.7.6 脯氨酸 | 第100-101页 |
| 6.8 本章小结 | 第101-102页 |
| 第七章 全文讨论与结论 | 第102-105页 |
| 7.1 讨论 | 第102-103页 |
| 7.2 全文结论 | 第103-105页 |
| 参考文献 | 第105-121页 |
| 附录 | 第121-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |
| 个人简介 | 第133-134页 |
