| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4页 |
| 引言 | 第7-9页 |
| 第1章 Janibacter YFY001的分离和鉴定 | 第9-18页 |
| 1 前言 | 第9页 |
| 2 材料和方法 | 第9-11页 |
| 2.1 材料 | 第9-10页 |
| 2.2 方法 | 第10页 |
| 2.3 细菌鉴定过程 | 第10-11页 |
| 3 结果 | 第11-15页 |
| 3.1 病例资料 | 第11页 |
| 3.2 菌株鉴定及药敏实验 | 第11-15页 |
| 3.3 Janibacter临床分离株的进化分析 | 第15页 |
| 4 讨论 | 第15-18页 |
| 第2章 临床分离Janibacter的全基因组测序 | 第18-31页 |
| 1. 前言 | 第18页 |
| 2. 材料和方法 | 第18-20页 |
| 2.1 材料 | 第18页 |
| 2.2 方法 | 第18-19页 |
| 2.3 测序策略 | 第19-20页 |
| 3. 结果 | 第20-29页 |
| 3.1 基因组抽提质量验证 | 第20-21页 |
| 3.2 Janibacter YFY001全基因组测序质量及结果 | 第21-23页 |
| 3.3 序列拼装结果 | 第23-25页 |
| 3.4 Janibacter YFY001基因组注释结果 | 第25页 |
| 3.5 Janibacter YFY001基因功能分析 | 第25-29页 |
| 4 讨论 | 第29-31页 |
| 第3章 Janibacter strain YFY001株比较基因组分析 | 第31-36页 |
| 1. 前言 | 第31页 |
| 2. 材料和方法 | 第31页 |
| 2.1 基因组信息 | 第31页 |
| 2.2 生物信息学分析软件 | 第31页 |
| 3. 结果 | 第31-34页 |
| 3.1 比较基因组菌株概述 | 第31-32页 |
| 3.2 Janibacter比较基因组分析 | 第32-34页 |
| 4. 讨论 | 第34-36页 |
| 全文总结 | 第36-37页 |
| 致谢 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-41页 |
| 附录 | 第41-60页 |
| 综述 微生物基因组及基因组测序技术研究进展 | 第60-72页 |
| 参考文献 | 第71-72页 |
