致谢 | 第4-5页 |
摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6页 |
主要符号说明 | 第8-12页 |
1 引言 | 第12-24页 |
1.1 植物衰老的遗传研究 | 第12-13页 |
1.1.1 衰老中DNA、RNA的变化 | 第12-13页 |
1.1.2 蛋白质合成调节 | 第13页 |
1.2 果实成熟衰老变化 | 第13-16页 |
1.2.1 果实色泽变化 | 第13-14页 |
1.2.2 果实风味变化 | 第14页 |
1.2.3 果实软化 | 第14-15页 |
1.2.4 果实衰老与呼吸 | 第15页 |
1.2.5 果实成熟与乙烯 | 第15-16页 |
1.3 植物蛋白质组学的研究 | 第16-18页 |
1.3.1 果实成熟衰老过程中蛋白质组学的研究 | 第17-18页 |
1.3.2 果实采后病理学中蛋白质组学的研究 | 第18页 |
1.4 蛋白质组学的主要研究技术 | 第18-22页 |
1.4.1 双向凝胶电泳 | 第18-19页 |
1.4.2 质谱鉴定 | 第19页 |
1.4.3 基于质谱检测的iTRAQ技术 | 第19-22页 |
1.4.4 蛋白质组学与生物信息学 | 第22页 |
1.5 本研究的意义与内容 | 第22-24页 |
2 实验方法 | 第24-30页 |
2.1 实验材料 | 第24页 |
2.2 实验试剂与仪器 | 第24页 |
2.3 实验方法 | 第24-26页 |
2.3.1 草莓果实蛋白质提取 | 第24-25页 |
2.3.2 胰蛋白酶的消化与iTRAQ标记 | 第25页 |
2.3.3 高效液相色谱分馏 | 第25页 |
2.3.4 LC-MS/MS分析样品 | 第25-26页 |
2.4 生物信息学分析 | 第26-30页 |
2.4.1 MS/MS数据分析及数据库检索 | 第26页 |
2.4.2 质量评估 | 第26-27页 |
2.4.3 蛋白质组注释 | 第27-28页 |
2.4.4 蛋白质相对定量 | 第28页 |
2.4.5 差异表达蛋白GO/结构域/KEGG Pathway富集分析 | 第28-29页 |
2.4.6 聚类分析 | 第29-30页 |
3 结果与分析 | 第30-67页 |
3.1 草莓蛋白质组信息统计 | 第30-32页 |
3.1.1 MS/MS数据质量控制验证 | 第30页 |
3.1.2 蛋白质组鉴定信息 | 第30-32页 |
3.2 蛋白质组注释 | 第32-37页 |
3.2.1 蛋白质组GO注释 | 第32-33页 |
3.2.2 蛋白质组的亚细胞定位分析 | 第33-35页 |
3.2.3 蛋白质组KEGG Pathway注释分析 | 第35-37页 |
3.3 蛋白质相对定量分析 | 第37-38页 |
3.4 差异表达蛋白GO二级分类分析 | 第38-41页 |
3.5 差异表达蛋白亚细胞定位分析 | 第41-43页 |
3.6 差异表达蛋白GO富集分析 | 第43-52页 |
3.7 差异表达蛋白结构域富集分析 | 第52-57页 |
3.8 差异表达蛋白Pathway富集分析 | 第57-62页 |
3.9 聚类分析 | 第62-67页 |
3.9.1 显著富集的GO功能类别聚类分析 | 第62-64页 |
3.9.2 显著富集的结构域和代谢途径聚类分析 | 第64-67页 |
4 结论 | 第67-69页 |
展望 | 第69-70页 |
参考文献 | 第70-75页 |
作者简历 | 第75页 |